[发明专利]一套用于检测雪茄烟资源的KASP引物组及其应用有效
申请号: | 202010196452.7 | 申请日: | 2020-03-19 |
公开(公告)号: | CN111349713B | 公开(公告)日: | 2022-10-04 |
发明(设计)人: | 刘国祥;吕洪坤;张兴伟;李媛;向小华;刘好宝;戴培刚;佟英;杨爱国;冯全福 | 申请(专利权)人: | 中国烟草总公司海南省公司 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 北京高沃律师事务所 11569 | 代理人: | 吕纪涛 |
地址: | 571100 海南*** | 国省代码: | 海南;46 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一套 用于 检测 雪茄烟 资源 kasp 引物 及其 应用 | ||
1.一套用于检测雪茄烟资源的SNP标记的KASP引物组,其特征在于,扩增所述SNP标记的KASP引物的核苷酸序列如SEQ ID No.1~144所示;
SEQ ID No.1~3扩增CigarSNP01-1;
SEQ ID No.4~6扩增CigarSNP01-2;
SEQ ID No.7~9扩增CigarSNP02-1;
SEQ ID No.10~12扩增CigarSNP02-2;
SEQ ID No.13~15扩增CigarSNP03-1;
SEQ ID No.16~18扩增CigarSNP03-2;
SEQ ID No.19~21扩增CigarSNP04-1;
SEQ ID No.22~24扩增CigarSNP04-2;
SEQ ID No.25~27扩增CigarSNP05-1;
SEQ ID No.28~30扩增CigarSNP06-1;
SEQ ID No.31~33扩增CigarSNP06-2;
SEQ ID No.34~36扩增CigarSNP07-1;
SEQ ID No.37~39扩增CigarSNP07-2;
SEQ ID No.40~42扩增CigarSNP08-1;
SEQ ID No.43~45扩增CigarSNP09-1;
SEQ ID No.46~48扩增CigarSNP09-2;
SEQ ID No.49~51扩增CigarSNP10-1;
SEQ ID No.52~54扩增CigarSNP10-2;
SEQ ID No.55~57扩增CigarSNP11-1;
SEQ ID No.58~60扩增CigarSNP11-2;
SEQ ID No.61~63扩增CigarSNP11-3;
SEQ ID No.64~66扩增CigarSNP12-1;
SEQ ID No.67~69扩增CigarSNP12-2;
SEQ ID No.70~72扩增CigarSNP12-3;
SEQ ID No.73~75扩增CigarSNP13-1;
SEQ ID No.76~78扩增CigarSNP13-2;
SEQ ID No.79~81扩增CigarSNP14-1;
SEQ ID No.82~84扩增CigarSNP15-1;
SEQ ID No.85~87扩增CigarSNP15-2;
SEQ ID No.88~90扩增CigarSNP16-1;
SEQ ID No.91~93扩增CigarSNP16-2;
SEQ ID No.94~96扩增CigarSNP17-1;
SEQ ID No.97~99扩增CigarSNP17-2;
SEQ ID No.100~102扩增CigarSNP18-1;
SEQ ID No.103~105扩增CigarSNP18-2;
SEQ ID No.106~108扩增CigarSNP19-1;
SEQ ID No.109~111扩增CigarSNP19-2;
SEQ ID No.112~114扩增CigarSNP20-1;
SEQ ID No.115~117扩增CigarSNP20-2;
SEQ ID No.118~120扩增CigarSNP20-3;
SEQ ID No.121~123扩增CigarSNP21-1;
SEQ ID No.124~126扩增CigarSNP22-1;
SEQ ID No.127~129扩增CigarSNP22-2;
SEQ ID No.130~132扩增CigarSNP23-1;
SEQ ID No.133~135扩增CigarSNP23-2;
SEQ ID No.136~138扩增CigarSNP23-3;
SEQ ID No.139~141扩增CigarSNP24-1;
SEQ ID No.142~144扩增CigarSNP24-2;
所述SNP标记包括CigarSNP01-1、CigarSNP01-2、CigarSNP02-1、CigarSNP02-2、CigarSNP03-1、CigarSNP03-2、CigarSNP04-1、CigarSNP04-2、CigarSNP05-1、CigarSNP06-1、CigarSNP06-2、CigarSNP07-1、CigarSNP07-2、CigarSNP08-1、CigarSNP09-1、CigarSNP09-2、CigarSNP10-1、CigarSNP10-2、CigarSNP11-1、CigarSNP11-2、CigarSNP11-3、CigarSNP12-1、CigarSNP12-2、CigarSNP12-3、CigarSNP13-1、CigarSNP13-2、CigarSNP14-1、CigarSNP15-1、CigarSNP15-2、CigarSNP16-1、CigarSNP16-2、CigarSNP17-1、CigarSNP17-2、CigarSNP18-1、CigarSNP18-2、CigarSNP19-1、CigarSNP19-2、CigarSNP20-1、CigarSNP20-2、CigarSNP20-3、CigarSNP21-1、CigarSNP22-1、CigarSNP22-2、CigarSNP23-1、CigarSNP23-2、CigarSNP23-3、CigarSNP24-1和CigarSNP24-2;
