[发明专利]一种与水稻种子萌发耐盐紧密连锁的分子标记及应用有效
申请号: | 202010331535.2 | 申请日: | 2020-04-24 |
公开(公告)号: | CN111304359B | 公开(公告)日: | 2022-04-15 |
发明(设计)人: | 解丽霞;郑崇珂;谢先芝;李稳;周冠华;蒲梦琳;周晋军;和亚男;彭永彬;李亚萍;张治振 | 申请(专利权)人: | 山东省水稻研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 济南诚智商标专利事务所有限公司 37105 | 代理人: | 韩百翠 |
地址: | 250100 *** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 水稻 种子 萌发 紧密 连锁 分子 标记 应用 | ||
1.一种与水稻种子萌发耐盐紧密连锁的分子标记,其为分子标记M324,所述分子标记的序列为SEQ IDNO:1或者SEQ ID NO:2,其中SEQ ID NO:1所示的DNA片段与水稻种子萌发耐盐连锁,SEQ ID NO:2所示的DNA片段与水稻种子萌发不耐盐连锁;所述水稻为海稻86和日本晴的分离群体。
2.权利要求1所述的与水稻种子萌发耐盐紧密连锁的分子标记的扩增引物在海稻86和日本晴分离群体种子耐盐萌发的早期筛选方面的应用;所述扩增引物的上游引物M324-F:5’- TGTTGACATTTTGAGATTTACTTGGTCACC -3’;下游引物M324-R:5’-AGATTGGGTTGTTTGCGGGGCTA -3’。
3.权利要求1所述的与水稻种子萌发耐盐紧密连锁的分子标记的扩增引物在鉴定水稻日本晴、海稻86及二者的杂合体方面的应用;所述扩增引物的上游引物M324-F:5’-TGTTGACATTTTGAGATTTACTTGGTCACC -3’;下游引物M324-R:5’- AGATTGGGTTGTTTGCGGGGCTA-3’。
4.一种鉴定水稻日本晴、海稻86及二者的杂合体的方法,其特征是,
(1)利用权利要求1所述的与水稻种子萌发耐盐紧密连锁的分子标记的扩增引物的上游引物M324-F和下游引物M324-R对水稻基因组DNA进行PCR扩增;所述上游引物M324-F:5’-TGTTGACATTTTGAGATTTACTTGGTCACC -3’;下游引物M324-R:5’- AGATTGGGTTGTTTGCGGGGCTA-3’;
(2)对步骤(1)得到的PCR扩增产物进行电泳分析,
扩增出916bp大小条带的为日本晴基因型;
扩增出557bp大小条带的为海稻86基因型;
同时扩增出916bp和557bp大小条带的为水稻日本晴基因型和海稻86基因型的杂合体。
5.如权利要求4所述的鉴定水稻日本晴、海稻86及二者的杂合体的方法,其特征是,
所述步骤(1)PCR扩增的反应体系包括如下组分:50ng/μL基因组DNA 2μL;10μM的上游引物M324-F 0.3μL;10μM的下游引物M324-R 0.3μL;2×EasyTaq PCR SuperMix 10μL;ddH2O 补足20μL。
6.如权利要求5所述的鉴定水稻日本晴、海稻86及二者的杂合体的方法,其特征是,所述步骤(1)所述的PCR扩增反应程序为:94℃预变性3min;94℃30s,60℃ 30s,72℃ 30s,35个循环;72℃后延伸5min。
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