[发明专利]基于肉用性状对早胜牛进行早期选留的分子标记及检测方法

说明书

本发明公开了一种基于肉用性状对早胜牛进行早期选留的分子标记及检测方法，属于生物技术领域。本发明公开的一种基于肉用性状对早胜牛进行早期选留的分子标记及检测方法，将混合池测序与PCR‑SSCP方法相结合，通过筛选与早胜牛肉用性状相关联的分子标记位点，在早胜牛生长早期进行肉用性能的预判，进而对具有优质肉用性状的牛只进行早期选留，可大大降低养殖成本，加快育种进程。

技术领域

本发明涉及生物技术领域，更具体的说是涉及一种基于肉用性状对早胜牛进行早期选留的分子标记及检测方法。

背景技术

早胜牛是陇东黄土高原生态环境条件下特有的畜种资源，属秦川牛的优秀类群，于1986年被列入《甘肃省畜禽品种志》。作为陇东地区养殖的主导肉牛群体，早胜牛适应性强、肉质细嫩、脂肪沉积好，大理石花纹丰富，具有生产优质高档牛肉的潜力。但是由于近年来的盲目引种，牛种混杂，造成一些固有特性及优势基因逐渐流失，肉用性能不稳定或有所下降。而肉用性能较差的个体在养殖早期很难通过表现型筛选，只有在屠宰后才能得知，增加了养殖成本，影响养殖户的经济效益。同时也对地方种质资源的保护和利用形成了较大威胁。因此，采用分子生物学方法对具有优质肉用性状的早胜牛进行早期选留是十分必要的。

钙蛋白酶(calpain，CAPN)是一种广泛存在于动物细胞中的依赖Ca²⁺激活的蛋白水解酶；具有一定的蛋白分解活性，主要位于肌纤维Z盘附近和肌质网膜上。由于钙蛋白酶可以在畜禽活体内及宰后的肌肉中进行肌原纤维的水解，直接参与肌肉生长和宰后肉品的嫩化过程，所以其编码基因被作为影响肌肉嫩度的候选基因加以广泛地研究。研究表明，CAPN1基因属calpain家族，在绝大多数哺乳动物组织中均有表达，直接参与肌肉中肌原纤维的水解过程，从而引起宰后肌肉嫩度的变化，通常作为影响肌肉嫩度性状的QTL位点。

因此，提供一种基于肉用性状对早胜牛进行早期选留的分子标记及检测方法是本领域技术人员亟需解决的问题。

发明内容

有鉴于此，本发明提供了一种基于肉用性状对早胜牛进行早期选留的分子标记及检测方法。

为了实现上述目的，本发明采用如下技术方案：

一种基于肉用性状对早胜牛进行早期选留的分子标记，所述分子标记位于牛CAPN1基因第11058bp处，其碱基为A或G，记为G11058A。

进一步，牛CAPN1基因第11058bp处的基因型为EE或EF或FF。

进一步，用于检测基于肉用性状对早胜牛进行早期选留的分子标记的引物组，所述引物组的具体引物序列如下：

F：5’-AGGTGACTTTGTGCTGCGTTTC-3’；SEQ ID NO.9；

R：5’-GGAGGGGCTCTGCCTTGCTG-3’；SEQ ID NO.10。

进一步，一种基于肉用性状对早胜牛进行早期选留的分子标记的检测方法，所述方法如下：以牛基因组DNA为模板，利用权利要求3所述的引物组进行PCR扩增，获得PCR产物，PCR产物经SSCP分析后分型。

进一步，所述PCR扩增反应体系为：2×Taq PCR Master Mix 12.5μL、上下游引物各1μL、DNA模板1μL，ddH₂O 9.5μL。

进一步，所述PCR扩增反应条件为：94℃预变性5min；94℃变性35s，60℃退火30s，72℃延伸30s，共32个循环；72℃延伸10min。