[发明专利]禽流感病毒抗原表位筛选方法和应用

说明书

本申请涉及抗原筛选技术领域，提供了一种禽流感病毒抗原表位筛选方法，先判断所述目的禽流感病毒HA蛋白的具有遗传稳定性的保守性区域；再构建所述目的禽流感病毒的HA蛋白的三维结构，进一步的，对预测得到的CTL抗原表位、Th抗原表位、B细胞抗原表位进一步进行筛选，筛选位于所述保守性区域且所述三维结构的茎部区域的目的CTL抗原表位、目的Th抗原表位以及目的B细胞抗原表位。该筛选方法结合了病毒序列的保守性区域以及其三维结构，同时结合软件预测得到的抗原表位的信息，可以准确地、快速地筛选得到目的抗原表位，筛选得到的目的抗原表位位于HA蛋白的稳定区域，具有一定的稳定性和有效性；该筛选方法操作简单，可操作性强。

技术领域

本申请属于抗原筛选技术领域，尤其涉及一种禽流感病毒抗原表位筛选方法和应用。

背景技术

禽流感(AI)是一种重要的人、畜和禽共患的传染病，其致病原禽流感病毒(AIV)易于发生抗原漂移和抗原改变，从而快速产生新流行毒株并导致在人和禽中间大暴发流行。

禽流感病毒(AIV)属甲型流感病毒。流感病毒属于RNA病毒的正黏病毒科，分甲、乙、丙3个型。其中，甲型流感病毒呈多形性，球形直径80～120nm，有囊膜。基因组为分节段单股负链RNA。依据其外膜血凝素(H)/和神经氨酸酶(N)蛋白抗原性的不同，可分为16个H亚型(H1～H16)和9个N亚型(N1～N9)。感染人的禽流感病毒亚型主要为H5N1、H9N2、H7N7，其中感染H5N1的患者病情重，病死率高。

禽流感病毒(AIV)作为一种RNA病毒，其基因组具有较高突变几率和频繁重组的特性。血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)是禽流感病毒的主要表面抗原蛋白，目前大多数流感疫苗都以病毒的特征蛋白之一——血凝素HA蛋白的头部外露区域进行抗原设计，但是，其变异后会导致AIV抗原性、致病性和毒力发生改变，这导致了目前得到的抗原表位易由于血凝素HA蛋白的头部区域的高变异性而影响了稳定性和有效性，导致当季流感疫苗株与病毒流行株的差异，得到的抗原表位无法具有通用性和稳定性。

发明内容

本申请的目的在于提供一种禽流感病毒抗原表位筛选方法和应用，旨在解决现有技术中禽流感病毒抗原表位的筛选方法通用性差，筛选得到的抗原表位稳定性弱的问题。

为实现上述申请目的，本申请采用的技术方案如下：

第一方面，本申请提供一种禽流感病毒抗原表位筛选方法，包括如下步骤：

确定所述目的禽流感病毒的HA蛋白的氨基酸序列的保守性区域；

对所述目的禽流感病毒的HA蛋白的氨基酸序列进行三维结构模拟，得到目的禽流感病毒的HA蛋白的三维结构；

对所述目的禽流感病毒的HA蛋白的CTL抗原表位、Th抗原表位、B细胞抗原表位分别进行预测，得到预测CTL抗原表位、预测Th抗原表位、预测B细胞抗原表位；

将所述预测CTL抗原表位、所述预测Th抗原表位以及所述预测B细胞表位与所述目的禽流感病毒的HA蛋白的三维结构进行比对，确定所述预测CTL抗原表位、所述预测Th抗原表位以及所述预测B细胞抗原表位在所述目的禽流感病毒的HA蛋白的三维结构的位置，筛选位于所述保守性区域且所述三维结构的茎部区域的目的CTL抗原表位、目的Th抗原表位以及目的B细胞抗原表位。

第二方面，本申请提供一种禽流感病毒抗原表位筛选方法的应用，所述禽流感病毒抗原表位筛选方法用于禽流感疫苗的制备。