[发明专利]一种血浆EBV miR-BART8-3p的检测引物和探针及应用在审

专利信息
申请号: 202010279421.8 申请日: 2020-04-10
公开(公告)号: CN111334579A 公开(公告)日: 2020-06-26
发明(设计)人: 林城;潘建基;宗井凤;林可焴;苏颖;陈梦媛;卢天柱;郭巧娟;林少俊 申请(专利权)人: 福建省肿瘤医院(福建省肿瘤研究所;福建省癌症防治中心)
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;C12N15/11
代理公司: 福州元创专利商标代理有限公司 35100 代理人: 饶文君;蔡学俊
地址: 350014 福*** 国省代码: 福建;35
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摘要:
搜索关键词: 一种 血浆 ebv mir bart8 检测 引物 探针 应用
【说明书】:

发明提供一种血浆EBV miR‑BART8‑3p的检测引物和探针及应用,属于基因治疗和医学诊断技术领域,具体提供引物和探针序列如SEQ ID NO.2‑4所示,本发明通过所述引物和探针建立了针对血浆中EBV miR‑BART8‑3p的检测方法,可以有效区分正常人和鼻咽癌患者血浆的表达,由此快速做出对鼻咽癌的诊断,本发明对于鼻咽癌的诊断、鼻咽癌患者的放疗疗效均有重要意义。

技术领域

本发明涉及基因治疗和医学诊断技术领域,具体涉及一种血浆生物学标志物EBVmiR-BART8-3p在鼻咽癌患者早期诊断、放疗疗效监测和预后预测的检测方法和应用。

背景技术

鼻咽癌是中国南方癌症相关死亡的重要原因。鼻咽癌对放疗非常敏感,早期鼻咽癌患者可通过调强放射治疗获得超过90%的5年生存率。 然而,超过70%的患者最初被诊断为局部晚期鼻咽癌,且仍有15%至30%的患者因远处转移导致治疗失败。因此,发现简单、有效的肿瘤标志物,以提高鼻咽癌早期诊断率和预测预后能力,是鼻咽癌未来防治的重点工作。鼻咽癌与EB病毒(Epstein-Barr virus,EBV)感染密切相关。因此,可通过检测EBV基因产物来协助鼻咽癌的诊疗。最早传统检测的是EBV抗体,尤其是VCA/IgA,然而VCA/IgA抗体的敏感性和特异性相对较低,而且在接受放疗后,患者体内的VCA/IgA抗体长时间内仍维持在高水平,价值有限。

目前,EBV-DNA是临床实践中常用的生物标志物。然而15%的鼻咽癌患者在确诊时EBV-DNA阴性;其次,各个实验室EBV-DNA检测技术和方法不同、EBV-DNA的定量和截值缺乏标准化,限制了其广泛应用。因此,研究鼻咽癌中的新型生物标志物具有重要意义。微小RNA(microRNA,miRNA)是一类高度保守的长度约为20~23个核苷酸的内源性小分子非编码RNA,可参与肿瘤细胞的增殖、分化、凋亡、侵袭转移、免疫逃逸等过程。人鼻咽癌细胞产生两类miRNA:一类是人基因组产生的miRNA;另一类是 EBV基因组产生的miRNA(EBV miR)。EBV编码miRNA 的基因组位于BHRF1和 BART两个基因簇。目前研究发现EBV共编码 22个EBV-miR-BARTs前体,形成 44个成熟的miRNA,并且EBV-miR-BARTs大量表达于鼻咽癌组织中,而在正常人鼻咽组织几乎检测不到。然而,鉴于鼻咽癌患者的活检组织少,不易取得,副作用及风险较大,而血浆检测比较简单、方便且易于实施、普及,因此,如果能够通过检测血浆中EBV BARTs microRNA,并应用于鼻咽癌的早期诊断、放疗疗效预测及预后判断具有重要意义。

发明内容

本发明的目的在于提供一种血浆EBV miR-BART8-3p的检测引物和探针,通过检测血浆中EBV BARTs microRNA,并应用于鼻咽癌的早期诊断、放疗疗效预测及预后判断具有重要意义。

为实现上述目的,本发明采用如下技术方案:

本发明所述的EBV miR-BART8-3p的序列如SEQ ID No.1所示,具体为GUCACAAUCUAUGGGGUCGUAGA。

还提供了一种血浆EBV miR-BART8-3p的检测引物和探针,其序列如下:

上游引物为miR-BART8-3p-F:5’- ATCGTCACAATCTATGGGGT-3’,

下游引物为miR-BART8-3p-R:5’- GCAGGGTCCGAGGTATTC-3’,

探针为:5’- CGCACTGGATACGACTCTACG - 3’,5’端标记的荧光报告基团是FAM,3’端标记的荧光淬灭基团是MGB。

通过所述引物和探针制备获得血浆EBV miR-BART8-3p检测试剂盒。

该试剂盒的检测方法是通过PCR技术检测生物样品中EBV miR-BART8-3p的表达量。

本发明的优点在于:

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