[发明专利]一种端到端的联合分类的医学图像分割方法及系统在审
申请号: | 202010263521.1 | 申请日: | 2020-04-07 |
公开(公告)号: | CN111429459A | 公开(公告)日: | 2020-07-17 |
发明(设计)人: | 李滇博;金明 | 申请(专利权)人: | 上海极链网络科技有限公司 |
主分类号: | G06T7/10 | 分类号: | G06T7/10;G06T7/136;G06K9/62 |
代理公司: | 上海硕力知识产权代理事务所(普通合伙) 31251 | 代理人: | 郭桂峰 |
地址: | 202163 上海市崇明区*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 端到端 联合 分类 医学 图像 分割 方法 系统 | ||
本发明公开一种端到端的联合分类的医学图像分割方法及系统,其中,所述的方法包括构建训练数据集,构建联合分类的语义分割模型,使用所述语义分割模型的第一模块对图像进行判别,判断所述阈值确定图像是否包含待分割目标;根据判断结果,对包含待分割目标的图像进行分割处理。利用本发明公开的方法和系统,对图像分割前首先对图像进行分类判断,只需对有病灶特征的图像进行分割,不仅可以减少误检,而且能明显降低分割的工作量和成本,具有较强的实用意义。
技术领域
本发明涉及一种分割方法,尤其涉及一种联合分类的医学图像分割方法,该方法是一种端到端学习的方法。
背景技术
基于U-net编解码结构的语义分割在医学图像分割,自然场景分割等领域中已经发挥了巨大的作用。这种方法主要由编码部分和解码部分组成,其中编码部分是为了提取图片的特征,解码部分则主要实现图像的像素级分类即分割。在医学图像分割中,医生要通过病人的x光图或CT图像来判断病人是否患病以及患病的病灶位置。传统的分割方法直接对图片的像素进行分类从而实现分割,实际应用中,会有很大一部分病人的x光图并没有病灶,直接使用分割会造成很多误检,影响医生的判断。
发明内容
为解决现有技术存在的上述问题,本发明要解决的问题是提供一种有效减少错误分割,提高分割的效率的解决方案。
为了实现以上目的,本发明设计了一种联合分类的端到端的分割方法,其特征在于包括以下步骤:构建训练数据集,所述训练数据集至少包含原始图像、分类标签和分割标签;构建联合分类的语义分割模型,所述语义分割模型至少包括第一模块,所述第一模块用以判别输入图像是否包含待分割目标;使用所述训练数据集对所述语义分割模型进行端到端的训练,并在训练验证集上确定模型所需的阈值;使用所述语义分割模型的第一模块对图像进行判别,判断所述阈值确定图像是否包含待分割目标;根据判断结果,对包含待分割目标的图像进行分割处理。
优选的,所述分割标签为二值图掩膜,掩膜中白色区域为患病的位置,掩膜黑色区域为正常区域,当掩膜全零时,表示该图没有待分割目标。
优选的,所述分类标签是根据训练集中的掩膜统计得到的,为二值图掩膜,当所述分类标签当掩膜为全黑时,原图的分类标签为零,掩膜非全零时,标签为1。
优选的,所述阈值至少包括两个,分别为分类阈值和分割阈值。
优选的,所述第一模块至少包含一个池化层、两个全卷积层以及分类损失函数,所述模块获得的最终特征为1024维。
优选的,所述训练分割模型的过程包括以下步骤:将所述训练数据集中的原始图像进行旋转,裁剪,翻转以及亮度对比度等增强后,将图像送入模型的编码阶段,获得不同分辨率下的特征图;将所述不同分辨率下的特征图分别进行分类判别和解码处理,判别输入图像是否包含待分割目标;将解码后的图像送入分割模块的损失单元,根据处理结果进行端到端的训练。
优化的,所述的分类判别处理步骤包括:获取特征征图;将特征征图输入池化层进行处理;将特征征图输入第一全卷积层进行处理;将特征征图输入第二全卷积层进行处理;对特征征图采用分类损失函数进行分类判断;输出分类判断结果。
优化的,所述的解码处理步骤包括:输入上一解码单元的输出特征;对特征进行上采样处理;将上采样后的特征图和编码阶段对应尺寸的特征图进行拼接;输入卷积单元,输出的特征;将输出的特征依次送入下一个解码单元。
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