[发明专利]一种基于RBIP标记鉴定甘薯品种的方法有效
申请号: | 202010419792.1 | 申请日: | 2020-05-18 |
公开(公告)号: | CN111647678B | 公开(公告)日: | 2022-04-26 |
发明(设计)人: | 孟羽莎;王寅;赖齐贤;黄超 | 申请(专利权)人: | 浙江省农业科学院 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 杭州求是专利事务所有限公司 33200 | 代理人: | 邱启旺 |
地址: | 310021 *** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 rbip 标记 鉴定 甘薯 品种 方法 | ||
1.一种用于鉴定或辅助鉴定甘薯品种的RBIP引物组,其特征在于,由LTR-10、LTR-11、LTR-13、LTR-20、LTR-37和LTR-38引物对组成;
所述引物对 LTR-10包括如SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列;
所述引物对 LTR-11包括如SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4所示的核苷酸序列;
所述引物对 LTR-13包括如SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6所示的核苷酸序列;
所述引物对 LTR-20包括如SEQ ID NO:7和SEQ ID NO:8所示的核苷酸序列;
所述引物对 LTR-37包括如SEQ ID NO:9和SEQ ID NO:10所示的核苷酸序列;
所述引物对 LTR-38包括如SEQ ID NO:11和SEQ ID NO:12所示的核苷酸序列。
2.一种权利要求1所述RBIP引物组在鉴定或辅助鉴定甘薯品种中的应用。
3.一种PCR试剂盒,其特征在于,包括权利要求1所述的RBIP引物组,其中,各对引物对中各条引物的摩尔比为1:1;各对引物对中各条引物的浓度为10 μmol/L。
4.一种应用权利要求1 RBIP引物组鉴定甘薯品种的方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)分别使用LTR-10、LTR-11、LTR-13、LTR-20、LTR-37和LTR-38引物对对不同已知甘薯品种的DNA进行RBIP-PCR引物扩增得到不同甘薯品种的6对RBIP引物扩增产物;
(2)电泳检测步骤(1)中得到的待检测甘薯的6对RBIP-PCR引物扩增产物,根据电泳结果确定有效位点,在相同迁移位置上,扩增带型以“1”、“0”分别表示条带的有和无,构建每个甘薯品种中6对RBIP-PCR引物扩增产物的“1”、“0” 数字指纹图谱;每个甘薯品种包含6个数字指纹图谱,所有甘薯品种的数字指纹图谱构成甘薯品种数字指纹图谱库;
(3)将待鉴定甘薯样品依照步骤(1)和步骤(2)进行RBIP-PCR引物扩增并电泳得到待鉴定甘薯样品的数字指纹图谱;将待鉴定甘薯样品的数字指纹图谱与甘薯品种数字指纹图谱库进行比对:
若待鉴定甘薯样品的数字指纹图谱与图谱库中某一品种甘薯数字指纹图谱中至少有2个带型不同,则待鉴定甘薯样品与该品种甘薯为或候选为不同品种;若甘薯样品中某两个甘薯品种的数字指纹图谱中最多有1个带型不同,则该两个品种为或候选为相同品种。
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