所述CigarSNP01-1位于雪茄的染色体Nt01上,物理位置为20189161,变异位点为A/C;
所述CigarSNP01-2位于雪茄的染色体Nt01上,物理位置为127733497,变异位点为T/C;
所述CigarSNP02-1位于雪茄的染色体Nt02上,物理位置为108245254,变异位点为C/T;
所述CigarSNP02-2位于雪茄的染色体Nt02上,物理位置为87338587,变异位点为G/A;
所述CigarSNP03-1位于雪茄的染色体Nt03上,物理位置为5854407,变异位点为A/G;
所述CigarSNP03-2位于雪茄的染色体Nt03上,物理位置为20901328,变异位点为A/G;
所述CigarSNP04-1位于雪茄的染色体Nt04上,物理位置为101426258,变异位点为C/T;
所述CigarSNP04-2位于雪茄的染色体Nt04上,物理位置为44511003,变异位点为C/G;
所述CigarSNP05-1位于雪茄的染色体Nt05上,物理位置为24187234,变异位点为A/T;
所述CigarSNP06-1位于雪茄的染色体Nt06上,物理位置为20171212,变异位点为C/T;
所述CigarSNP06-2位于雪茄的染色体Nt06上,物理位置为99243063,变异位点为A/G;
所述CigarSNP07-1位于雪茄的染色体Nt07上,物理位置为59134911,变异位点为C/A;
所述CigarSNP07-2位于雪茄的染色体Nt07上,物理位置为91456765,变异位点为A/G;
所述CigarSNP08-1位于雪茄的染色体Nt08上,物理位置为68017703,变异位点为C/T;
所述CigarSNP09-1位于雪茄的染色体Nt09上,物理位置为100690577,变异位点为G/A;
所述CigarSNP09-2位于雪茄的染色体Nt09上,物理位置为96986746,变异位点为A/T;
所述CigarSNP10-1位于雪茄的染色体Nt10上,物理位置为51896682,变异位点为A/G;
所述CigarSNP10-2位于雪茄的染色体Nt10上,物理位置为115185980,变异位点为T/C;
所述CigarSNP11-1位于雪茄的染色体Nt11上,物理位置为66259728,变异位点为T/G;
所述CigarSNP11-2位于雪茄的染色体Nt11上,物理位置为23822295,变异位点为T/C;
所述CigarSNP11-3位于雪茄的染色体Nt11上,物理位置为57168417,变异位点为G/A;
所述CigarSNP12-1位于雪茄的染色体Nt12上,物理位置为125890111,变异位点为T/C;
所述CigarSNP12-2位于雪茄的染色体Nt12上,物理位置为31687315,变异位点为T/C;
所述CigarSNP12-3位于雪茄的染色体Nt12上,物理位置为25943135,变异位点为A/G;
所述CigarSNP13-1位于雪茄的染色体Nt13上,物理位置为86466436,变异位点为T/C;
所述CigarSNP13-2位于雪茄的染色体Nt13上,物理位置为105567504,变异位点为A/G;
所述CigarSNP14-1位于雪茄的染色体Nt14上,物理位置为23358247,变异位点为T/C;
所述CigarSNP15-1位于雪茄的染色体Nt15上,物理位置为86671490,变异位点为A/G;
所述CigarSNP15-2位于雪茄的染色体Nt15上,物理位置为78242076,变异位点为A/G;
所述CigarSNP16-1位于雪茄的染色体Nt16上,物理位置为65433447,变异位点为C/T;
所述CigarSNP16-2位于雪茄的染色体Nt16上,物理位置为9110774,变异位点为C/T;
所述CigarSNP17-1位于雪茄的染色体Nt17上,物理位置为72622941,变异位点为T/C;
所述CigarSNP17-2位于雪茄的染色体Nt17上,物理位置为195888994,变异位点为C/T;
所述CigarSNP18-1位于雪茄的染色体Nt18上,物理位置为10034161,变异位点为T/C;
所述CigarSNP18-2位于雪茄的染色体Nt18上,物理位置为61973096,变异位点为C/T;
所述CigarSNP19-1位于雪茄的染色体Nt19上,物理位置为137571210,变异位点为T/C;
所述CigarSNP19-2位于雪茄的染色体Nt19上,物理位置为22172908,变异位点为T/C;
所述CigarSNP20-1位于雪茄的染色体Nt20上,物理位置为47926589,变异位点为C/A;
所述CigarSNP20-2位于雪茄的染色体Nt20上,物理位置为72837945,变异位点为T/G;
所述CigarSNP20-3位于雪茄的染色体Nt20上,物理位置为31675895,变异位点为A/G;
所述CigarSNP21-1位于雪茄的染色体Nt21上,物理位置为27200249,变异位点为T/G;
所述CigarSNP22-1位于雪茄的染色体Nt22上,物理位置为166,变异位点为T/A;
所述CigarSNP22-2位于雪茄的染色体Nt22上,物理位置为83063701,变异位点为A/T;
所述CigarSNP23-1位于雪茄的染色体Nt23上,物理位置为42324361,变异位点为G/A;
所述CigarSNP23-2位于雪茄的染色体Nt23上,物理位置为41108155,变异位点为T/C;
所述CigarSNP23-3位于雪茄的染色体Nt23上,物理位置为63738673,变异位点为T/C;
所述CigarSNP24-1位于雪茄的染色体Nt24上,物理位置为20135887,变异位点为A/G;
所述CigarSNP24-2位于雪茄的染色体Nt24上,物理位置为11946597,变异位点为A/G。
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