[发明专利]生物样品的复杂质谱数据的评估方法有效
申请号: | 202010284882.4 | 申请日: | 2020-04-13 |
公开(公告)号: | CN111812190B | 公开(公告)日: | 2023-07-18 |
发明(设计)人: | 托比亚斯·博斯坎普 | 申请(专利权)人: | 布鲁克·道尔顿有限及两合公司 |
主分类号: | G01N27/64 | 分类号: | G01N27/64;G01N33/68;H01J49/40 |
代理公司: | 北京天昊联合知识产权代理有限公司 11112 | 代理人: | 张凯;张杰 |
地址: | 德国*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 生物 样品 复杂 数据 评估 方法 | ||
1.用于组织样品分析的质谱测量数据的评估方法,包括以下步骤:
(a)提供组织样品,其包含具有特征分子的不同键合的聚合物,
(b)处理组织样品,以制备至少两种类型的聚合物和来自于该聚合物的分子,并使它们可用于随后的质谱测量,
(c)获取处理过的组织样品的多个质谱,
(d)确定肯德里克位移作为质谱中成像的聚合物质量信号的质量位移,其中质量位移表示所测量的质量信号与紧邻的在质量标度上预期的分子质量信号之间的偏差,并且使用肯德里克分布图作为至少一种类型的聚合物的理论模型来计算预期分子质量信号的总和,
(e)评估确定的质量位移,评估包括(i)计算大于第一圆周矩的圆周矩以检测肯德里克位移的一个以上的聚类点,和/或(ii)用于识别结构的霍夫型变换,以及
(f)根据评估评定质谱的质量,
其中,质谱质量的评估和评定包含确定用于获取质谱的质量标度与由质量位移得出的质量标度之间的偏差。
2.根据权利要求1所述的方法,其中,为了创建至少一种类型的聚合物的理论模型,假定质量与标称质量近似成比例,并且将适当选择的范围内的所有自然数作为此类型聚合物的可能的标称质量进行考虑。
3.根据权利要求1所述的方法,其中,聚合物包含蛋白质、肽、N聚糖和/或脂质类型的生物聚合物。
4.根据权利要求1所述的方法,其中,确定质量位移包括针对测量质量值m计算量其中并且选择标度因数λ,使其对应于聚合物的精确质量与标称质量之间的平均比率。
5.根据权利要求4所述的方法,其中,标度因数针对N聚糖为λG=1+3.5x 10-4,针对蛋白质和肽为λP=1+4.95x 10-4。
6.根据权利要求4所述的方法,其中,估算用于质谱的肯德里克分布图的方式为:(i)确定质谱局部最大值的位置,将其作为点云绘制在肯德里克图上,并通过密度估算的标准方法估算分布函数,或者(ii)由质谱的谱强度在肯德里克图的平面内形成二维直方图,从而将每个直方图块内出现的强度相加,并且在沿着垂直方向进行归一化之后,每列对应于针对涉及的质量区间的肯德里克分布图的数值近似值。
7.根据权利要求1所述的方法,其中,肯德里克分布图在圆柱空间中定义。
8.根据权利要求7所述的方法,其中,计算肯德里克位移和计算圆周矩的步骤相结合,并且通过以下公式表达第n圆周矩
其中
该公式作为连续内插的谱在质量标度的子区间Ik范围内的傅里叶积分。
9.根据权利要求8所述的方法,其中,通过以下公式由不同n的至少两个圆周矩算出在质量标度子区间Ik范围内的偏差
其中,表示参考肯德里克分布图的第n圆周矩在子区间Ik内的复共轭。
10.根据权利要求9所述的方法,其中,通过以下公式由N个谱的集合Sj(j=1…N)和相关的矩算出
其中,指数
11.根据权利要求10所述的方法,其中,为指数α选择值0、1、2中的一个。
12.根据权利要求7所述的方法,其中,对由获取的谱确定的质量值mi、相关联的肯德里克位移Δi与适当选择的密度值pi进行霍夫型变换,通过以下公式
H(r,d)=∑i∈L(r,d)pi,其中
其中,r在适当选择的范围内离散,d在区间[-1/2…1/2]内离散,并且ε对应于d的离散化。
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