[发明专利]一种肝细胞肝癌的自身抗体7-AAb检测panel及其应用有效
申请号: | 202010270727.7 | 申请日: | 2020-04-08 |
公开(公告)号: | CN111413498B | 公开(公告)日: | 2023-08-04 |
发明(设计)人: | 樊嘉;高强;张舒;毕利军;李阳;刘羽鸣;杨思贤;刘诚喜 | 申请(专利权)人: | 复旦大学附属中山医院 |
主分类号: | G01N33/574 | 分类号: | G01N33/574;G01N33/564;G16B40/00 |
代理公司: | 上海容慧专利代理事务所(普通合伙) 31287 | 代理人: | 于晓菁 |
地址: | 200032 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 肝细胞 肝癌 自身抗体 aab 检测 panel 及其 应用 | ||
本发明属于肝癌的筛查技术领域,具体涉及一种诊断肝细胞肝癌的自身抗体7‑AAb检测panel及其应用。本发明检测了561例肝细胞肝癌患者和592例对照(包括343例正常人NC和249例肝硬化患者LC)样本,通过10‑fold cross‑validation确定了CIAPIN1,EGFR,MAS1,SLC44A3,ASAH1,UBL7和ZNF428这7个蛋白的自身抗体具有区分肝细胞肝癌的能力。运用这7个分子,并建立了神经网络(ANN)模型,发现ANN模型显示出更好的诊断效能并且优于传统的logistic regression模型和甲胎蛋白(AFP)。在验证集中,基于这7个分子的ANN模型同样显示出很好的诊断效能,特别是灵敏度。
技术领域
本发明属于肝癌检测领域,具体涉及一种肝细胞肝癌的自身抗体7-AAb检测panel及其应用。
背景技术
肝细胞肝癌(Hepatocellular carcinoma,简称:HCC)是常见的恶性肿瘤之一,其发病隐匿,恶性程度高,病死率高,因此及时准确的诊断对于提高患者的生存率至关重要。目前临床上主要运用甲胎蛋白(Alpha fetoprotein,简称:AFP)结合影像学及病理学检查进行肝癌的早期诊断;但是AFP对于肝癌筛查的特异性及敏感性均不十分理想。随着分子生物学的不断发展,多种新的标志物被相继发现,特别是自身抗体的诊断价值。
自身抗体是机体针对肿瘤异常抗原发生免疫响应而产生的特异性抗体,具有以下特点:(1)伴随肿瘤的发生过程产生,先于临床症状,适用于早期诊断;(2)自身抗体的产生是免疫反应的结果,经过免疫系统的放大,抗体比起蛋白更容易检测;(3)具有特定类型肿瘤特异性。研究发现存在一些抗原是肿瘤特有的,但不同肿瘤间无特异性,如p53;也有一些抗原是特定肿瘤特异性的,比如前列腺癌的很多抗原是氧化应激相关的蛋白。关注癌症肿瘤自身抗体有助于改变癌症诊断和疗效监测的现状,为肝癌的检测提供自身抗体的思路。
发明内容
本发明为了克服上述技术问题,本发明提供了一种诊断肝细胞肝癌的自身抗体7-AAb检测panel及检测模型,我们通过10-fold cross-validation确定了CIAPIN1,EGFR,MAS1,SLC44A3,ASAH1,UBL7和ZNF428这7个蛋白的自身抗体具有区分肝细胞肝癌的能力。运用这7个分子,我们建立了神经网络(ANN)模型,发现ANN模型显示出更好的诊断效能并且优于传统的logistic regression和甲胎蛋白(AFP)。在验证集中,它们同样显示出很好的诊断效能,特别是灵敏度。我们将这7个自身抗体的ANN检测组合命名为7-AAb panel,它对于AFP阴性的肝细胞肝癌患者及早期肝细胞肝癌的诊断同样具有价值。
第一方面,本发明提供了一种肝细胞肝癌的自身抗体7-AAb检测panel,其特征在于,所述检测panel包括CIAPIN1,EGFR,MAS1,SLC44A3,ASAH1,UBL7和ZNF428。
第二方面,本发明提供了所述的自身抗体7-AAb检测panel的筛选方法,包括以下步骤:
步骤S1、采集肿瘤标志物检测样本的样本数据,其中所述样本数据包括训练集数据和验证集数据;
步骤S2、采用含有100个重组蛋白的聚焦肝细胞肝癌的蛋白小芯片检测所述样本数据;
步骤S3、在训练集中采用10-fold cross-validation确定所述检测panel。
进一步地,其中所述蛋白小芯片的制备方法为:采用含有多个重组蛋白的HuProtTM人类蛋白质组芯片对肝癌和健康人血清进行筛选,通过响应的数据比对和分析,确定候选生物标志物,点制聚焦肝细胞肝癌的蛋白小芯片。
进一步地,在所述数据比对前进行芯片内和芯片间归一化处理。
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