[发明专利]用于检测SARS-CoV-2的gRNA及试剂盒在审
申请号: | 202010344702.7 | 申请日: | 2020-04-27 |
公开(公告)号: | CN111549177A | 公开(公告)日: | 2020-08-18 |
发明(设计)人: | 刘华勇;陈翀;谢婵芳;文荻琛 | 申请(专利权)人: | 广州再生医学与健康广东省实验室;广州普世利华科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6844;C12N15/113;C12N15/11;C12N15/63;C12R1/93 |
代理公司: | 广州华进联合专利商标代理有限公司 44224 | 代理人: | 林青中 |
地址: | 510300 广东省广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 检测 sars cov grna 试剂盒 | ||
1.用于检测SARS-CoV-2的gRNA,所述gRNA包括a)与Cas核酸酶相互作用的框架核酸片段,以及b)与靶核酸结合的特异性核酸片段,所述特异性核酸片段包括SEQ ID NO:4~6中至少一种所示的核酸片段。
2.用于检测SARS-CoV-2的试剂盒,其包含权利要求1所述的gRNA;
优选地,其还包含Cas12a核酸酶和/或具有与Cas12a的旁路单链DNA切割活性类似的Cas核酸酶、单链DNA探针、阳性对照和用于CRISPR检测体系的缓冲液中的至少一种。
3.根据权利要求2所述的试剂盒,所述Cas12a核酸酶选自FnCas12a、AsCas12a、LbCas12a、Lb5Cas12a、HkCas12a、OsCas12a、TsCas12a、BbCas12a、BoCas12a和Lb4Cas12a中的至少一种;
和/或,所述与Cas核酸酶相互作用的框架核酸片段为SEQ ID NO:37所示;
和/或,所述具有与Cas12a的旁路单链DNA切割活性类似的Cas核酸酶为Cas12b核酸酶;
和/或,所述Cas12b核酸酶选自AacCas12b、Aac2Cas12b、AkCas12b、AmCas12b、AhCas12b和AcCas12b中的至少一种。
4.根据权利要求2或3所述的试剂盒,所述单链DNA探针的5′端标记荧光发射基团,3′端标记淬灭基团。
5.根据权利要求2或3所述的试剂盒,所述单链DNA探针的两端分别标记有不同的标记物,分别为第一标记物和第二标记物;
优选地,所述单链DNA探针上还标记有与所述标记物不同的信号物质,且所述信号物质上还标记有所述第二标记物的抗体,如此,当所述单链DNA探针被CRISPR检测体系切割时,所述信号物质与所述第二标记物位于同一核酸片段;
优选地,所述试剂盒还包含试剂条,所述试纸条包括样品垫、反应膜和吸收垫,所述反应膜上设置有检测区和质检区;
其中:
所述检测区固定包被有针对所述第一标记物的第一抗标记物;
所述质检区固定包被有针对所述第二标记物的抗体的二抗;
所述第一标记物与所述第一抗标记物能够形成标记物-抗标记物复合物,且所述第一抗标记物与所述第二标记物的抗体不同。
6.根据权利要求5所述的试剂盒,所述信号物质选自荧光团、比色标记、量子点、胶体金、生物素、用于拉曼衍射成像的炔烃基团、用于click反应的环烯烃、用于聚合物标记的引发基团、多肽/蛋白分子、LNA/PNA、非天然氨基酸及其类似物、非天然核酸及其类似物和纳米结构;
所述纳米结构包括无机纳米颗粒、NV-center、聚集/组装诱导发光分子、稀土离子配体分子以及多金属氧簇。
7.根据权利要求2、3、6任一项所述的试剂盒,其还包含扩增引物、DNA聚合酶、扩增缓冲液、样品预处理试剂和水中的至少一种;
其中所述扩增引物用于扩增含有所述gRNA靶向序列的核酸片段;
优选地,所述扩增引物是LAMP引物。
8.权利要求1所述的gRNA、或权利要求2~7任一项所述的试剂盒在检测SARS-CoV-2中的非诊断用途。
9.载体系统,其包含一种或多种载体,所述载体包含:第一调控元件和第二调控元件,所述第一调控元件可操作地连接至编码Cas核酸酶的核苷酸片段,所述第二调控元件可操作地连接至编码权利要求1所述gRNA的核苷酸片段。
10.一种改变基因产物表达的方法,包括使用CRISPR-Cas核酸酶体系切割靶DNA以改变基因产物的表达;
所述CRISPR-Cas核酸酶体系包含权利要求1所述gRNA和/或权利要求9所述的载体系统。
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