[发明专利]一种提高中国和牛里脊重量的方法

说明书

本发明提供了一种提高中国和牛里脊重量的方法，采用的SNP标记的位点为国际牛参考基因组UMD3.1版本22号染色体上第54648801个核苷酸位点，该位点的碱基是C或A。本发明通过优选该SNP的优势等位基因，能够逐代增加优势等位基因频率，提高中国和牛的里脊重量，加快牛遗传改良进展从而有效提高肉牛育种的经济效益。

技术领域

本发明涉及中国和牛染色体基因位点与相关性状分析，具体涉及中国和牛染色体上与里脊重量相关的SNP位点及其应用。

背景技术

肉牛业是我国畜牧业的重要组成部分，其发展水平是国家农业发展水平的重要标志，对我国菜篮子工程建设、增加农民收入、保障人民肉食消费安全和社会稳定具有重大意义。生产效率方面，美国及加拿大等肉牛业发达国家的肉牛平均胴体重达340千克以上，多在15-18月龄屠宰，而我国只有154千克，屠宰时间为18-24月龄，可见我国肉牛生产效率远远低于发达国家。中国和牛是和牛与复州牛的杂交后代，复州牛是中国辽宁省的当代品种，旨在生产高档牛肉，生产定位为高档收入群体。为加速我国肉牛分子育种进程，采用全基因组关联分析鉴定影响中国和牛的里脊重量性状的显著位点。有研究表明，里脊重量属于中等遗传力性状，约0.39，因此，利用遗传手段对资源群体中国和牛里脊重量进行改良是可行的。里脊重量是受多个基因控制的数量性状，牛基因组上存在大量影响里脊重量的数量性状基因座(quantitative trait loci,QTLs)。目前，利用全基因组关联分析(genome-wideassociation study,GWAS)的方法已在牛基因组上鉴别到超过诸多与里脊重量相关的QTLs和大量单核苷酸多态位点(single nucleotide polymorphisms,SNPs)，将其中具有显著效应的SNP加入到分子标记辅助选择(marker assisted selection,MAS)、基因组选择(Genomic selection，GS)中则能显著提高里脊重量的遗传改良进展，进而提高后代肉牛里脊重量，提高牛肉产量，增强养殖企业商品牛肉生产的市场竞争力。

发明内容

本发明本发明的目的在于提供一种牛的遗传改良的方法。通过GWAS分析策略鉴别到了影响中国和牛里脊重量的显著SNP，将其用于分子标记辅助选择和基因组选择中，选择对提高里脊重量有利的基因型进行留种，从而逐代提高优势等位基因的基因频率，则能加快种牛育种改良的进程，为肉牛养殖带来巨大经济效益。

本发明是这样实现的：

所述方法包括：确定种牛资源群体中的种牛的上述的影响牛里脊重量的分子标记的位点，并根据所述分子标记做出相应的选择：在所述种牛资源群体中选择国际牛参考基因组UMD3.1版本22号染色体上第54648801位点为CC和CA、AA基因型的种牛个体，淘汰在第54648801该位点为CC基因型的牛个体，以逐代提高该位点的等位基因A的频率，从而提高后代牛的里脊重量。

具体包括以下步骤：

(1)提取待测牛的基因组DNA；

(2)采用权利要求3所述的引物对，将所述待测牛的基因组DNA进行PCR扩增，以便获得PCR扩增产物；

(3)对所述PCR扩增产物进行测序，以便获得测序结果；

(4)基于所述测序结果，确定所述待测牛的如权利要求1或2所述的SNP标记的基因型。

本发明相对于现有技术具有如下的优点及效果：

本发明研究并确定与牛里脊重量相关的分子标记，验证其对里脊重量的影响效应，最终建立高效准确的基因组选择育种技术，将其应用于种牛提高里脊重量的遗传改良中，从而提高后代牛的里脊重量，提高产肉量，进而增加养殖企业市场竞争力。

附图说明

图1为中国和牛在22号染色体上关于里脊重量的全基因组关联分析(GWAS)曼哈顿图；其中：横坐标表示牛的染色体编号(bp)；纵坐标表示-logP值。