[发明专利]一种蛋白结构的对接方法及分布式蛋白结构对接系统在审
申请号: | 202010388918.3 | 申请日: | 2020-05-09 |
公开(公告)号: | CN111681703A | 公开(公告)日: | 2020-09-18 |
发明(设计)人: | 谢敬聃;袁普卫;王志伟;王晶晶 | 申请(专利权)人: | 北京纽伦智能科技有限公司 |
主分类号: | G16B15/30 | 分类号: | G16B15/30 |
代理公司: | 北京金信知识产权代理有限公司 11225 | 代理人: | 范继晨 |
地址: | 100000 北京市海*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 蛋白 结构 对接 方法 分布式 系统 | ||
1.一种蛋白结构的对接方法,其特征在于,包括:
获取待处理任务的所有蛋白结构,根据所述待处理任务创建至少一个线程任务,其中,所述线程任务用于处理所述待处理任务中的至少一个蛋白结构;
将所有所述线程任务分配至至少一个运算节点中,使所述运算节点执行所述线程任务中的蛋白结构的对接,并生成所述线程任务对接的评估数据,其中,每个所述运算节点至少分配有一个线程任务。
2.根据权利要求1所述的对接方法,其特征在于,所述在获取待处理任务的所有蛋白结构之前,还包括:
接收预设算力;
根据所述预设算力从所有运算资源中为所述待处理任务分配至少一个运算节点,其中,所述运算资源至少包括以下之一:服务器、中央处理器、硬盘、云盘。
3.根据权利要求1所述的对接方法,其特征在于,所述根据所述待处理任务创建至少一个线程任务之后,还包括:
对每个所述线程任务中的所述蛋白结构进行第一预设处理,其中,所述第一预设处理至少包括以下之一:蛋白结构完整性验证、蛋白结构的文件的有效性验证、蛋白结构的文件的存储位置验证。
4.根据权利要求1所述的对接方法,其特征在于,所述将所有所述线程任务分配至至少一个运算节点中,使所述运算节点执行所述线程任务中的蛋白结构的对接,并生成所述线程任务对接的评估数据之后,还包括:
接收所有所述运算节点发送的所述评估数据,对所述评估数据进行第二预设处理,得到所述待处理任务的蛋白结构对接结果,其中,所述第二预设处理至少包括以下之一:所述评估数据的有效性分析、所述评估数据的过滤、所述评估数据的排序。
5.根据权利要求1至4中任一项所述的对接方法,其特征在于,还包括:
接收预设对接位置信息;
在所述蛋白结构上确定所述预设对接位置对应的角度范围;
创建第一线程任务用于处理所述蛋白结构上处于所述角度范围内的抗体结合位点,并将所述第一线程任务分配至第一运算节点。
6.一种分布式的蛋白结构对接系统,其特征在于,包括:
中央处理单元,用于在获取待处理任务的所有蛋白结构后,创建至少一个线程任务,并将所有所述线程任务分配至至少一个运算节点中,其中,所述线程任务用于处理所述待处理任务中的至少一个蛋白结构;
至少一个运算节点,用于执行所述线程任务中的蛋白结构的对接,并生成所述线程任务对应的评估数据,其中,每个所述运算节点至少分配有一个线程任务。
7.根据权利要求6所述的对接系统,其特征在于,所述中央处理单元还用于:
接收预设算力;
根据所述预设算力从所有运算资源中为所述待处理任务分配至少一个运算节点,其中,所述运算资源至少包括以下之一:服务器、中央处理器、硬盘、云盘。
8.根据权利要求6所述的对接系统,其特征在于,所述中央处理单元还用于:
在创建至少一个线程任务后,对每个所述线程任务中的所述蛋白结构进行第一预设处理,其中,所述第一预设处理至少包括以下之一:蛋白结构完整性验证、蛋白结构的文件的有效性验证、蛋白结构的文件的存储位置验证。
9.根据权利要求6所述的对接系统,其特征在于,所述运算节点还用于,将每个线程任务的评估数据发送至所述中央处理单元;
所述中央处理单元还用于,在接收到所述运算节点发送的所述评估数据后,对所述评估数据进行第二预设处理,得到所述待处理任务的蛋白结构对接结果,其中,所述第二预设处理至少包括以下之一:所述评估数据的有效性分析、所述评估数据的过滤、所述评估数据的排序。
10.根据权利要求6至9中任一项所述的对接系统,其特征在于,所述中央处理单元还用于:接收预设对接位置信息;在所述蛋白结构上确定所述预设对接位置对应的角度范围;创建第一线程任务用于处理所述蛋白结构上处于所述角度范围内的抗体结合位点,并将所述第一线程任务分配至第一运算节点;
所述第一运算节点,用于执行所述第一线程任务中的所述蛋白结构在所述角度范围内的对接。
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