[发明专利]一种基于GDF9基因编码区突变的蒙古羊繁殖力提高方法在审

专利信息
申请号: 202010347775.1 申请日: 2020-04-27
公开(公告)号: CN111500744A 公开(公告)日: 2020-08-07
发明(设计)人: 佟彬;李亚星;程子轩;张秀英;任殿玉;朝鲁蒙 申请(专利权)人: 内蒙古大学;锡林浩特市种畜繁育中心
主分类号: C12Q1/6888 分类号: C12Q1/6888;C12N15/11
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 010020 内蒙古自*** 国省代码: 内蒙古;15
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摘要:
搜索关键词: 一种 基于 gdf9 基因 编码 突变 蒙古 繁殖力 提高 方法
【权利要求书】:

1.一种基于GDF9基因编码区突变的蒙古羊繁殖力提高方法,其特征在于:包括以下步骤:

S1、检测待测蒙古羊基因组中的GDF9基因编码区启动子下游1040bp处是否存在一个T→C的突变,该位点突变导致核酸序列所对应的氨基酸由苯丙氨酸改变为丝氨酸,以确定蒙古羊个体在该位点的基因型;

S2、通过基因型筛选种用蒙古羊,所述GDF9基因的核苷酸序列NCBI ReferenceSequence为NC_019462.2的羊5号染色体,第41767870bp到41770600bp区域;

S3、若蒙古羊基因组中的GDF9基因编码区启动子下游第1040位核苷酸为T时,则其纯合体的基因型为TT,若蒙古羊基因组中的基因编码区启动子下游第1040位核苷酸为C时,则其纯合体的基因型为CC,其杂合体基因型为TC;

S4、通过基因型提高蒙古羊繁殖力为:所述CC基因型蒙古羊的平均产羔数高于TC基因型,基因型TC蒙古羊的平均产羔数高于TT型。

2.根据权利要求1所述的一种基于GDF9基因编码区突变的蒙古羊繁殖力提高方法,其特征在于:所述蒙古羊基因组中的GDF9 1040T>C SNP的检测方法为:利用PCR方法扩增蒙古羊GDF9基因GenBank Accession Number为NC_019462.2的41768565到41767924位核苷酸的片段,并将扩增产物进行DNA测序,若在127bp位置出现单峰且基因型为T,则此基因型为TT,若在127bp处出现套峰,则此基因型为TC,若在127bp位置出现单峰且基因型为C,则此基因型为CC。

3.根据权利要求2所述的一种基于GDF9基因编码区突变的蒙古羊繁殖力提高方法,其特征在于:所述PCR方法的扩增引物对为具有序列1、2所述的核苷酸。

4.根据权利要求1所述的一种基于GDF9基因编码区突变的蒙古羊繁殖力提高方法,其特征在于:所述蒙古羊的繁殖力体现为每胎产羔数。

5.根据权利要求1所述的一种基于GDF9基因编码区突变的蒙古羊繁殖力提高方法,其特征在于:所述氨基酸序列由包含所述核苷酸序列编码得到的,所述位点突变选自氨基酸序列第347位。

6.根据权利要求5所述的一种基于GDF9基因编码区突变的蒙古羊繁殖力提高方法,其特征在于:所述该位点突变自所对应的氨基酸选自苯丙氨酸与丝氨酸,当所述位点为T时,其对应氨基酸为苯丙氨酸,当所述位点为C时,其对应氨基酸为丝氨酸。

7.根据权利要求2所述的一种基于GDF9基因编码区突变的蒙古羊繁殖力提高方法,其特征在于:所述PCR方法扩增蒙古羊GDF9基因为上下游引物M-F和M-R,以从蒙古羊实验材料提取的基因组为模板,分别用上述引物进行扩增。

8.根据权利要求7所述的一种基于GDF9基因编码区突变的蒙古羊繁殖力提高方法,其特征在于:所述上下游引物M-F和M-R的序列分别如下:

M-F:5’-AAGAAGCTGCTGAGGGTGTA-3’

M-R:5’-GAAAAAAGAATCACTTGGGAAA-3’。

9.根据权利要求7所述的一种基于GDF9基因编码区突变的蒙古羊繁殖力提高方法,其特征在于:所述上下游引物的扩增体系一致,扩增体系的总体积20μL,其中,上下游引物各1μL,模版1μL,预混液10μL,去离子水7μL。

10.根据权利要求7所述的一种基于GDF9基因编码区突变的蒙古羊繁殖力提高方法,其特征在于:所述扩增后的产物经过95℃预变性3min,98℃变性10s,58℃退火30s,72℃延伸15s,35个循环,72℃延伸10min,4℃保存,然后进行测序。

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