[发明专利]来源于大刍草的抗菌肽SM-985及其应用

说明书

本发明属于生物技术领域，具体公开了来源于大刍草的抗菌肽SM‑985及其应用，所述抗菌肽的序列为SEQ ID NO.2所示。SM‑985可增加细菌细胞膜的渗透性，SM‑985与细菌膜（革兰氏阴性或革兰氏阳性）结合的亲和力较高。用SM‑985处理过的细菌SEM和TEM图像显示，细菌细胞膜出现损伤，细胞发生溶解，具有广谱、较强的抗菌活性。体内抗菌活性表明，SM‑985可预防由丁香假单胞菌DC3000引起的番茄叶斑病感染。

技术领域

本发明属于生物技术领域，具体涉及来源于大刍草的抗菌肽SM-985及其应用。

背景技术

抗菌肽(AMPs)是天然的小分子，由于它们是小分子，因此被认为是常规抗生素的最佳替代品之一，并且它们通常具有广泛的抗菌活性以及相对较低的细胞毒性。抗菌肽是先天免疫系统的一部分，它可由所有微生物产生，包括细菌(Hassan et al.,2012)，动物(Hanco ck and Scott,2000)和植物(Benko-Iseppon et al.,2010)。抗菌肽是抵抗细菌感染的第一道防线(Ebbensgaard et al.,2015)，植物抗菌肽是植物防御系统的模式，抗菌肽可以从种类繁多的花朵、种子、叶子、茎和根中分离出来，并且具有抗植物病原体的活性(Nawrot et al.,2014)。大刍草不仅是一种植物，包括四个多年生和一年生玉米种(Galinat,1969)。大刍草和玉米拥有共同的祖先(Doebley,1992)。George Beadle提出玉米是驯化的大刍草形式，在过去的10000年中，墨西哥人选择的一些主要基因可能已经将大刍草转变为玉米(Beadle,1939)(Beadle,1972)。育种计划和种质特征研究表明，与野生祖先相比，栽培植物对生物和非生物胁迫的抗性水平相对较低(Rosenthal and Dirzo,1997)。cDNA是由逆转录酶产生的mRN A的互补DNA拷贝，cDNA文库的构建是确定细胞和组织特异性基因表达的有力工具。由mRNA制备的cDNA，没有内含子之类的反向序列。因此，cDNA既反映可表达的RNA，又可反映基因产物(蛋白质)(Ying,2004)。由于这些文库的规模大，可能达到几千个，因此针对抗菌肽的cDNA文库筛选非常具有挑战性。在我们实验室的cDNA文库中，通过枯草芽胞杆菌表达系统筛选抗菌肽(Kong et al.,2018)(Wu et al.,2020)，但是这种方法既费时又费钱。电子计算机预测是大规模筛选和鉴定新型潜在抗菌肽的一种省时，省钱的方法(Liu et al.,2017)。结构良好的抗菌肽数据库为开发抗菌肽预测提供了良好的基础，过去几年中已经提出了许多预测方法(F.et al.,2012)，这些服务器基于不同的参数使用了几种算法(Liu et al.,2017)。例如，CAMP_R3基于支持Support Vector Machines(SVM)Random Forests(RF)和Discriminant Analysis(DA)等算法开发了抗菌肽的预测工具。(Thomaset al.,2010)。