[发明专利]一种适用于PCR扩增的真菌基因组DNA的提取方法在审
申请号: | 202010212861.1 | 申请日: | 2020-03-24 |
公开(公告)号: | CN111206072A | 公开(公告)日: | 2020-05-29 |
发明(设计)人: | 阎香言;王志贤;盛长忠;周泽奇;粟艳 | 申请(专利权)人: | 丹娜(天津)生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6806 | 分类号: | C12Q1/6806;C12N15/10 |
代理公司: | 天津滨海科纬知识产权代理有限公司 12211 | 代理人: | 耿树志 |
地址: | 300467 天津市滨海新区生态城中天大道2*** | 国省代码: | 天津;12 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 适用于 pcr 扩增 真菌 基因组 dna 提取 方法 | ||
1.一种适用于PCR扩增的真菌基因组DNA的提取方法,其特征在于:包括如下步骤:
S1、培养真菌,离心收集,得到菌体;
S2、向菌体中加入山梨醇buffer及破壁酶,充分混匀后孵育,离心收集得到菌体沉淀;
S3、向菌体沉淀中加入蛋白酶K及裂解液混匀,加入异丙醇及磁珠悬浮液后,再次振荡混匀;
S4、将离心管放入金属浴进行孵育,期间交替进行振荡混匀和静置;
S5、将孵育后离心管放置于磁力架静置,磁珠吸附后,吸除液体;
S6、取下离心管,加入清洗液,振荡混匀,然后将离心管放置于磁力架静置,磁珠完全吸附后,吸除液体;
S7、取下离心管,加水,振荡混匀,放入金属浴孵育,期间颠倒混匀;
S8、将离心管放置于磁力架静置,磁珠完全吸附后,将DNA溶液转移到新离心管中,即得。
2.根据权利要求1所述的适用于PCR扩增的真菌基因组DNA的提取方法,其特征在于:所述步骤S3中裂解液的组成为:5mM乙二胺四乙酸、450mM三羧甲基氨基甲烷、450mM氯化钾、300mM氢氧化钠、8mM二硫苏糖醇、1%曲通、0.03%N-月桂酰肌氨酸钠。
3.根据权利要求1所述的适用于PCR扩增的真菌基因组DNA的提取方法,其特征在于:所述步骤S3中异丙醇的加入量为350μL,磁珠悬浮液的加入量为20μL。
4.根据权利要求1所述的适用于PCR扩增的真菌基因组DNA的提取方法,其特征在于:所述步骤S3中蛋白酶K的加入量为20μL,裂解液的加入量为300μL。
5.根据权利要求1所述的适用于PCR扩增的真菌基因组DNA的提取方法,其特征在于:所述步骤S6中清洗液的组份为:0.3M PH值为4.0的氯化钾溶液。
6.根据权利要求1所述的适用于PCR扩增的真菌基因组DNA的提取方法,其特征在于:所述步骤S1具体包括如下步骤:1a、使用液体培养基培养真菌,用时36-72小时;1b、取菌体于离心管中,然后以12000r/min的转速离心10min,收集菌体。
7.根据权利要求1所述的适用于PCR扩增的真菌基因组DNA的提取方法,其特征在于:所述步骤S2具体包括如下步骤:向菌体中加入600μL山梨醇buffer,然后加入5μL浓度为10U/μL破壁酶Lyticase,破壁酶的活性为50U,充分混匀,30℃孵育30min,以1800r/min的转速离心10min,弃上清,收集沉淀。
8.根据权利要求1所述的适用于PCR扩增的真菌基因组DNA的提取方法,其特征在于:所述步骤S4具体包括如下步骤:将离心管置于金属浴中65℃孵育15min,期间颠倒混匀3回,每回4-6次;室温放置5min;振荡混匀1min,共静置9min,每3min振荡混匀1min。
9.根据权利要求1所述的适用于PCR扩增的真菌基因组DNA的提取方法,其特征在于:所述步骤S7具体包括如下步骤:取下离心管,加入100μL水,振荡混匀;放入56℃金属浴孵育10min,期间颠倒混匀3回,每回4-6次。
10.根据权利要求1所述的适用于PCR扩增的真菌基因组DNA的提取方法,其特征在于:所述真菌为曲霉属真菌,在步骤S1和S2之间还包括如下步骤:
(1)将菌体置于离心管中,用冷去离子水清洗3遍;然后将菌体移于50mL离心管中使其悬浮于浓度为0.2mol/L、pH值为8.0的25mL磷酸缓冲液中;
(2)离心收集到离心管中,加入500μL磷酸缓冲液,再加8g氧化锆珠(直径3mm)及0.3g氧化锆珠(直径0.2mm),配平后放入组织破壁仪,设置研磨条件为:1800r/min,研磨时间99s,间隔时间10s,6个循环,一键自动研磨;然后将菌液及氧化锆珠等分开,留菌液。
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