[发明专利]一种毕赤酵母中EHT1基因进化关系分析的实验方法在审

专利信息
申请号: 202010347629.9 申请日: 2020-04-28
公开(公告)号: CN111518939A 公开(公告)日: 2020-08-11
发明(设计)人: 陈嘉;冯志宏;焦旋;高振峰;施俊凤;杨志国;张立新;秦一帆;张茜;闫钊 申请(专利权)人: 山西省农业科学院农产品贮藏保鲜研究所
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12Q1/04;C12R1/84
代理公司: 北京集智东方知识产权代理有限公司 11578 代理人: 吴倩
地址: 030031 山*** 国省代码: 山西;14
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摘要:
搜索关键词: 一种 酵母 eht1 基因 进化 关系 分析 实验 方法
【说明书】:

发明适用于毕赤酵母基因研究技术领域,提供了一种毕赤酵母中EHT1基因进化关系分析的实验方法,通过依次复活菌株GS115和pPIC9K、培养菌株GS115和pPIC9K、合成EHT1引物、提取及鉴定菌株GS115和pPIC9K的总RNA、反转录毕赤酵母总RNA并扩增EHT1CDS区,从而方便进行后续的EHT1的进化关系分析,本发明的实验方法可以应用于发酵工程菌。

技术领域

本发明属于毕赤酵母基因研究技术领域,尤其涉及一种毕赤酵母中EHT1基因进化关系分析的实验方法。

背景技术

EHT1和EEB1编码乙酯合成酶/水解酶,单一和多重缺失分析暗示Eht1和Eeb1在MCFA乙酯生物合成中的作用,且集中在两种基因产物上。纯化GST-Eht1和GST-Eeb1融合蛋白获得结果清楚地表明,这些蛋白具有调控MCFA乙酯合成和水解两种酶活性。这与单个和多个缺失菌株中MCFA乙酯分析结果一致。EHT1或EEB1的缺失,特别是双缺失导致大部分MCFA乙酯的产生显著降低。Eht1酶对MCFA乙酯的生产具有最大的贡献。先前研究已经证实,基因ATF1、Lg-ATF1(仅存在于贮藏酵母中)和ATF2编码乙酸酯合酶。然而,ATF1和ATF2的双缺失不影响MCFA乙酯合成。鉴于eht1Δeeb1Δ双缺失突变体中的残余活性,在酵母中仍然存在涉及酯生物合成的未知基因。对从各种食品中分离到的酵母菌株进行挥发性香气成分检测,发现可以产生多种酯类物质如辛酸乙酯和己酸乙酯等。分析酵母中控制酯类合成的酶发现EHT1和EEB1主要控制中短链的脂肪酸酯,前期研究EHT1和EEB1基因的分布发现EHT1基因在所有菌株中均存在,而EEB1基因只在部分酵母菌株中存在,推测EHT1基因是酵母合成酯类所必需基因。因此分析毕赤酵母中EHT1基因进化关系,对其应用于发酵工程菌中具有重要意义。

发明内容

本发明提供一种毕赤酵母中EHT1基因进化关系分析的实验方法,旨在分析毕赤酵母中EHT1基因进化关系,并应用于发酵工程菌。

本发明是这样实现的,一种毕赤酵母中EHT1基因进化关系分析的实验方法,包括以下步骤:

S1、复活菌株GS115和pPIC9K;

S2、培养菌株GS115和pPIC9K;

S3、合成EHT1引物;

S4、提取及鉴定菌株GS115和pPIC9K的总RNA;

S5、反转录毕赤酵母总RNA,并扩增EHT1 CDS区。

优选的,其特征在于:步骤S1具体包括:

将菌株GS115和pPIC9K冻干管从4℃冰箱冷藏室取出,75%酒精棉擦拭冻干管表面,将管顶端用酒精灯外焰均匀加热;

在冻干管加热部位立即滴加2–3滴无菌水;

移取500μL5°Bé麦芽汁液体培养基加入冻干管中,使菌株GS115和pPIC9K冻干粉全部溶解;

将溶解后的菌株GS115和pPIC9K悬浮液转移到5mLEP管中,加入5,000μL5° Bé麦芽汁液体培养基,混匀。

与现有技术相比,本发明的有益效果是:本发明的一种毕赤酵母中EHT1基因进化关系分析的实验方法,通过复活菌株GS115和pPIC9K、培养菌株GS115和pPIC9K、合成EHT1引物、提取及鉴定菌株GS115和pPIC9K的总RNA、反转录毕赤酵母总RNA并扩增EHT1 CDS区,从而方便进行后续的EHT1的进化关系分析,可以应用于发酵工程菌。

附图说明

图1为本发明的具体实施方式的毕赤酵母EHT1测序结果示意图。

图2为本发明的具体实施方式的EHT1氨基酸序列示意图。

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