[发明专利]检测2019-nCoV中orf1ab基因的RT-LAMP试剂盒及其专用引物和应用在审
申请号: | 202010271011.9 | 申请日: | 2020-04-08 |
公开(公告)号: | CN113493861A | 公开(公告)日: | 2021-10-12 |
发明(设计)人: | 袁静;闫超;崔晶花;李少丽;陈浪;薛冠华;赵汉青;冯燕玲 | 申请(专利权)人: | 首都儿科研究所 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6844;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 北京三友知识产权代理有限公司 11127 | 代理人: | 韩蕾;周达 |
地址: | 100020 北京*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 2019 ncov orf1ab 基因 rt lamp 试剂盒 及其 专用 引物 应用 | ||
1.一种用于检测新型冠状病毒SARS-CoV-2的引物组,其包括具有SEQ ID NO:2、SEQ IDNO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6所示序列的引物。
2.一种用于检测新型冠状病毒SARS-CoV-2的试剂盒,其包含权利要求1所述的引物组。
3.根据权利要求2所述的试剂盒,其中还包含基础反应试剂,所述基础反应试剂包括:10×Thermopol反应缓冲液、MgSO4、betaine、dNTP,Bst DNA聚合酶,WarmStart RTx反转录酶。
4.根据权利要求2或3所述的试剂盒,其中还包含阳性对照和/或阴性对照;优选地,所述阳性对照包含新型冠状病毒SARS-CoV-2基因组RNA,所述阴性对照为不含新型冠状病毒SARS-CoV-2基因组RNA的反应体系。
5.权利要求1所述的引物组或权利要求2-4任一项所述的试剂盒在体外检测样品中是否存在新型冠状病毒SARS-CoV-2的应用。
6.根据权利要求5所述的应用,其中,所述引物组是用于RT-LAMP反应;
优选地,引物组在每25μl反应体系中的使用浓度为:SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3所示序列的引物的终浓度独立地为2-8pmol,SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5所示序列的引物的终浓度独立地为24-36pmol,SEQ ID NO:6所示序列的引物的终浓度为12-18pmol;
更优选地,引物组在每25μl反应体系中的使用浓度为:SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3所示序列的引物的终浓度独立地为8pmol,SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5所示序列的引物的终浓度独立地为32pmol,SEQ ID NO:6所示序列的引物的终浓度为16pmol。
7.根据权利要求6所述的应用,其中,RT-LAMP反应体系还包含基础反应试剂,所述基础反应试剂包括:10×Thermopol反应缓冲液2.5μl、100mM MgSO4 1.5μl、5mM betaine 4μl、10mM dNTP 3.5μl,Bst DNA聚合酶1μl,WarmStart RTx反转录酶0.5μl,ddH2O补至25μl;
优选地,所述基础反应试剂在25μl反应体系中的使用量为:12.5μl。
8.根据权利要求6所述的应用,其中,检测包括以下步骤:
S1:提取待测样品RNA;
S2:反应体系配制:25μl反应体系包含2μl待测样品RNA、10×Thermopol反应缓冲液2.5μl、100mM MgSO4 1.5μl、5mM betaine 4μl、10mM dNTP 3.5μl,Bst DNA聚合酶1μl,WarmStart RTx反转录酶0.5μl,引物加入量为:100μM FIP/BIP引物各0.8μl(终浓度32pmol),100μM F3/B3所示引物各0.1μl(终浓度4pmol),100μM LF/LB引物0.4μl(终浓度16pmol),ddH2O补至25μl;
S3:将反应体系置62℃-63℃条件下恒温扩增反应45-60min,获得反应液;
S4:结果分析:使用钙黄绿素颜色指示剂或浊度仪对所述反应液进行检测分析。
9.根据权利要求8所述的应用,其中,步骤S3中将反应体系置63℃条件下恒温扩增反应60min。
10.根据权利要求8或9所述的应用,其中,步骤S4中所述结果分析的具体方法为:
当使用钙黄绿素颜色指示剂进行检测时,在反应液中添加1μl的钙黄绿素颜色指示剂,呈现绿色表示待测样品中存在新型冠状病毒SARS-CoV-2(阳性),呈现橙色表示待测样品中不存在新型冠状病毒SARS-CoV-2(阴性);
当使用浊度仪进行检测时,浊度上升(0.1)表示待测样品中存在新型冠状病毒SARS-CoV-2(阳性),浊度无变化表示待测样品中不存在新型冠状病毒SARS-CoV-2(阴性)。
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