[发明专利]一种绵羊CHCHD7基因插入/缺失多态性的检测方法及其应用在审
申请号: | 202010325230.0 | 申请日: | 2020-04-23 |
公开(公告)号: | CN111411159A | 公开(公告)日: | 2020-07-14 |
发明(设计)人: | 蔡勇;徐红伟;李海霞;蓝贤勇;阿依木古丽;杨具田;臧荣鑫 | 申请(专利权)人: | 西北民族大学 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6858 |
代理公司: | 合肥律众知识产权代理有限公司 34147 | 代理人: | 侯克邦 |
地址: | 730000 甘*** | 国省代码: | 甘肃;62 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 绵羊 chchd7 基因 插入 缺失 多态性 检测 方法 及其 应用 | ||
1.一种绵羊CHCHD7基因插入/缺失多态性的检测方法,其特征在于:包括以下步骤:
以包含CHCHD7基因的待测绵羊全基因组DNA为模板,利用PCR扩增包含绵羊CHCHD7基因3’侧翼区插入/缺失多态性位点的片段,对PCR扩增产物进行电泳,根据电泳结果鉴定所述插入/缺失多态性位点的基因型;
所述PCR采用的引物对(P1)为:
上游引物:5'-TGGCCTTGACAGACACATCC-3';
下游引物:5'-CCTGCAGAGCTTCCCTTTCT-3'。
2.根据权利要求1所述的一种绵羊CHCHD7基因插入/缺失多态性的检测方法,其特征在于:所述插入/缺失多态性位点选自绵羊CHCHD7基因NC_040260.1:g36219994_3622000位8-bp插入/缺失多态性位点。
3.根据权利要求2所述的一种绵羊CHCHD7基因插入/缺失多态性的检测方法及其应用,其特征在于:根据电泳结果,所述插入/缺失多态性位点的插入/插入基因型表现为156bp一条带纹,插入/缺失基因型表现为156bp和148bp以及异源双链条带共三条带纹,无缺失/缺失基因型。
4.根据权利要求1所述的一种绵羊CHCHD7基因插入/缺失多态性的检测方法,其特征在于:所述PCR采用的反应程序为:95℃预变性5min;94℃变性30s,68℃退火30s,72℃延伸20s,18个循环,每循环后退火温度减1℃;50℃退火30s,72℃延伸12s,30个循环;72℃延伸10min。
5.根据权利要求1所述的一种绵羊CHCHD7基因插入/缺失多态性的检测方法,其特征在于:所述电泳采用质量浓度为3.5%的琼脂糖凝胶。
6.根据权利要求1-5任意一项所述的绵羊CHCHD7基因插入/缺失多态性的检测方法在绵羊分子标记辅助选择育种中的应用。
7.根据权利要求6所述的应用,其特征在于:所述插入/缺失多态性位点的插入/插入基因型可以作为提高滩羊公羊体长和胸深性状的DNA标记。
8.根据权利要求6所述的应用,其特征在于:所述绵羊选自滩羊。
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