[发明专利]调控玉米种胚大小的相关基因及其筛选方法和应用

权利要求书

1.调控玉米种胚大小的相关基因，其特征在于，包括ZmCT2和ZmPPR，所述ZmCT2的核苷酸如SEQ ID NO:1所示，氨基酸如SEQ ID NO:2所示，所述ZmPPR的核苷酸如SEQ ID NO:3所示，氨基酸如SEQ ID NO:4所示。

2.一种权利要求1所述调控玉米种胚大小的相关基因的筛选方法，其特征在于，包括以下步骤；

步骤1、以胚占整个种子质量的百分比PEWMK为衡量指标，对337份玉米自交系材料进行评测

取收获后充分晾晒的种子分离胚和胚乳，每个株系取3至6粒种子进行分离，分别统计胚和胚乳的重量，作为一个重复，每个自交系3个重复；计算胚占种子的质量百分比，计算公式如下：

W_Em:表示胚的重量；W_En:表示胚乳的重量；

步骤2、全基因组关联分析

使用TASSEL 5.0软件对PEWMK进行分析，为避免假阳性对分析结果产生的影响，将群体结构K和亲缘关系Q考虑进去，使用Q+K模型即混合线性模型MLM对表型进行分析；对分析结果绘制Manhattan图，并对显著的SNP位点在玉米基因组中查找并注释；

步骤3、自交系群体中ZmCT2、ZmPPR编码区SNP位点与PEWMK相关性分析

根据GWAS结果比对并查找ZmCT2、ZmPPR编码区显著的SNP位点，分析SNP位点是否引起编码氨基酸发生变化，并分析自交系中引起氨基酸改变的SNP位点对PEWMK的效应；

步骤4、玉米突变体株系鉴定及PEWMK测定

zmct2突变体鉴定及表型测定：根据zmct2突变位点设计引物核苷酸序列如SEQ ID NO:5-SEQ ID NO:6所示，提取基因组DNA，使用相应引物进行PCR扩增，确定突变体及分离的野生型株系NS；将收获的zmct2突变体和野生型材料测定其PEWMK值，进行比较。

zmppr突变体鉴定及表型测定：因zmppr突变后直接影响到后代籽粒的发育，根据zmppr突变位点设计引物核苷酸序列如SEQ ID NO:7-SEQ ID NO:8所示，提取基因组DNA，使用相应引物进行PCR扩增，确定杂合突变体及分离的野生型株系NS；将从zmppr杂合株系自交后代收获的zmppr纯合突变体籽粒和野生型籽粒，进行比较，纵切后，查看zmppr对籽粒发育的影响。

3.一种权利要求1所述调控玉米种胚大小的相关基因在玉米种质资源的选育过程中的应用。