[发明专利]苔草分子鉴定的SSR引物及应用有效
申请号: | 202010212013.0 | 申请日: | 2020-03-24 |
公开(公告)号: | CN111187854B | 公开(公告)日: | 2022-08-02 |
发明(设计)人: | 崔荣峰;董爱香;卫波;周燕;王青;谭玲玲;吉乃喆;张红艳;衣彩杰;苑超 | 申请(专利权)人: | 北京市园林科学研究院 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 北京一枝笔知识产权代理事务所(普通合伙) 11791 | 代理人: | 张庆瑞 |
地址: | 100000*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 分子 鉴定 ssr 引物 应用 | ||
1.苔草SSR引物组,其特征在于,包括(1)~(17)所示的引物:
(1)、上游引物的序列如SEQ ID No.1所示;下游引物的序列如SEQ ID No.2所示;
(2)、上游引物的序列如SEQ ID No.3所示;下游引物的序列如SEQ ID No.4所示;
(3)、上游引物的序列如SEQ ID No.5所示;下游引物的序列如SEQ ID No.6所示;
(4)、上游引物的序列如SEQ ID No.7所示;下游引物的序列如SEQ ID No.8所示;
(5)、上游引物的序列如SEQ ID No.9所示;下游引物的序列如SEQ ID No.10所示;
(6)、上游引物的序列如SEQ ID No.11所示;下游引物的序列如SEQ ID No.12所示;
(7)、上游引物的序列如SEQ ID No.13所示;下游引物的序列如SEQ ID No.14所示;
(8)、上游引物的序列如SEQ ID No.15所示;下游引物的序列如SEQ ID No.16所示;
(9)、上游引物的序列如SEQ ID No.17所示;下游引物的序列如SEQ ID No.18所示;
(10)、上游引物的序列如SEQ ID No.19所示;下游引物的序列如SEQ ID No.20所示;
(11)、上游引物的序列如SEQ ID No.21所示;下游引物的序列如SEQ ID No.22所示;
(12)、上游引物的序列如SEQ ID No.23所示;下游引物的序列如SEQ ID No.24所示;
(13)、上游引物的序列如SEQ ID No.25所示;下游引物的序列如SEQ ID No.26所示;
(14)、上游引物的序列如SEQ ID No.27所示;下游引物的序列如SEQ ID No.28所示;
(15)、上游引物的序列如SEQ ID No.29所示;下游引物的序列如SEQ ID No.30所示;
(16)、上游引物的序列如SEQ ID No.31所示;下游引物的序列如SEQ ID No.32所示;
(17)、上游引物的序列如SEQ ID No.33所示;下游引物的序列如SEQ ID No.34所示。
2.如权利要求1所述的苔草SSR引物组在苔草种质资源遗传多样性分析、苔草高密度图谱的构建、苔草品种鉴定和/或分子标记辅助育种中的应用。
3.试剂盒,其特征在于,包括如权利要求1所述的苔草SSR引物组以及可接受的试剂。
4.如权利要求3所述的试剂盒在苔草种质资源遗传多样性分析、苔草高密度图谱的构建、苔草品种鉴定和/或分子标记辅助育种中的应用。
5.苔草种质资源遗传多样性分析的方法,其特征在于,利用如权利要求1所述的苔草SSR引物组对苔草待测样本进行扩增,电泳检测,获得基因型数据;
所述基因型数据读取标准为:同一组引物对不同苔草待测样本扩增,电泳检测结果中,将同一大小的片段标记为1,不同的大小的标记用别的数据标记,没有的相同大小PCR产物的标记为0,这样每一个材料的SSR标记基因型形成一个数据矩阵;根据“0”“1”矩阵数据转换成基因型矩阵,利用Popgene32软件进行多态性分析,获得苔草种质资源遗传多样性结果。
6.苔草品种鉴定的方法,其特征在于,利用如权利要求1所述的苔草SSR引物组对苔草待测样本进行扩增,电泳检测,获得基因型数据;
所述基因型数据读取标准为:同一组引物对不同苔草待测样本扩增,电泳检测结果中,将同一大小的片段标记为1,不同的大小的标记用别的数据标记,没有的相同大小PCR产物的标记为0,这样每一个材料的SSR标记基因型形成一个数据矩阵;根据“0”“1”矩阵数据转换成基因型矩阵,利用Popgene32软件进行多态性分析,获得亚麻品种鉴定结果。
7.苔草种质聚类图的获得方法,其特征在于,利用如权利要求1所述的引物组对苔草待测样本进行扩增,电泳检测,获得基因型数据;
所述基因型数据读取标准为:同一组引物对不同苔草待测样本扩增,电泳检测结果中,将同一大小的片段标记为1,不同的大小的标记用别的数据标记,没有的相同大小PCR产物的标记为0;获得每组引物的遗传距离,基于所述遗传距离对苔草种质资源进行聚类分析。
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