[发明专利]一种增强CRISPR/Cas9系统基因编辑效率的方法在审
申请号: | 202010408492.3 | 申请日: | 2020-05-14 |
公开(公告)号: | CN111621515A | 公开(公告)日: | 2020-09-04 |
发明(设计)人: | 杨素;朱诚 | 申请(专利权)人: | 中国计量大学 |
主分类号: | C12N15/82 | 分类号: | C12N15/82;C12N15/29 |
代理公司: | 北京神州信德知识产权代理事务所(普通合伙) 11814 | 代理人: | 刘真 |
地址: | 310000 浙江省*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 增强 crispr cas9 系统 基因 编辑 效率 方法 | ||
1.一种增强CRISPR/Cas9系统基因编辑效率的方法,其特征在于,该方法包括:
利用U3表达盒与U6a表达盒连接的构造工序、基于U3表达盒和U6a连接生成的产物与MH质粒连接的重组工序以及重组后的产物导入到大肠杆菌中的工序,其中,利用U3表达盒与U6a表达盒连接的构造工序的具体步骤为:
采用Overlapping PCR法分别得到U3表达盒SEQ ID NO:2片段和U6a表达盒SEQ ID NO:3片段,并将U3表达盒和U6a表达盒连接起来。包括Overlapping PCR法的三个反应体系:PCR1、PCR2、PCR3,PCR1的上下游引物分别为:U-F、gRNA-R;PCR2的上游引物为B1’-M、B2’-M,下游引物为B2-M、BL-M;PCR3的引物为U3’、U6a’,所述引物序列为:
B1’-M:5’-caacgcttctgtttcgcaagGTGGAATCGGCAGCAAAGG-3’,
B2-M:5’-cgagcccaagacactcctctGGTCCATCCACTCCAAGCTC-3’,
B2’-M:5’-agaggagtgtcttgggctcgCACTGGAATCGGCAGCAAAGG-3’,
BL-M:5’-TCGATGTTGACGAAGCGAGTCCATCCACTCCAAGCTCTTG-3’,
U3’:5’-TTCAGAGGTCTCTCTCGACTAcaacgcttctgtttcgcaag-3’,
U6a’:5’-AGCGTGggtctcGaccgACGCGTTCGATGTTGACGAAGCGAGT-3’;
PCR1:将靶点序列引入到启动子的下游和gRNA序列的上游,此轮PCR包括四个PCR反应;
PCR2:将启动子片段和gRNA片段连接在一起,得到U3表达盒和U6a表达盒,此轮PCR包括两个PCR反应;
PCR3:将U3和U6a表达盒产物连接起来,同时使U3片段的5’端和U6a片段的3’端带上BsaⅠ酶切位点,此轮PCR包括一个PCR反应。
2.根据权利要求1所述的一种增强CRISPR/Cas9系统基因编辑效率的方法,其特征在于:在利用U3表达盒与U6a表达盒连接的构造工序前,还具有对质粒的定点工序。
3.根据权利要求2所述的一种增强CRISPR/Cas9系统基因编辑效率的方法,其特征在于:每完成一个反应体系进行一次电泳检测。
4.根据权利要求1所述的一种增强CRISPR/Cas9系统基因编辑效率的方法,其特征在于:所述限制性内切酶为KOD FX高保真酶。
5.根据权利要求1所述的一种增强CRISPR/Cas9系统基因编辑效率的方法,其特征在于:基于U3表达盒和U6a连接生成的产物与MH质粒连接的重组工序为对U3表达盒与U6a表达盒连接的产物进行纯化,再通过酶切使U3表达盒与U6a表达盒连接的产物与MH质粒分别露出互补的粘性末端,酶切后再利用天根通用型DNA纯化回收试剂盒对U3表达盒与U6a表达盒连接的产物与MH质粒进行纯化,最后通过T4连接酶将露出互补粘性末端的U3表达盒与U6a表达盒连接的产物和MH质粒连接起来。
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