[发明专利]一种薏苡Waxy基因突变的PCR检测引物及其应用在审

专利信息
申请号: 202010207638.8 申请日: 2020-03-23
公开(公告)号: CN111197106A 公开(公告)日: 2020-05-26
发明(设计)人: 李祥栋;潘虹;魏心元;陆秀娟 申请(专利权)人: 贵州黔西南喀斯特区域发展研究院
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11
代理公司: 贵州派腾知识产权代理有限公司 52114 代理人: 周黎亚
地址: 562400 贵州省黔西*** 国省代码: 贵州;52
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摘要:
搜索关键词: 一种 薏苡 waxy 基因突变 pcr 检测 引物 及其 应用
【权利要求书】:

1.一种薏苡Waxy基因突变的PCR检测引物,其特征在于,其特征在于,所述检测引物包括:

PCR正向引物:5’-GGACGTCAGCGAGTGGGACC-3’,结合区域为第9外显子保守区;

PCR反向引物:5’-ACGAGTCCACCGGTGGACGC-3’,结合区域为第11外显子保守区。

2.一种如权利要求1所述的薏苡Waxy基因突变的PCR检测引物在薏苡选育中的应用,其特征在于,用于薏苡单株粳、糯性分型。

3.如权利要求2所述的应用,其特征在于,包括以下步骤:

(1)田间种植与留苗:选取成熟饱满的薏苡籽粒,采用直播法进行播种,行距40~80cm、株距10~50cm,播种量1~10粒/窝以保证出苗率,3~6叶期定苗、留苗;

(2)薏苡Waxy基因分型:在薏苡苗期,取少量薏苡叶片提取薏苡基因组DNA,以提取的薏苡基因组DNA为模板,采用PCR检测引物进行特异性PCR扩增反应;扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳分型检测;

(3)株系选择:根据凝胶电泳分型结果,淘汰杂合体单株,保留纯合体单株。

4.如权利要求3所述的应用,其特征在于,所述PCR扩增反应体系为:总体积25μL,包含Taq PCR MasterMix 12.5μL,10μM PCR正向引物1μL,10μM PCR反向引物1μL,ddH2O 9.5μL,模板DNA30~50μg。

5.如权利要求3所述的应用,其特征在于,PCR扩增反应程序的退火温度为65~69.7℃。

6.如权利要求3所述的应用,其特征在于,PCR扩增反应程序为:94℃预变性3min,94℃变性50s,67℃退火50s,72℃延伸5min,32个循环,最后72℃延伸10min,12℃保存。

7.如权利要求3所述的应用,其特征在于,所述PCR扩增产物采用0.8%~1.5%的琼脂糖凝胶电泳检测,纯合粳性单株只扩增出850bp条带,杂合粳性单株同时扩增出850bp和550bp条带,纯合糯性植株只扩增出550bp条带。

8.如权利要求7所述的应用,其特征在于,所述PCR扩增产物采用1.0%的琼脂糖凝胶电泳检测。

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