[发明专利]一种薏苡Waxy基因突变的PCR检测引物及其应用在审
申请号: | 202010207638.8 | 申请日: | 2020-03-23 |
公开(公告)号: | CN111197106A | 公开(公告)日: | 2020-05-26 |
发明(设计)人: | 李祥栋;潘虹;魏心元;陆秀娟 | 申请(专利权)人: | 贵州黔西南喀斯特区域发展研究院 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 贵州派腾知识产权代理有限公司 52114 | 代理人: | 周黎亚 |
地址: | 562400 贵州省黔西*** | 国省代码: | 贵州;52 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 薏苡 waxy 基因突变 pcr 检测 引物 及其 应用 | ||
1.一种薏苡Waxy基因突变的PCR检测引物,其特征在于,其特征在于,所述检测引物包括:
PCR正向引物:5’-GGACGTCAGCGAGTGGGACC-3’,结合区域为第9外显子保守区;
PCR反向引物:5’-ACGAGTCCACCGGTGGACGC-3’,结合区域为第11外显子保守区。
2.一种如权利要求1所述的薏苡Waxy基因突变的PCR检测引物在薏苡选育中的应用,其特征在于,用于薏苡单株粳、糯性分型。
3.如权利要求2所述的应用,其特征在于,包括以下步骤:
(1)田间种植与留苗:选取成熟饱满的薏苡籽粒,采用直播法进行播种,行距40~80cm、株距10~50cm,播种量1~10粒/窝以保证出苗率,3~6叶期定苗、留苗;
(2)薏苡Waxy基因分型:在薏苡苗期,取少量薏苡叶片提取薏苡基因组DNA,以提取的薏苡基因组DNA为模板,采用PCR检测引物进行特异性PCR扩增反应;扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳分型检测;
(3)株系选择:根据凝胶电泳分型结果,淘汰杂合体单株,保留纯合体单株。
4.如权利要求3所述的应用,其特征在于,所述PCR扩增反应体系为:总体积25μL,包含Taq PCR MasterMix 12.5μL,10μM PCR正向引物1μL,10μM PCR反向引物1μL,ddH2O 9.5μL,模板DNA30~50μg。
5.如权利要求3所述的应用,其特征在于,PCR扩增反应程序的退火温度为65~69.7℃。
6.如权利要求3所述的应用,其特征在于,PCR扩增反应程序为:94℃预变性3min,94℃变性50s,67℃退火50s,72℃延伸5min,32个循环,最后72℃延伸10min,12℃保存。
7.如权利要求3所述的应用,其特征在于,所述PCR扩增产物采用0.8%~1.5%的琼脂糖凝胶电泳检测,纯合粳性单株只扩增出850bp条带,杂合粳性单株同时扩增出850bp和550bp条带,纯合糯性植株只扩增出550bp条带。
8.如权利要求7所述的应用,其特征在于,所述PCR扩增产物采用1.0%的琼脂糖凝胶电泳检测。
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