[发明专利]用于检测自闭症基因组拷贝数变异的引物组、探针组及试剂盒

说明书

本发明公开了一种用于检测自闭症患者基因组变异的引物组、探针组及试剂盒，通过引物组SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.8和探针SEQ ID NO.9~SEQ ID NO.12可以检测自闭症相关的SHANK3、CHRNA7、GABRB3基因拷贝数的变异。本发明具有灵敏度高，检测时间短，成本低廉的特点。

技术领域

本发明涉遗传病检测领域，特别涉及用于检测自闭症患者相关基因拷贝数变异的引物组、探针组及试剂盒。

背景技术

自闭症又称孤独症（autism）是常见神经系统发育失调导致的广泛性发育障碍，是复杂的遗传性多基因神经精神紊乱疾病。1943年，美国医生Kanner报道了11例行为异常的患者，并命名为“早期婴儿孤独症”，认为是儿童精神分裂症的一个亚型。经历了七十多年的研究，学术界和临床医生对自闭症的定义和认识已经发生了较大变化，对自闭症的认识已经从最初的看成一种心理疾病转变为看作一种生理疾病。而自闭症囊括的范围也逐渐增大，2013年美国精神障碍诊断与统计手册（Diagnostic and Statistical Manual ofMental Disorders）第五版（简称DSM-Ⅴ），修订了自闭症的定义，统称为自闭症谱系障碍（Autism Spectrum Disorder，简称ASD）。

自闭症的主要临床行为表现包括人际交流障碍、语言障碍和重复性刻板行为，病人同时在智力、感觉和情绪等方面也有相应的特征。患儿从出生开始就可以表现出与其他正常儿童不同的差异。自闭症在儿童的发病率为1%～2%，男性是女性4倍，根据WHO统计，在中国有150万-780万的孤独症患者。患有自闭症的儿童不仅身心健康受到损伤，且也给家庭带来沉重的经济和精神压力，因此自闭症在我国已经成为了一个急需关注的公共健康问题。

影响自闭症发生的基因有许多。在调查分析自闭症患者在基因组水平上的变异后，发现存在多种类型和多位点的变异，既有染色体区域的缺失重复，也有基因上的SNP。这些变异既有从父母遗传的也有新发的。对变异的基因进行分析，发现变异主要发生在与突触、染色质重构、转录、神经递质传递有关的基因上。但单个基因在自闭症群体中出现的概率不足1%。对神经细胞连接因子基因进行研究，发现SHANK1、SHANK2、SHANK3，NRXN1、NRXN2、NRXN3，NLGN3、NLGN4等基因都与自闭症发生有关。

传统的自闭症筛查方法主要是根据自闭症诊断标准，对待检者进行人际关系、语言交流、知觉等方面的表象观察，并依照标准进行确诊。这些方法的不足之处是只能患者进行初步的自闭症筛查，无法对患者基因变异进行确诊，而且在诊断时容易发生漏诊和误诊的情况，延误患者治疗，造成重症自闭症儿童的出现。因此，市场上迫切需要一种准确、快捷、成本低廉的自闭症诊断方法，对患者进行快速确诊。

发明内容

本发明的主要目的在于提出一种准确、快速、灵敏的用于检测自闭症患者多基因拷贝数变异的引物组、探针组及试剂盒。

本发明的目的是针对现有技术中的不足，提供一种用于检测自闭症患者多基因拷贝数变异的引物组。

本发明的第二目的是，提供一种提供一种用于检测自闭症患者多基因拷贝数变异的探针组。

本发明的第三目的是，提供一种提供一种用于检测自闭症患者多基因拷贝数变异的试剂盒。

为实现上述目的，本发明采取的技术方案是：一种用于检测自闭症患者多基因拷贝数变异的PCR引物组，所述的引物组检测的基因包括NRXN1、SHANK3和CHRNA7基因。

进一步地，所述的引物组还包括检测内参基因RPP30的引物SEQ ID NO.7和SEQ IDNO.8。

为实现上述第二个目的，本发明采取的技术方案是：所述探针组包括SEQ ID NO.9~ SEQ ID NO.12，每一条探针两端分别带有荧光基团和淬灭基团。