[发明专利]基于病理组织的二联综合肿瘤分析系统和应用

权利要求书

1.一种计算机系统，包括处理器和存储计算机可执行代码的存储设备，其中当在所述处理器处执行时，所述计算机可执行代码配置为：

基于来自患者肿瘤组织样品的下述数据提供针对所述患者的预后评估结果和/或治疗方案的选择：i)染色质结构分型数据和DNA倍性数据，或ii)染色质结构分型数据和肿瘤间质比数据，

其中对于实体瘤如结直肠癌，二倍体计0分，非二倍体计1分，染色质同质计0分，染色质异质计1分，低间质比计0分，高间质比计1分，其中：

1)将总分为0判定为低风险，总分为1判定为中风险，总分为2判定为高风险；和/或

2)其中将总分为0的患者判定为适合术后单纯观察的患者，总分为2的患者判定为适合联合化疗的患者。

2.权利要求1所述的计算机系统，其中：

1)来自患者肿瘤组织样品的DNA倍性数据包括将肿瘤组织中DNA倍性判定为二倍体或非二倍体，其可以通过基于病理切片通过例如显微镜观察判定，单细胞吸光度或荧光计数判定，流式细胞计数法判定，或通过计算机图像分析判定，优选例如通过基于自动图像识别的DNA倍性进行判定，和/或

2)来自患者肿瘤组织样品的染色质结构分型数据包括将肿瘤组织中染色质模式判定为染色质同质或染色质异质，其可以基于病理切片通过例如显微镜观察判定或通过计算机图像分析判定，优选例如通过基于自动图像识别的染色质结构分型进行判定。

3.权利要求1或2所述的计算机系统，其中来自患者肿瘤组织样品的肿瘤间质比数据包括将肿瘤组织中的间质成分所占比例判定为低间质比或高间质比，其可以基于病理切片通过例如显微镜观察判定或通过计算机图像分析判定，优选例如通过基于自动图像识别的间质比进行判定。

4.权利要求1-3任一项所述的计算机系统，其中所述肿瘤为实体瘤，包括例如结直肠癌。

5.权利要求4所述的计算机系统，其中所述肿瘤为结直肠癌，包括例如术后结直肠癌，例如TNM分期中任一期结直肠癌，包括例如0期，I期，II期(包括IIA、IIB、IIC期)，优选为II期结直肠癌。

6.权利要求1-5任一项所述的计算机系统，其中：

1)通过计算机图像分析例如DNA倍性将肿瘤组织判定为二倍体或非二倍体，例如根据DNA倍性分析软件计算的细胞核累积光密度值判定为二倍体或非二倍体；和/或

2)通过计算机图像分析例如染色质结构分型分析软件将肿瘤组织中染色质模式判定为染色质同质或染色质异质，例如按照适当阈值，例如染色质结构分型分析软件计算为0.044的阈值判定为染色质同质(CHO，≥0.044)或染色质异质(CHE，＜0.044)。

7.权利要求1-6任一项所述的计算机系统，其中通过计算机图像分析例如间影通分析软件将肿瘤组织中的间质成分所占比例判定为低间质比或高间质比，例如按照适当阈值，例如50％的阈值，分为低间质比组(≤50％)和高间质比组(＞50％)。

8.一种计算机可读介质，其上存储有指令，在所述指令由处理器执行时，使所述处理器执行权利要求1-7任一项中定义的计算机可执行代码。

9.用于测定来自患者肿瘤组织样品的下述数据的试剂在制备提供针对所述患者的预后评估结果和/或治疗方案的选择的试剂盒中的用途：i)染色质结构分型数据和DNA倍性数据，或ii)染色质结构分型数据和肿瘤间质比数据，其中所述肿瘤为实体瘤，包括例如结直肠癌。