[发明专利]一种用于快速鉴别新型冠状病毒的引物组、探针以及试剂盒和检测方法在审
申请号: | 202010290259.X | 申请日: | 2020-04-14 |
公开(公告)号: | CN113528704A | 公开(公告)日: | 2021-10-22 |
发明(设计)人: | 沈永义;陈晓媛 | 申请(专利权)人: | 华南农业大学 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6844;C12N15/11 |
代理公司: | 广州市科丰知识产权代理事务所(普通合伙) 44467 | 代理人: | 龚元元 |
地址: | 510630*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 快速 鉴别 新型 冠状病毒 引物 探针 以及 试剂盒 检测 方法 | ||
1.一种用于快速鉴别新型冠状病毒的引物组和探针,其特征在于,所述引物组和探针的核苷酸序列如下所示:
上游引物SARS-CoV-2-F1:5’AGTCTCTAGTCAGTGTGTTAATCTTACAA3’(SEQ ID NO:1);
下游引物SARS-CoV-2-R1:5’Biotin-TTCGCACTAGAATAAACTCTGAACTCACTT 3’(SEQ IDNO:2);
荧光探针SARS-CoV-2-P1:5’[FAM]TTCCATGCTATACATGTCTCTGGGACCAAT[THF]GGTACTAAGAGGTTT[C3-spacer]3’(SEQ ID NO:3)。
2.一种快速鉴别新型冠状病毒的RPA试纸条试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包含权利要求1中所述的引物组和探针。
3.根据权利要求2所述的一种快速鉴别新型冠状病毒的RPA试纸条试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包含RNA提取试剂、反转录试剂、RPA扩增试剂和侧向流动试纸条。
4.根据权利要求2所述的一种快速鉴别新型冠状病毒的RPA试纸条试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包含醋酸镁、ddH2O、5×Extration Buffer。
5.一种利用权利要求1引物组和探针快速鉴别新型冠状病毒的RPA-LFD检测方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)提取待测样品RNA;
(2)将步骤(1)中的RNA反转成cDNA;
(3)以步骤(2)中的cDNA为模板,用所述引物组和探针对样品进行RPA扩增反应,获得扩增产物A1;
(4)将扩增产物A1与5×Extration Buffer反应,获得产物B1;
(5)将产物B1滴加至侧向流动试纸条的加样孔,进行LFD反应,观察结果。
6.根据权利要求5所述的一种快速鉴别新型冠状病毒的RPA-LFD检测方法,其特征在于,步骤(5)中所述观察结果的方法为:
当试纸条检测区显色,且质控区也显色,则待测样品中的病毒为新型冠状病毒;
当试纸条检测区不显色,且质控区显色,则待测样品中的病毒不是新型冠状病毒;
当质控区不显色,则试纸条无效,需要用新的试纸条重新测定。
7.根据权利要求5所述的一种快速鉴别新型冠状病毒的RPA-LFD检测方法,其特征在于,步骤(3)的具体方法为:
取浓度均为10μmol/L的上游引物、下游引物各2.1μL,浓度为10μmol/L的探针0.6μL,Rehydration Buffer 29.5μL,RNase Inhibitor的ddH2O 12.2μL,cDNA模板1μL,混合后加入RPA酶管中震荡混匀,再加入2.5μL的醋酸镁,然后将反应体系置于37℃水浴锅中反应20min,不需要经过高温变性、退火、延伸,反应得到扩增产物A1。
8.根据权利要求7所述的一种快速鉴别新型冠状病毒的RPA-LFD检测方法,其特征在于,所述RPA酶管包含有重组酶uvs X、单链结合蛋白和DNA聚合酶。
9.根据权利要求5所述的一种快速鉴别新型冠状病毒的RPA-LFD检测方法,其特征在于,步骤(4)中扩增产物A1的体积为10μL;5×Extration Buffer的体积为80μL。
10.根据权利要求5所述的一种快速鉴别新型冠状病毒的RPA-LFD检测方法,其特征在于,步骤(5)中产物B1的体积为75μL,加样至加样孔中5min内读取结果。
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