[发明专利]尿毒症标志物及其应用

说明书

本发明提供一种尿毒症标志物及其应用。该尿毒症标志物，包括以下至少一种：ESRRG、TEAD2、HOXC10、TEAD1、FOS、GRHL1、PAX7、PAX3、PBX1、MAFG、GCM2、NR3C1、NR3C2、JUN、PBX2、SCRT2、MYBL2、SPDEF、STAT1、NEUROG2、JDP2、FOSB。发明人借助scATAC‑seq技术发现尿毒症患者与正常健康对照组人群的样本中，多个转录因子的表达水平存在显著差异，因此，可以将这些差异表达的转录因子作为标志物用于尿毒症的诊断、预后评估或筛药。

技术领域

本发明涉及肾病技术领域，尤其是涉及一种尿毒症标志物及其应用。

背景技术

尿毒症(uremia)是指各种原因导致的肾脏功能进行性减退，直至肾功能丧失并最终进入终末阶段时所出现的一系列临床表现和代谢紊乱所组成的临床综合征。紊乱的内环境容易引起慢性肾脏病(chronic kidney disease，CKD)患者的表观遗传特征发生改变，并通过表观遗传机制影响基因表达，从而加速CKD向尿毒症(终末期肾脏病)发展。现阶段越来越多的研究也证明了这一点。研究显示，CKD患者中均有不同程度的DNA甲基化，同时，DNA甲基化也受到尿毒症成分的影响。CKD5期患者的炎性反应会导致异常的DNA高甲基化，并且与不良预后有关。而在对进行透析的肾脏肿瘤患者和肾功能正常的肾脏肿瘤患者开展表观遗传学检测时发现，前者的各种基因呈现出DNA的高甲基化，这证明CKD和透析可能会促进DNA的高甲基化。上述实验结果表明，尿毒症环境改变了机体表观遗传的特征，进而导致转录水平改变。而与基因突变不同的是，表观遗传改变是动态的，而且可能是可逆的，因此从表观遗传角度分析疾病的发生发展有重大意义。

ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin with highthroughput sequencing)是以高通量测序为基础的从表观遗传角度研究染色质开放性(或称染色质可进入性)的新兴科研技术，原理是利用转座酶Tn5容易与开放染色质进行特异结合的特性，对Tn5酶所捕获到的DNA序列片段进行测序，将测序结果与人类基因组信息比对，分析DNA的开放区域，通过进一步的motif分析，在全基因组范围预测转录因子结合位点(Transciption Factor Binding Site，TFBS)。与传统的DNase-Seq及FAIRE-seq等研究开放染色质的方法相比，ATAC-seq以细胞量要求少、低成本、短周期、大数据、无需抗体富集、可以在全基因组范围内检测染色质的开放状态等优势。目前单细胞ATAC-Seq在染色体开放性图谱分析、表观修饰差异研究、胚胎发育表观遗传修饰、肿瘤发生表观机制研究、肿瘤异质性与分型研究、疾病潜在标志物预测等领域已有较为广泛的应用。

目前关于尿毒症及其相关并发症的发生发展机制仍不清楚，其特异性生物标志物目前仍未被发现。因此，有必要借助ATAC-seq技术发现尿毒症特异性生物标志物。

发明内容

本发明旨在至少解决现有技术中存在的技术问题之一。为此，本发明提出一种尿毒症标志物及其应用。

第一方面，本发明的一个实施例提供了一种尿毒症标志物，包括以下至少一种：ESRRG、TEAD2、HOXC10、TEAD1、FOS、GRHL1、PAX7、PAX3、PBX1、MAFG、GCM2、NR3C1、NR3C2、JUN、PBX2、SCRT2、MYBL2、SPDEF、STAT1、NEUROG2、JDP2、FOSB。

本发明实施例的肠道菌群标志物至少具有如下有益效果：

发明人借助scATAC-seq技术发现尿毒症患者与正常健康对照组人群的样本中，多个转录因子的表达水平存在显著差异，因此，可以将这些差异表达的转录因子作为标志物用于尿毒症的诊断、预后评估或筛药。