[发明专利]一种用于检测尿液JC病毒的试剂盒和方法在审
申请号: | 202010372819.6 | 申请日: | 2020-05-06 |
公开(公告)号: | CN111560473A | 公开(公告)日: | 2020-08-21 |
发明(设计)人: | 张鹏;唐春花;邢宽;何志健;谢珍;倪海钰;周权;何贵伦;安雪茹;李平;江晓琴 | 申请(专利权)人: | 南京实践医学检验有限公司 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/686;C12N15/11 |
代理公司: | 南京瑞华腾知识产权代理事务所(普通合伙) 32368 | 代理人: | 梁金娟 |
地址: | 210000 江苏省南京市江北新区*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 检测 尿液 jc 病毒 试剂盒 方法 | ||
1.一种用于检测尿液JC病毒的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒包括阳性对照组、待测组和阴性对照组;
所述阳性对照组包括2×Taq Mix、JC病毒引物JCV-F、JCV-R、JC病毒DNA和ddH2O;
所述待测组包括2×Taq Mix、JC病毒引物JCV-F、JCV-R和ddH2O;
所述阴性对照组包括2×Taq Mix、JC病毒引物JCV-F、JCV-R、和ddH2O;
其中所述JC病毒引物序列为:
JCV-F:GGTATACACAGCTTTTGAAGCAACA;
JCV-R:CCTTCCTTTCTCCAAAACTTTTTG。
2.根据权利要求1所述的一种用于检测尿液JC病毒的试剂盒,其特征在于:所述2×TaqMix包括Taq DNA聚合酶、dNTPs、标准Taq酶反应缓冲液、酶稳定剂和溴酚蓝染料。
3.一种根据权利要求1所述的用于检测尿液JC病毒的方法,其特征在于:按照先后顺序包括以下步骤:
步骤一:待测样本的获取:从待测尿液中提取DNA,获得待测样本;
步骤二:PCR反应液的配置:阳性对照组:总反应体系为50μL,其中包括2×Taq Mix 25-35μL、JCV-F 2μL、JCV-R 2μL、JC病毒DNA 2μL、ddH2O补至50μL;待测组:总反应体系为50μL,其中包括2×Taq Mix 25-35μL、JCV-F 2μL、JCV-R 2μL、样本DNA 2μL、ddH2O补至50μL;阴性对照组:总反应体系为50μL,其中包括2×Taq Mix 25-35μL、JCV-F 2μL、JCV-R 2μL、ddH2O补至50μL;
步骤三:PCR扩增:将上述配置的PCR反应液放入PCR仪中,并设定反应参数;
步骤四:将上述PCR反应液进行1%的琼脂糖凝胶电泳,将样本中与阳性对照组大小相同的条带回收;
步骤五:将样本回收的DNA进行纯化,然后连接载体送去测序;
步骤六:与JC病毒的序列进行比对,如果一致,则指示该样品中存在JC病毒,如不一致或者样本管中无与阳性对照相同大小的条带,则指示该样品中不存在JC病毒。
4.根据权利要求3所述的一种用于检测尿液JC病毒的方法,其特征在于:所述步骤三中反应参数为:94℃,3min;进入循环程序,94℃,30s;60℃,30s;72℃,20s,循环次数为40次;72℃,10min。
5.根据权利要求3所述的一种用于检测尿液JC病毒的方法,其特征在于:所述步骤一从尿液中提取DNA按先后顺序依次为:
尿液样本10ml左右,5000转离心10min,收集底部的沉淀,用枪小心吸走上方的液体,底部仍保留部分液体;
加入TE缓冲液1.5ml,混匀,8000转,离心5min,收集沉淀;
将上述沉淀37℃水浴温育1h后,加入0.2ml浓度为1mg/ml蛋白酶K,然后50℃水浴3h;
拿出冷却至室温,加入等体积的饱和酚溶液,转动离心管8min,接着5000rpm离心15min,吸取上层水相,移至另一离心管中;
向离心管中加入等体积的氯仿﹕异戊醇(24﹕1),上下转动混匀,5000rpm离心15min,吸取上层水相,移至另一离心管中;
加入1/5体积的3mol/L NaAc及2倍体积的预冷的无水乙醇,室温下慢慢摇动离心管,用玻璃棒挑取絮状DNA转入另一离心管中,加70%乙醇0.2ml,5000rpm离心15min,弃上清;
重复上述步骤一次:
室温放置离心管5min,然后加入20μL DEPC水溶解DNA,-20℃冰箱保存备用。
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