[发明专利]与新型冠状病毒的抗体有效结合的表位

说明书

本发明涉及一种来源于SARS‑CoV‑2RBD蛋白的、能与新型冠状病毒的抗体有效结合的表位。该表位能够用于结合识别SARS‑CoV‑2RBD的蛋白(例如抗体)。

技术领域

本发明属于医药技术领域，具体涉及与新型冠状病毒(SARS-CoV-2) 的抗体有效结合的表位。

背景技术

新型冠状病毒SARS-CoV-2作为新发的突发传染病病原，目前还没有 针对该病毒的特效药物获批上市。

治疗性抗体药物不但在肿瘤和自身免疫疾病方面占有重要地位，在传 染性疾病的治疗中也同样有效。目前已经上市的治疗和预防病毒感染的药 物有预防小儿呼吸道合胞病毒(RSV)感染的帕利珠单抗(Synagis)，治疗 HIV感染的艾巴利珠单抗(Trogarzo)，以及用于狂犬病毒暴露后预防的 Rabishield。同时还有针对众多病毒的单克隆抗体处于临床研究的不同阶段 (https：//clinicaltrials.gov/)。

SARS-CoV-2属于冠状病毒。同属冠状病毒的重症急性呼吸综合征冠 状病毒(SARS-CoV)以及中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-CoV)也曾 在分别在2002-2003年和2012年引发疫情。据世界卫生组织(WHO)统 计SARS-CoV共引发8000人感染，794人死亡(https：//www.who.int/)。 自2012年至今，MERS-CoV感染病毒病例在持续增加，截至2019年底， 全球确诊2499例感染病例，861例死亡病例。2020年1月12日，世界卫 生组织正式命名了″2019新型冠状病毒(2019-nCoV)″，其后在2020年2 月11-12日国际病毒分类委员会(International Committee on Taxonomy of Viruses，ICTV)宣布，新型冠状病毒(2019-nCoV)的正式分类名为严重 急性呼吸综合征冠状病毒2(severe acute respiratorysyndrome coronavirus 2， SARS-CoV-2)，世界卫生组织(WHO)同日在日内瓦举办全球研究和创 新论坛上宣布，由这一病毒导致的疾病的正式名称为″COVID-19″。

病毒要感染细胞，首先需要通过囊膜蛋白结合宿主的受体。抗体，尤 其是中和活性抗体，通过结合到囊膜蛋白上，阻断病毒与细胞受体的结合， 从而阻断病毒感染。同时，抗体结合到囊膜蛋白上，从而对游离的病毒或 是被感染的细胞进行标记，通过抗体的Fc区募集巨噬细胞或是补体等免 疫细胞和免疫分子，从而清除游离的病毒以及被感染的细胞。因此，靶向 受体结合区(RBD)的抗体，不但具有中和病毒感染的活性，还可以通过 Fc区发挥作用，促进病毒以及被感染细胞的清除。

基于对其它冠状病毒，尤其是SARS-CoV和MERS-CoV的研究，与 受体结合的重要囊膜蛋白是刺突蛋白(S)。S可进一步分为S1和S2两部 分。S2的作用是介导膜融合。S1的N端(NTD)和C端(CTD)都可能 是RBD。通过对SARS-CoV-2的研究，团队发现CTD是此冠状病毒的RBD， 结合受体ACE2。

抗原表位由连续序列(蛋白质一级结构)或不连续的蛋白质三维结构组 成，这些氨基酸决定了特殊化学基团的抗原性，也称为抗原表位。抗原表 位主要存在于抗原物质的表面，有些存在于抗原物质的内部，只有经过酶 或其他方法处理后才能暴露。一种天然抗原物质可能有多个表位。抗原分 子越大，决定簇的数量就越多。

抗原分子的B细胞表位大小不同，有些表位由以线性排列方式彼此相 邻排列的氨基酸组成，因此被称为线性或连续表位。还有一些表位的氨基 酸残基在一级结构上互不相邻，但在蛋白质折叠过程中，这些氨基酸在2 级结构和3级结构上彼此接近，形成可被抗体识别的结构，这样的表位被 称为空间表位或构象表位。球蛋白是一个具有三维空间的折叠肽链，因此 它的大多数表位都隐藏在里面，这可以称为隐性表位。只存在于蛋白表面 的表位可以被免疫细胞识别被称为功能表位。已经证明抗原分子的抗原性 是由其表位的氨基酸序列、空间构型决定的。