[发明专利]一种基于变分自编码器的液基细胞人工智能检测方法在审
申请号: | 202010225393.1 | 申请日: | 2020-03-26 |
公开(公告)号: | CN111444844A | 公开(公告)日: | 2020-07-24 |
发明(设计)人: | 康达周 | 申请(专利权)人: | 苏州腾辉达网络科技有限公司 |
主分类号: | G06K9/00 | 分类号: | G06K9/00;G06K9/62;G06T7/00;G06N3/04;G06N3/08;G06N20/00 |
代理公司: | 北京润川律师事务所 11643 | 代理人: | 张超;李保民 |
地址: | 215000 江苏省苏州市*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 编码器 细胞 人工智能 检测 方法 | ||
1.一种基于变分自编码器的液基细胞人工智能检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)数据裁剪:通过一个n*n的滑动窗口以m的步长在原图中扫描,将其裁剪并保存裁剪结果,在裁剪的结果中挑选X张至少具有一个完整宫颈细胞,且细胞之间没有成片粘黏的图片作为训练集中的原图,通过保存图片的名称来记住每一张裁剪图片左上角的横纵坐标,其中127像素≤m≤n≤512像素,X≥100;
(2)标注:对训练集中的每张原细胞图片进行标注,完整的宫颈细胞和背景通过两种颜色进行标注,标注的结果作为训练集的标签;
(3)将训练集和训练集的标签作为训练数据,从步骤(1)裁剪结果中挑选另外20张图片作为测试数据集;
(4)依据裁剪的窗口n*n和训练集的数据,设计u-net模型并对u-net模型进行训练测试;
(5)给所述模型输入原始数据之外的新数据,新数据经过数据裁剪,通过模型给出预测的标注,标注图片是二值图像;
(6)依据二值图像查找细胞轮廓,获取目标区域的外接矩形框,裁剪图片并保存在原图中的坐标;
(7)使用深度学习分割网络U-Net将医院提供的TCT细胞切片图像上的细胞分割下来,得到尺寸为128×128的单个宫颈鳞状上皮细胞图像,在其中选取5000张成像清晰且分割效果较好的细胞图像,作为数据集D的组成部分;
(8)对数据集D中的宫颈鳞状上皮细胞图像的Y个类别进行标注,3Y10;
(9)VAE利用两个神经网络建立两个概率密度分布模型:一个用于原始输入数据的变分推断,生成隐变量的变分概率分布,称为编码器(encoder);另一个根据生成的隐变量变分概率分布,还原生成原始数据的近似概率分布,称为解码器或生成器(decoder);
(10)将步骤(7)得到的细胞图像输入到上面训练得到的VAE编码器网络中,为每一个细胞对象求出一个与其对应的特征空间向量,然后应用k-means聚类算法对这些向量进行聚类,从而将特征类似的细胞归为一类;
(11)通过VAE中的解码器进行细胞分类特征分析,并将细胞图像按特征分布有序排列和可视化显示。
2.根据权利要求1所述的基于变分自编码器的液基细胞人工智能检测方法,其特征在于,所述步骤(1)中,n=512,所述m=170。
3.根据权利要求1所述的基于变分自编码器的液基细胞人工智能检测方法,其特征在于,所述步骤(5)中,通过高斯滤波对识别的二值图像进行降噪,二值图像的白色部分为宫颈细胞,黑色部分为背景。
4.根据权利要求1所述的基于变分自编码器的液基细胞人工智能检测方法,其特征在于,所述步骤(6)中,通过opencv封装的轮廓查找函数findContours(image,mode,method)得到图片中宫颈细胞的轮廓;其中参数image是一个单通道的图片,mode为轮廓的检索模式,method为轮廓的逼近模式。
5.根据权利要求1所述的基于变分自编码器的液基细胞人工智能检测方法,其特征在于,所述步骤(8)中,所述数据集D中的宫颈鳞状上皮细胞图像的进行6个类别标注:①正常鳞状上皮细胞;②高度鳞状上皮内病变;③低度鳞状上皮内病变;④鳞状细胞癌;⑤非典型鳞状细胞-意义不明确;⑥非典型鳞状细胞-不除外高度鳞状上皮内病变。
6.根据权利要求1所述的基于变分自编码器的液基细胞人工智能检测方法,其特征在于,所述步骤(8)中,还包括对数据进行预处理:
A.对细胞图像的像素特征进行归一化处理,将特征的取值区间缩放到[0,1]范围内
B.采用归一化方法将图像依次灰度化,然后对其像素值除以255,使它缩放到[0,1]中;
C.使用留出法将预处理完的数据集D划分为训练集S与测试集T,将样本比例设置为4:1。
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