[发明专利]基于轻量级全卷积神经网络的医学图像分割方法有效
申请号: | 202010277654.4 | 申请日: | 2020-04-08 |
公开(公告)号: | CN111489364B | 公开(公告)日: | 2022-05-03 |
发明(设计)人: | 唐贤伦;钟冰;李洁;彭德光;李锐;郝博慧;彭江平;李伟;李星辰;黄淼;邹密 | 申请(专利权)人: | 重庆邮电大学 |
主分类号: | G06T7/11 | 分类号: | G06T7/11;G06T7/194;G06N3/04;G06N3/08 |
代理公司: | 重庆市恒信知识产权代理有限公司 50102 | 代理人: | 陈栋梁 |
地址: | 400065 重*** | 国省代码: | 重庆;50 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 轻量级 卷积 神经网络 医学 图像 分割 方法 | ||
1.一种基于轻量级全卷积神经网络的医学图像分割方法,其特征在于,包括以下步骤:
步骤1:对医学图像数据集进行灰度化、归一化、对比度受限自适应直方图均衡、伽马校正在内的预处理;
步骤2:针对训练集随机提取patch图,首先设定patch图的宽和高,然后随机地选取像素点作为patch的中心;
步骤3:搭建由左侧收缩路径和右侧扩张路径组成的全卷积神经网络;
步骤4:针对步骤3中搭建好的全卷积神经网络,使用dice_loss计算预测值y和期望值y'的相似度,其中dice_loss的定义如下:
步骤5:结合步骤4中的损失函数,针对图像数量较少的数据集使用留一法进行交叉验证;
步骤6:加载步骤5中得到的预训练网络模型,通过通道稀疏正则化训练、裁剪比例因子小于设定阈值的通道,以及微调裁剪后的网络完成BN通道模型裁剪,得到轻量级全卷积神经网络;最后,加载步骤1中的测试图像数据到该网络中,快速测试完成图像分割。
2.根据权利要求1所述的一种基于轻量级全卷积神经网络的医学图像分割方法,其特征在于,所述步骤1对医学图像数据集进行灰度化、归一化、对比度受限自适应直方图均衡、伽马校正在内的预处理,具体为:首先采用的是对R、G、B分量进行加权平均的算法,其表达式为如下,其中Gray(i,j)表示图像上的像素点,i表示像素点的横坐标,j表示像素点的纵坐标:
Gray(i,j)=0.299*R(i,j)+0.578*G(i,j)+0.114*B(i,j)
然后采用z-score标准化方法,对上述灰度化后的图像进行标准化并缩放图像数据,表达为:
其中,μ表示的是每一维度像素点自身的均值,σ表示的是每一维度像素点自身的均方差;
接着,对标准化后的图像,在保证能够将直方图分布变成近似均匀分布的前提下,设定一个限制直方图分布的阈值δ以限制性的增强图像对比度,同时,在像素的映射过程中使用双线性插值加快直方图均衡化的速度;然后继续对对比度受限自适应直方图均衡(CLAHE)后的图像Vin的伽玛曲线进行非线性色调编辑,识别图像信号中的前景和背景部分,并增大两者的比例;最后把图片上的像素点值归一化映射到0-1之间。
3.根据权利要求1所述的一种基于轻量级全卷积神经网络的医学图像分割方法,其特征在于,所述步骤2针对训练集随机提取patch图,首先设定patch图的宽和高,然后随机地选取像素点作为patch的中心,具体为:
针对训练集,首先设定patch图的宽、高大小分别为patch_w和patch_h,然后随机地选取像素点作为patch的中心,该像素点的坐标需满足如下条件:
其中,x为横坐标,y为纵坐标,img_w是原图的宽度大小,img_h是原图的高度大小;最后,以该像素点为中心,从原图中截取宽度为patch_w,高度为patch_h的训练图patch,针对测试集,同样先设定patch_w和patch_h,然后判断原图的大小是否和设定的patch图的大小成比例关系,如果没有,则对原图进行像素填充;最后,以输入原图的左上角为起点,按照“从上到下从左到右”原则循环提取patch图。
4.根据权利要求1所述的一种基于轻量级全卷积神经网络的医学图像分割方法,其特征在于,所述步骤3搭建由左侧收缩路径和右侧扩张路径组成的全卷积神经网络架构,具体为:
收缩路径遵循典型的卷积网络模式,每个阶段均由两个3×3卷积模块进行特征提取,步长为2的下采样操作跟在卷积之后,在每次下采样之后,特征图尺寸的大小减少一倍,特征通道的数量增加一倍;在扩展路径中,在卷积模块后使用双线性插值上采样操作,其步长也为2,在每次上采样之后跳跃连接收缩路径每阶段的输出;在最后一层,使用1x1卷积代替全连接层将每个64分量特征向量映射到所需的类数。
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