[发明专利]一种血浆长链非编码RNA在冠心病筛查中的应用有效
申请号: | 202010250006.X | 申请日: | 2020-04-01 |
公开(公告)号: | CN111718988B | 公开(公告)日: | 2023-10-03 |
发明(设计)人: | 李平;孙康云;徐桂冬;翁嘉懿;李渊;尹娟 | 申请(专利权)人: | 苏州市立医院 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883 |
代理公司: | 苏州智品专利代理事务所(普通合伙) 32345 | 代理人: | 吕明霞 |
地址: | 215000 江苏省苏*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 血浆 长链非 编码 rna 冠心病 中的 应用 | ||
1.一种血浆长链非编码RNA在冠心病筛查中的应用,其特征在于,所述血浆长链非编码RNA为ENST00000416361。
2.根据权利要求1所述一种血浆长链非编码RNA在冠心病筛查中的应用,其特征在于,所述血浆长链非编码RNA在冠心病筛查中的应用的建立方法步骤为:
选取冠心病组和正常对照组外周血血浆样本进行LncRNA-Seq高通量基因检测,样本RNA提取及质检;经过Illumina HiSeq测序仪测序,获得原始数据;使用cuffdiff软件计算并检测两组样品间的差异表达LncRNA ENST00000416361。
3.根据权利要求2所述一种血浆长链非编码RNA在冠心病筛查中的应用,其特征在于,所述血浆长链非编码RNA在冠心病筛查中的应用的建立方法步骤还包括如下步骤:
Q-PCR法验证LncRNA ENST00000416361差异表达
依据cuffdiff软件获得的数据,根据P-Value值≤0.05越小,Fold Change值越大的标准选取差异表达的LncRNA,使用Primer3进行引物设计,由于外周血游离LncRNA主要来自于外周血单核细胞,实验选取正常组、冠心病患者组外周血血浆以及外周血单核细胞各36例进行验证;同时对在冠心病患者血浆及单核细胞中上调表达的LncRNA coroMarker做对比验证;使用SYBR Premix Ex Taq(TakaRa)实时荧光定量试剂盒进行荧光定量PCR检测,内参为:β-actin(ACTB);总反应体系为20μL,SYBR Premix Ex TaqⅡ(2×)10μL,PCR正向引物0.8μL,PCR反向引物0.8μL,以反转录的cDNA为模板2μL,双蒸水6.4μL,每组设3个平行,于罗氏Light Cycler480II仪器进行扩增反应;扩增条件为95℃预变性30s;95℃反应5s和60℃反应30s,循环40次;95℃反应5s和60℃反应1min,95℃分析溶解曲线。根据溶解曲线分析引物的特异性,以β-actin做内参,根据2-△△CT方法计算基因相对定量的表达。
GraphPad Prism7数据分析,利用GraphPad Prism7对Real Time PCR数据结果进行表达量差异分析以及对数据进行ROC曲线分析。
4.一种非诊断用途的检测炎症发生及脂类代谢的方法,其特征在于:所述炎症发生及脂类代谢与血浆长链非编码RNA:ENST00000416361相关,通过检测ENST00000416361来确定炎症发生及脂类代谢。
5.一种非诊断用途的ENST0000041636与炎症因子表达相关性的检测方法,其特征在于,针对ENST0000041636设计si-ENST00000416361敲减序列为:
SEQ ID No.1:(5'-3')CCCAACAGCUCAUUGAGAATT,反向序列SEQ ID No.2:(5'-3')UUCUCAAUGAGCUGUUGGGTT;
siRNA-NC序列SEQ ID No.3:
(5'-3')UUCUCCGAACGUGUCACGUTT,
反向序列SEQ ID No.4:
(5'-3')ACGUGACACGUUCGGAGAATT;
Q-PCR并电泳鉴定敲减效率,检测细胞炎性因子IL-2、IL-4、IL-6、IL–10、IFN-γ、TNF-α,制定了标准产品和标准曲线,混合捕获微球溶液,200g离心5min,然后加入相同体积的微球缓冲液在暗处孵育30min,每管加入25μL混合微球,25μL样本和25μL荧光检测试剂,室温孵育2.5h,加入1ml的PBS,200g离心5分钟,加入100μL PBS,使用BD FACSCalibur检测细胞因子。
6.脂质相关基因SREBP表达的检测方法,其特征在于,所述脂质相关基因SREBP表达与ENST0000041636正相关,可以通过ENST0000041636检测脂质相关基因SREBP的表达量。
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