[发明专利]一种芋SSR引物组及其应用

说明书

本发明涉及分子标记技术领域，特别涉及一种芋SSR引物组及其应用，本发明以芋为材料，提取芋的DNA并进行酶切、测序、分析得到相应的SSR引物，可为芋的遗传多样性和遗传关系的应用研究提供更多有效的SSR标记，经分析该引物具有高多态百分数的特点，使用该引物进行验证扩增效果更好；该引物组的选择为芋在遗传育种中的研究诸如QTL分析、亲缘关系鉴定、遗传多样性研究及杂种优势预测等方面提供有价值的遗传工具，并通过系谱亲本间遗传关系的研究能为芋的育种亲本合理选配及芋种质创新利用提供参考依据。

【技术领域】

本发明涉及分子标记技术领域，特别涉及一种芋SSR引物组及其应用。

【背景技术】

芋又称芋头、芋艿，天南星科植物的地下球茎，形状、肉质因品种而异为多年生块茎植物，常作一年生作物栽培。我国的芋种质资源极其丰富，但是在种质资源遗传多样性的研究和保护方面研究还较少，目前，SSR技术广泛应用于分子遗传标记的研发，SSR标记方法是利用在染色体上呈随机分布的重复单位组成的长达几十个核苷酸的串联序列来设计引物，SSR标记的引物开发首先是要从该物种中获取重复序列两侧的序列信息并设计引物，而后才能被利用；但是随着芋育种技术的发展，不断涌现出很多新的芋品种，而如何对这些品种进行有效、科学分类，仅凭形态学的观察是不够的，还需要在DNA水平上对其进行区分，为芋的分类提供间接证据，虽然，目前已有报道了很多SSR引物，但是这些引物的扩增效果和对种质资源的分析效果有优有劣，而且随着芋品种的增多，基因组也越来越大，SSR引物数量还不够，因此，需要更进一步的对芋的SSR引物进行开发，以为后续开展遗传育种、基因组作图、基因定位和物种亲缘关系鉴别等研究提供新的引物。

【发明内容】

鉴于上述内容，有必要提供一种芋SSR引物组及其应用，该引物组具有扩增多态性好，能快速区分芋品种，对芋进行亲缘关系鉴别，可为今后开展遗传育种、基因组作图、基因定位和物种亲缘关系鉴别等研究提供新的基因位点和鉴定引物。

为达到上述目的，本发明所采用的技术方案是：

一种芋SSR分子标记引物组，，所述SSR引物组为下述引物中的任意1对(如SEQ IDNO.1～20所示)：

P8上游引物：5’-GATCGATCAAACAGACACCTTTC-3’；下游引物：5’-TATAGCTGGTCTCCCTAGCTCTG-3’；

P14上游引物：5’-TCCTGATGAGGAAGTGACGG-3’；下游引物：5’-CTGAACCTTTCGAAAACGGG-3’；

P15上游引物：5’-AGATCAACTCAGAAACACTTGGC-3’；下游引物：5’-TCCACAAAGATTCTGCTAGGAAG-3’；

P22上游引物：5’-CTCCTGGACTCGGACAAGGT-3’；下游引物：5’-GTTAGGTCCTGGTCGTCTTCTCC-3’；

P25上游引物：5’-TCAAACAGAATTTTCAGCCTTTT-3’；下游引物：5’-CCAAAATATGAAAAAGCCCACT-3’；

P37上游引物：5’-CAAAAGATGCAGATAGCAAATCC-3’；下游引物：5’-TCATCTTCACTTTGTTCCCAATC-3’；

P38上游引物：5’-CTTCCATCTATATGACCGTTTCG-3’；下游引物：5’-AGGAGGGAGAGAAGGAGAGAACT-3’；

P42上游引物：5’-GGGATAGATATGCAAACACAAGC-3’；下游引物：5’-AGGCTTTTAGATTTTGAAGATGGA-3’；

P45上游引物：5’-TGTTTGTTGGCTTTCTATTCGAT-3’；下游引物：5’-GCACGAGATTTACCTCCTGATTA-3’；