[发明专利]一种基于细胞转录组数据进行临床免疫监测的方法

权利要求书

1.一种基于细胞转录组数据进行临床免疫监测的方法，该方法采用富含免疫细胞的体液样本进行检测，其特征在于，所述方法包括以下步骤：

S10、利用现有的人体免疫细胞转录组数据和免疫细胞丰度数据作为训练集进行机器学习，得到免疫监测算法模型，该免疫监测算法模型包括多种免疫细胞亚群评分值，以体现各个免疫细胞亚群活性状态，以及整个免疫系统的多样化程度、和协调/紊乱程度；

S20、对有免疫监测需求的个体收集其富含免疫细胞的体液样本，去除无核成分后抽提mRNA，获得个体转录组数据；

S30、利用免疫监测算法模型对个体转录组数据进行分析，获得该个体的免疫监测数据，与健康人群的基准值比较，结合其他临床检验数据和临床症状，获得该个体的单次临床免疫监测报告。

2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，还包括：

步骤S40、通过对同一个体不同时间点不同阶段的多次临床免疫监测报告，描绘出代表相应多种免疫细胞亚群动态变化的监测曲线，与健康人群的基准线比较，结合该个体的健康史、疾病史和治疗史，获取随时间发展变化的多次连续临床免疫监测报告。

3.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，步骤S10中，从多种机器学习算法的训练结果中筛选出平均排名最高的3-5种算法，再利用这3-5种算法分别分析每一个转录组特征，使用3-5倍交叉验证和平衡准确性度量，直到使用与发现队列同样来源但相对独立的验证集进行测试后得到的评估准确度在95％以上，从而确定最终的算法集合，构成免疫监测算法模型。

4.根据权利要求1所述的方法，其特征在于,步骤S20中，转录组分析在Illumina的NGSRNA-Seq测序平台、赛默飞世尔科技的Affymetrix GeneChip基因芯片平台、或NanoString的nCounter平台上完成。

5.根据权利要求2所述的方法，其特征在于，步骤S30和S40中，所述单次临床免疫监测报告和多次连续临床免疫监测报告的数据都采用本地数据库与云端数据库双储存平台，与中央数据中心联网，和终端随身设备同步，而且该免疫监测算法模型进行实时优化、分级和更新。

6.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述富含免疫细胞的体液样本为人体的外周血全血细胞或外周血单个核细胞。

7.根据权利要求6所述的方法，其特征在于，步骤S20中，该富含免疫细胞的体液样本为3-5ml全血细胞或者超过10⁶个的外周血单个核细胞，其中全血细胞样本需要使用EDTA或肝素抗凝剂，通过梯度离心法从血液样本中抽提出外周血单个核细胞，过滤掉离群的细胞，对合格细胞抽提mRNA之后，根据不同转录组分析平台的要求进行DNA文库构建和转录组分析，最终得到完整的血液细胞转录组数据。

8.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述富含免疫细胞的体液样本包括但不限于人体的脑脊液、腹水、肺灌洗液或呼吸道标本。