[发明专利]一种精准、快速的显微图像拼接方法及系统在审
申请号: | 202010405567.2 | 申请日: | 2020-05-14 |
公开(公告)号: | CN111626933A | 公开(公告)日: | 2020-09-04 |
发明(设计)人: | 谷秀娟;向北海;许会 | 申请(专利权)人: | 湖南国科智瞳科技有限公司 |
主分类号: | G06T3/40 | 分类号: | G06T3/40;G06T5/00;G06T7/00;G06T7/62;G06K9/62 |
代理公司: | 长沙国科天河知识产权代理有限公司 43225 | 代理人: | 邱轶 |
地址: | 410000 湖南省长沙市高新开发区尖山湖社*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 精准 快速 显微 图像 拼接 方法 系统 | ||
1.一种精准、快速的显微图像拼接方法,其特征在于,包括:
获取局部显微图像序列,对所述局部显微图像序列中每张局部显微图像进行去噪处理;
对去噪处理后的局部显微图像进行细胞检测,获得局部显微图像中的细胞个数及细胞位置信息,并估算获得细胞核的面积大小;
根据所述局部显微图像中的细胞个数及细胞位置信息,利用基于亮度的归一化互相关特征算法,获得所述局部显微图像中相邻局部显微图像的最值重叠区域和平移变换;
根据所述细胞核的面积大小计算所述最值重叠区域中细胞核面积的重叠率,将所述重叠率与预先设定的重叠率阈值进行比较,获得所述平移变换的置信度;
根据所述置信度,通过搜索最小误差路径获得所述局部显微图像序列中所有局部显微图像的拼接顺序;
根据所述平移变换,按照所述拼接顺序逐一将所述局部显微图像序列中的局部显微图像进行拼接。
2.如权利要求1所述的精准、快速的显微图像拼接方法,其特征在于,获取局部显微图像序列的步骤,包括:
对病理切片进行预扫描,确定所述病理切片的扫描区域;
根据所述扫描区域设定显微镜载物台或显微镜物镜的轨迹,以使得在所述轨迹的每个位置采集的局部显微图像具有最小重叠区域;
控制显微镜载物台或显微镜物镜按照所述轨迹进行运动,在每个位置进行自动聚焦并采集当前视野下的局部显微图像,获得多张局部显微图像,并记录每张局部显微图像的位置信息和视野编号,所述多张局部显微图像构成局部显微图像序列。
3.如权利要求1所述的精准、快速的显微图像拼接方法,其特征在于,对所述局部显微图像序列中每张局部显微图像进行去噪处理的步骤,包括:
利用各向异性扩散滤波对所述局部显微图像序列中每张所述局部显微图像进行去噪处理;所述各向异性扩散滤波的计算公式为:
It+1=It+λ(cNx,y▽N(It)+cSx,y▽S(It)+cEx,y▽E(It)+cWx,y▽W(It)) (1)
式中,It+1为迭代t+1次的局部显微图像;It为迭代t次的局部显微图像;λ为权重系数;▽E(It)、▽S(It)、▽W(It)、▽N(It)分别为东、南、西、北四个方向上的散度;cEx,y、cSx,y、cWx,y、cNx,y分别表示东、南、西、北四个方向上的导热系数。
4.如权利要求1所述的精准、快速的显微图像拼接方法,其特征在于,对去噪处理后的局部显微图像进行细胞检测,获得局部显微图像中的细胞个数及细胞位置信息的步骤,包括:
利用阈值分割方式对去噪处理后的局部显微图像进行细胞检测,将局部显微图像分割成背景区域和目标区域;
根据所述目标区域,获得局部显微图像中的细胞个数及细胞位置信息,并估算获得细胞核的面积大小。
5.如权利要求1所述的精准、快速的显微图像拼接方法,其特征在于,对去噪处理后的局部显微图像进行细胞检测,获得局部显微图像中的细胞个数及细胞位置信息的步骤,包括:
利用深度学习方式对去噪处理后的局部显微图像进行细胞检测,将局部显微图像分割成背景区域和目标区域;
根据所述目标区域,获得局部显微图像中的细胞个数及细胞位置信息,并估算获得细胞核的面积大小。
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