[发明专利]一种黄颡鱼抗红头病性状相关的SNP标记、筛选方法及应用在审
申请号: | 202010433162.X | 申请日: | 2020-05-21 |
公开(公告)号: | CN111662987A | 公开(公告)日: | 2020-09-15 |
发明(设计)人: | 梅洁;熊阳;郑小珍;皇培培;郭稳杰;王帅;王宇宏 | 申请(专利权)人: | 华中农业大学 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12N15/11 |
代理公司: | 北京金智普华知识产权代理有限公司 11401 | 代理人: | 杨采良 |
地址: | 430000 湖*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 黄颡鱼抗 红头 性状 相关 snp 标记 筛选 方法 应用 | ||
1.一种黄颡鱼抗红头病性状相关的SNP标记,所述SNP标记为黄颡鱼CypA基因组序列的第528个核苷酸T或C。
2.如权利要求1所述的一种黄颡鱼抗红头病性状相关的SNP标记在黄颡鱼选育中的应用。
3.如权利要求1所述的一种黄颡鱼抗红头病性状相关的SNP标记在制备用于检测或治疗黄颡鱼红头病的试剂或试剂盒中的应用。
4.CypA基因在黄颡鱼选育中的应用。
5.CypA基因在制备用于检测或治疗黄颡鱼红头病的试剂或试剂盒中的应用。
6.根据权利要求5所述的应用,其特征在于:所述红头病由感染鮰爱德华氏菌引起。
7.一种黄颡鱼抗红头病性状相关的SNP标记筛选方法,其特征在于,包括以下步骤:
将多个个体基因组DNA混池测序;
将目标基因序列与黄颡鱼的参考基因组序列进行比对,分析,初步预测出目标基因中的候选SNP位点;
设计引物扩增黄颡鱼基因组序列中的候选SNPs,并测序、分析候选位点的多态性;
对红头病抗病组和易感组黄颡鱼进行目标基因序列扩增,测序,分析候选位点的多态性,并与混池测序筛选的多态性位点进行关联分析,筛选出重合的多态性位点;
构建表达黄颡鱼目标基因的转基因鱼系,以野生斑马鱼为对照,在转基因鱼系组和野生斑马鱼组内分别设计病菌注射组和对照组,观察黄颡鱼的生命状态,验证目标基因与目标性状的关联性。
8.根据权利要求7所述的一种黄颡鱼抗红头病性状相关的SNP标记筛选方法,其特征在于:所述目标基因为CypA基因。
9.根据权利要求8所述的一种黄颡鱼抗红头病性状相关的SNP标记筛选方法,其特征在于:所述SNP标记为CypA基因组序列的第528个核苷酸T或C。
10.如权利要求7-9任一所述的一种黄颡鱼抗红头病性状相关的SNP标记筛选方法在黄颡鱼红头病性状相关的SNP标记筛选中的应用。
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