[发明专利]一套用于猫类品系鉴定的SNP位点

说明书

本发明公开了一套用于猫类品系鉴定的SNP位点，所述用于猫类品系鉴定的SNP位点包括表2中给出了SNP位点。本发明还公开了一种用于猫类品系鉴定的芯片，所述芯片用于测量表2中给出了SNP位点的等位基因。

技术领域

本发明属于动物的基因检测领域，尤其涉及一套用于猫类品系鉴定的SNP位点。

背景技术

宠物猫的品系鉴定对维护宠物市场公平交易极其重要。现有猫类遗传品系鉴定的方法目前主要分为两大类。第一类：通过猫类家谱信息判断品系。第二类：通过猫的外观性状进行品系判断。

上述两类产品的技术缺点如下：第一类：1)需要猫类一直留存有相应的家谱文件，这些文件一旦丢失或者被篡改(宠物贩为了欺骗消费者用此手段已经屡见不鲜)，将会对宠物品系的判断带来很大的难度。2)市场上流通的，或者宠物主人饲养的混种宠物猫种，绝大多数都没有系统的家谱文件，所以根本无法准确判断其品系组成，造成无法针对其品系成分构成给予针对性的医疗和养育指导。第二类：1)仅仅通过宠物外观，很难区分出品系接近的猫种。2)主观的判断导致不同人给出的结果不同。3)无法定量判断出品系的纯度有多高。4)对于多品种的混血，由于混杂程度高，几本无法从外观准确判断品系组成。

针对以上原因，亟需基于DNA信息的品系判定手段，对猫品种进行客观准确地科学判定。然而，此类技术尚属空白。

发明内容

为了解决现有技术所存在的问题，本发明提出的一套用于猫类品系鉴定的SNP位点，通过计算机算法，从猫类6万个DNA SNP标记中选择了最有代表性的1485个位点，用这1485个位点的DNA数据判断猫类的品系组成。虽然已有的生物芯片可以提供这6万个SNP的基因型信息，但是对于猫品种鉴定，证明了仅仅需要检测本申请中找到的1485个SNP就能准确判定品系，因此针对这1485个SNP的检测将大大降低品系鉴定的成本(靶向二代测序可以对1485个SNP进行检测，成本控制在150元以内，而猫的6万位点SNP芯片尚无对外销售，且成本在700元以上)。

为了实现上述目的，本发明采用了如下技术方案：

在第一方面，本发明提供了一套用于猫类品系鉴定的SNP位点，所述SNP位点包括表2中给出了SNP位点。

优选的，所述SNP位点包括表1中给出了SNP位点。

优选的，所述猫类品系包括阿比西尼亚猫，美国短毛猫、孟加拉豹猫和中华田园猫。

在第二方面，本发明提供了一种用于猫类品系鉴定的芯片，所述芯片用于测量表2中给出了SNP位点的等位基因。

优选的，所述芯片用于测量表1中给出了SNP位点的等位基因。

优选的，所述猫类品系包括阿比西尼亚猫，美国短毛猫、孟加拉豹猫和中华田园猫。

优选的，所述芯片是Illumina芯片。

与现有技术相比，本发明采用唾液或者血液中的DNA信息进行品系判断。与通过Illumina基因芯片相比，本发明用到的位点数更少。

附图说明

通过以下附图对本发明进行说明

图1是A的鉴定结果，右列为仅用1485个SNP位点做的分析，左列为全基因组6万个位点做的分析；

图2是B的鉴定结果，右列为仅用1485个SNP位点做的分析，左列为全基因组6万个位点做的分析；

图3是C的鉴定结果，右列为仅用1485个SNP位点做的分析，左列为全基因组6万个位点做的分析；

图4是D的鉴定结果，右列为仅用1485个SNP位点做的分析，左列为全基因组6万个位点做的分析。

具体实施方式