[发明专利]一种使用叶绿体基因组鉴定罂粟的方法

说明书

本发明提供了一种使用叶绿体基因组鉴定罂粟的方法，属于植物分子鉴定技术领域，包括以下步骤：1)提取待测样本和罂粟属植物的叶绿体总DNA，将所述叶绿体总DNA制备二代测序文库；2)将所述步骤1)制备的二代测序文库进行测序，得到测序结果；3)将所述步骤2)得到的测序结果进行拼接、注释和比对后，利用Paup软件构建最大简约树；当待测样本与罂粟聚在一枝、数值支持率为100％，待测样本为罂粟。采用本发明提供的方法能够快速、准确地检测待测样品是否为罂粟。

技术领域

本发明属于植物分子鉴定技术领域，尤其涉及一种使用叶绿体基因组鉴定罂粟的方法。

背景技术

罂粟科(Papaveracea)植物种类繁多，大多为草本，稀为亚灌木、小灌木，广泛分布在全世界和亚热带地区。该科植物物种丰富，多具有药用价值和优化、美化环境的观赏特性，具有重要的生态和经济价值。该科在全世界有38个属约700个种。罂粟属(Papaver)是罂粟科的一个大属,约有100余种，该属在我国有7个种：罂粟(P.somniferum)、虞美人(P.rhoeas)、黑环罂粟(P.pavoninum)、长荚罂粟(P.dubium)、野罂粟(P.nudicaule)、灰毛罂粟(P.canescens)和长白山罂粟(P.radicatum)。其中罂粟因其具有毒性最为出名，该种植物含有一种叫吗啡的生物碱，将该生物碱乙酰化可用来制作海洛因，是世界上最为臭名昭著的三大毒品之一。

罂粟植物一经发现就必须由公安部门铲除，任何个人和单位均不可种植该种植物。因此，该属植物难以跨国或跨地区引种栽培。但该属的其它植物，却不含毒性，甚至还是园林园艺中受人喜爱的草本花卉。如虞美人，因其花大、花色艳丽、花期长而受园艺工作者们的青睐。该属植物形态特征相似，特别是在苗期，因为缺少花、果实，是无法分辨出该属植物。这样的情况常常使公安部门束手无策，但缉毒工作又不能耽搁，也使得缉毒工作者耗费大量的人力、物力来预防毒品的滋生，而又常常会顾此失彼、徒劳无功。

发明内容

有鉴于此，本发明的目的在于提供一种使用叶绿体基因组鉴定罂粟的方法，能够快速准确地鉴定待测样本是否为罂粟。

为了实现上述发明目的，本发明提供了以下技术方案：

本发明提供了一种使用叶绿体基因组鉴定罂粟的方法，包括以下步骤：

1)提取待测样本和罂粟属植物的叶绿体总DNA，将所述叶绿体总DNA制备二代测序文库；

2)将所述步骤1)制备的二代测序文库进行测序，得到测序结果；

3)将所述步骤2)得到的测序结果进行拼接、注释和比对后，利用Paup软件构建最大简约树；

当待测样本与罂粟聚在一枝、数值支持率为100％，待测样本为罂粟。

优选的，所述罂粟属植物包括罂粟、灰毛罂粟、长荚罂粟、野罂粟、黒环罂粟、长白山罂粟和虞美人。

优选的，还包括提取疆罂粟属植物的叶绿体总DNA，所述疆罂粟属植物包括红花疆罂粟。

优选的，所述步骤3)拼接使用的软件包括MITObim v1.8。

优选的，所述步骤3)比对使用的软件包括Geneious v9.1.4。

优选的，使用改良2×CTAB法提取叶绿体总DNA。

本发明提供了一种使用叶绿体基因组鉴定罂粟的方法，包括以下步骤：1)提取待测样本和罂粟属植物的叶绿体总DNA，将所述叶绿体总DNA制备二代测序文库；2)将所述步骤1)制备的二代测序文库进行测序，得到测序结果；3)将所述步骤2)得到的测序结果进行拼接、注释和比对后，利用Paup软件构建最大简约树；当待测样本与罂粟聚在一枝、数值支持率为100％，待测样本为罂粟。采用本发明提供的方法能够快速、准确地检测待测样品是否为罂粟。

附图说明