[发明专利]一种基于代谢组全局分析的植物性别鉴定方法有效
申请号: | 202010213466.5 | 申请日: | 2020-03-24 |
公开(公告)号: | CN111323509B | 公开(公告)日: | 2021-12-03 |
发明(设计)人: | 闫建斌;杜然;廖庆刚;黄三文 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院农业基因组研究所 |
主分类号: | G01N30/02 | 分类号: | G01N30/02;G01N30/72;G01N30/86 |
代理公司: | 北京布瑞知识产权代理有限公司 11505 | 代理人: | 孙式洪 |
地址: | 518108 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 代谢 全局 分析 植物 性别 鉴定 方法 | ||
1.一种基于代谢组全局分析的植物性别鉴定方法,其特征在于,包含如下步骤:
1)非靶向代谢组检测待测银杏的叶片中的代谢物;
2)对非靶向代谢组数据进行定量校准;所述对非靶向代谢组数据进行定量校准包括采用基于内标校正的MRM监控技术对步骤1)检测出的非靶向代谢物进行基于离子对信息的靶向含量校准;
3)将步骤2)中的数据处理与已知性别银杏的非靶向代谢数据处理进行对比判定待测银杏的性别;
采用超高分辨质谱进行代谢物的检测;其中,提取溶剂为80%浓度甲醇;色谱质谱条件包括:BEH C18色谱柱,流动相A为甲醇,流动相B为5mmol/L的乙酸铵,所述流动相A和B的体积比从50:50逐步提升至95:5。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤1)包括:分别提取银杏树幼苗叶片和内参叶片的代谢物后进行代谢组非靶向检测。
3.如权利要求2中所述的方法,其特征在于,所述的内参叶片为与待测银杏属于同一品种的已经确定性别的银杏树的叶子。
4.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤1)中所述代谢组鉴定和数据处理包括:采用质谱分析软件抽提质谱信息,并建立检测到物质的定性和定量离子对。
5.如权利要求4所述的方法,其特征在于,所述色谱质谱条件为:采用型号为100×2.1mm,1.7μm的BEH C18色谱柱进行分离;流速为0.3ml/min,进样量1μl,柱温45℃;HESI源在负离子模式下运行,碰撞气压力1.5 mTorr,喷雾电压2.8 kV,毛细管温度320℃,加热器温度300℃。
6.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述色谱质谱条件为:采用型号为100×2.1mm,1.7μm的BEH C18色谱柱进行分离;流速为0.3ml/min,进样量1μl,柱温45℃;HESI源在负离子模式下运行,碰撞气压力1.5 mTorr,喷雾电压2.8 kV,毛细管温度320℃,加热器温度300℃。
7.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤3)中的具体方法为:以已知雌雄性别的银杏叶代谢组检测数据作为参考,待检测的银杏样品中,其代谢组在统计学处理后,与雄性已知银杏样品经系统聚类分析划分在同一个分支下的则判定为雄性;与雌性已知银杏样品划分在同一个分支下的则判定为雌性。
8.如权利要求7所述的方法,其特征在于,所述系统聚类分析采用Ward聚类算法。
9.权利要求1-8任意一项所述的方法在银杏性别鉴定中的应用。
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