[发明专利]基于可控相分离液滴控制细胞内mRNA定位和翻译过程的方法在审

专利信息
申请号: 202010327372.0 申请日: 2020-04-23
公开(公告)号: CN111471713A 公开(公告)日: 2020-07-31
发明(设计)人: 孙育杰;张宏晨;邵世鹏 申请(专利权)人: 北京大学
主分类号: C12N15/85 分类号: C12N15/85;C12N15/62
代理公司: 北京万象新悦知识产权代理有限公司 11360 代理人: 李稚婷
地址: 100871*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 基于 可控 分离 控制 细胞内 mrna 定位 翻译 过程 方法
【权利要求书】:

1.一种对细胞内mRNA的定位和翻译过程进行控制的方法,其特征在于,在细胞内利用蛋白质的光控相分离过程形成凝聚体液滴,将特异的mRNA分子招募到液滴中抑制其翻译过程;对细胞的特定区域利用光照使液滴解散,从而在特定区域将mRNA从液滴中释放出来进行翻译,实现对该mRNA的定位和翻译过程的控制。

2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,将具有相分离能力的天然无结构区域IDRs分别融合到PixELLs光遗传学系统的PixD和PixE蛋白上,获得可通过光控相分离过程形成凝聚体液滴的蛋白质。

3.如权利要求2所述的方法,其特征在于,所述PixD蛋白的氨基酸序列如序列表中SEQIDNo:1所示,所述PixE蛋白的氨基酸序列如序列表中SEQ ID No:3所示。

4.如权利要求2所述的方法,其特征在于,所述具有相分离能力的天然无结构区域IDRs是FUS蛋白的N端区域或RNA聚合酶II的C端区域。

5.如权利要求4所述的方法,其特征在于,所述FUS蛋白的N端区域的氨基酸序列如序列表中SEQ ID No:5所示。

6.如权利要求2所述的方法,其特征在于,所述mRNA含有特异性的靶向序列,该靶向序列可以结合特定的锚定蛋白,而所述锚定蛋白与PixD或PixE构成融合蛋白,参与凝聚体的形成。

7.如权利要求6所述的方法,其特征在于,所述靶向序列为PP7噬菌体操纵子茎环序列,相应的锚定蛋白是PP7噬菌体外壳蛋白;或者,所述靶向序列为MS2噬菌体操纵子茎环序列,相应的锚定蛋白是MS2噬菌体外壳蛋白。

8.如权利要求6所述的方法,其特征在于,在液体中富集抑制mRNA翻译过程的蛋白。

9.如权利要求1所述的方法,其特征在于,通过光控细胞内液滴的聚合和解散实现对目标mRNA的定位和翻译过程的控制,包括如下步骤:

1)将具有相分离能力的天然无结构区域IDRs分别与光控蛋白模块PixD和PixE融合,构建融合蛋白IDR-PixD和IDR-PixE的表达载体,并转染进细胞内;

2)将锚定蛋白和光控蛋白模块PixD或PixE融合,构建锚定蛋白-PixD或锚定蛋白-PixE的融合蛋白表达载体,并转染进细胞内;

3)构建包含特异性靶向序列的目标mRNA的表达载体并转染进细胞内,其中所述特异性靶向序列可以和所述锚定蛋白发生相互作用,使目标mRNA结合所述锚定蛋白;

4)在无蓝光刺激的条件下,IDR-PixD和IDR-PixE聚集在一起,同时聚集了锚定蛋白-PixD或锚定蛋白-PixE,细胞内形成凝聚体液滴,将包含特异性靶向序列的目标mRNA招募进液滴中,mRNA的翻译过程被抑制;

5)使用区域化的蓝光光斑照射细胞内特定区域,使该特定区域的液滴解聚,释放出所包裹的mRNA,并在释放位置进行翻译过程。

10.如权利要求9所述的方法,其特征在于,在步骤1)将抑制翻译过程的蛋白与IDR-PixD或IDR-PixE融合,构建表达载体并转染进细胞内。

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