[发明专利]一种基因调控网络重构的方法、系统、设备及介质

权利要求书

1.一种基因调控网络重构的方法，其特征在于，包括以下步骤：

对基因表达数据进行编码，并对所述编码后的数据进行解码以得到重构数据；

对所述重构数据进行处理得到隐状态数组，对所述隐状态数组使用卷积神经网络检测时间模式进行特征提取；以及

基于提取的所述特征构建基因调控关系矩阵，并根据所述基因调控关系矩阵重构基因调控网络；

其中，对基因表达数据进行编码，并对所述编码后的数据进行解码以得到重构数据，包括：对所述基因表达数据进行正交变换以得到第一输出，保留所述第一输出中与平均值之差小于预设值的多个分量和所述多个分量对应的位置，并删除其他分量；以及在其他分量的位置补零以得到第二输出，并对所述第二输出进行反变换以得到重构数据；

所述基于提取的所述特征构建基因调控关系矩阵包括：计算每一行特征的权重，并基于权重对特征进行加权求和以得到第三输出，基于所述第三输出构建所述基因调控关系矩阵。

2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，还包括：

计算重构后的所述基因调控网络的评价指数，并判断所述评价指数是否均大于阈值。

3.一种基因调控网络重构的系统，其特征在于，包括：

编解码模块，配置用于对基因表达数据进行编码，并对所述编码后的数据进行解码以得到重构数据；

特征模块，配置用于对所述重构数据进行处理得到隐状态数组，对所述隐状态数组使用卷积神经网络检测时间模式进行特征提取；以及

重构模块，配置用于基于提取的所述特征构建基因调控关系矩阵，并根据所述基因调控关系矩阵重构基因调控网络；

其中，所述编解码模块配还置用于：对所述基因表达数据进行正交变换以得到第一输出，保留所述第一输出中与平均值之差小于预设值的多个分量和所述多个分量对应的位置，并删除其他分量；以及在其他分量的位置补零以得到第二输出，并对所述第二输出进行反变换以得到重构数据；

所述重构模块还配置用于：计算每一行特征的权重，并基于权重对特征进行加权求和以得到第三输出，基于所述第三输出构建所述基因调控关系矩阵。

4.根据权利要求3所述的系统，其特征在于，还包括：

检测模块，配置用于计算重构后的所述基因调控网络的评价指数，并判断所述评价指数是否均大于阈值。

5.一种计算机设备，其特征在于，包括：

至少一个处理器；以及

存储器，所述存储器存储有可在所述处理器上运行的计算机指令，所述指令由所述处理器执行时实现权利要求1-2任意一项所述方法的步骤。

6.一种计算机可读存储介质，所述计算机可读存储介质存储有计算机程序，其特征在于，所述计算机程序被处理器执行时实现权利要求1-2任意一项所述方法的步骤。