[发明专利]与油茶种仁油中亚麻酸含量相关的SNP分子标记及其应用有效
申请号: | 202010442392.2 | 申请日: | 2020-05-22 |
公开(公告)号: | CN111455091B | 公开(公告)日: | 2023-05-12 |
发明(设计)人: | 林萍;常君;王开良 | 申请(专利权)人: | 中国林业科学研究院亚热带林业研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 | 代理人: | 黄爽 |
地址: | 311400 浙*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 油茶 种仁 亚麻 含量 相关 snp 分子 标记 及其 应用 | ||
1.与油茶种子亚麻酸含量相关的SNP分子标记组合,其特征在于,所述分子标记组合由标记PB.70158.1-473、PB.70158.1-649、PB.70158.1-704和PB.70158.1-707以及标记PB.102493.1-527、PB.103936.1-364、PB.10862.1-1402、PB.14705.1-426、PB.18953.1-793、PB.22228.2-2299、PB.24874.2-147、PB.26169.1-190、PB.28575.1-517、PB.34783.2-2214、PB.35363.2-2268、PB.3873.1-32、PB.46307.1-770、PB.47164.1-980、PB.50731.1-672、PB.50731.1-680、PB.5358.1-2661、PB.54042.1-2426、PB.54042.1-2477、PB.57367.1-207、PB.63477.1-1109、PB.63477.1-1163、PB.63477.1-1166、PB.67182.2-1418、PB.67876.1-630、PB.70158.1-1025、PB.70158.1-187、PB.70158.1-306、PB.70158.1-314、PB.70158.1-408、PB.70158.1-413、PB.70158.1-778、PB.70158.1-854、PB.70158.1-930、PB.70158.1-935、PB.73485.1-510、PB.76712.1-959、PB.78861.1-470、PB.80962.1-1163、PB.8223.1-569、PB.8694.1-1090、PB.96124.1-1263和PB.9959.4-583组成;
其中,标记PB.102493.1-527含有油茶如SEQ ID NO:61所示序列第527bp处的多态性为T/C的核苷酸序列;
标记PB.103936.1-364含有油茶如SEQ ID NO:62所示序列第364bp处的多态性为G/T的核苷酸序列;
标记PB.10862.1-1402含有油茶如SEQ ID NO:63所示序列第1402bp处的多态性为C/T的核苷酸序列;
标记PB.14705.1-426含有油茶如SEQ ID NO:64所示序列第426bp处的多态性为A/G的核苷酸序列;
标记PB.18953.1-793含有油茶如SEQ ID NO:65所示序列第793bp处的多态性为T/C的核苷酸序列;
标记PB.22228.2-2299含有油茶如SEQ ID NO:66所示序列第2299bp处的多态性为C/T的核苷酸序列;
标记PB.24874.2-147含有油茶如SEQ ID NO:67所示序列第147bp处的多态性为G/A的核苷酸序列;
标记PB.26169.1-190含有油茶如SEQ ID NO:68所示序列第190bp处的多态性为T/C的核苷酸序列;
标记PB.28575.1-517含有油茶如SEQ ID NO:69所示序列第517bp处的多态性为G/A的核苷酸序列;
标记PB.34783.2-2214含有油茶如SEQ ID NO:70所示序列第2214bp处的多态性为T/C的核苷酸序列;
标记PB.35363.2-2268含有油茶如SEQ ID NO:71所示序列第2268bp处的多态性为A/C的核苷酸序列;
标记PB.3873.1-32含有油茶如SEQ ID NO:72所示序列第32bp处的多态性为G/A的核苷酸序列;
标记PB.46307.1-770含有油茶如SEQ ID NO:73所示序列第770bp处的多态性为A/C的核苷酸序列;
标记PB.47164.1-980含有油茶如SEQ ID NO:74所示序列第980bp处的多态性为G/T的核苷酸序列;
标记PB.50731.1-672含有油茶如SEQ ID NO:75所示序列第672bp处的多态性为C/T的核苷酸序列;
标记PB.50731.1-680含有油茶如SEQ ID NO:75所示序列第680bp处的多态性为A/G的核苷酸序列;
标记PB.5358.1-2661含有油茶如SEQ ID NO:76所示序列第2661bp处的多态性为A/C的核苷酸序列;
标记PB.54042.1-2426含有油茶如SEQ ID NO:77所示序列第2426bp处的多态性为T/C的核苷酸序列;
标记PB.54042.1-2477含有油茶如SEQ ID NO:77所示序列第2477bp处的多态性为G/T的核苷酸序列;
标记PB.57367.1-207含有油茶如SEQ ID NO:78所示序列第207bp处的多态性为G/C的核苷酸序列;
标记PB.63477.1-1109含有油茶如SEQ ID NO:79所示序列第1109bp处的多态性为A/G的核苷酸序列;
标记PB.63477.1-1163含有油茶如SEQ ID NO:79所示序列第1163bp处的多态性为G/A的核苷酸序列;
标记PB.63477.1-1166含有油茶如SEQ ID NO:79所示序列第1166bp处的多态性为A/C的核苷酸序列;
标记PB.67182.2-1418含有油茶如SEQ ID NO:80所示序列第1418bp处的多态性为A/G的核苷酸序列;
标记PB.67876.1-630含有油茶如SEQ ID NO:81所示序列第630bp处的多态性为C/T的核苷酸序列;
标记PB.70158.1-1025含有油茶如SEQ ID NO:82所示序列第1025bp处的多态性为C/T的核苷酸序列;
标记PB.70158.1-187含有油茶如SEQ ID NO:82所示序列第187bp处的多态性为A/G的核苷酸序列;
标记PB.70158.1-306含有油茶如SEQ ID NO:82所示序列第306bp处的多态性为C/T的核苷酸序列;
标记PB.70158.1-314含有油茶如SEQ ID NO:82所示序列第314bp处的多态性为A/G的核苷酸序列;
标记PB.70158.1-408含有油茶如SEQ ID NO:82所示序列第408bp处的多态性为T/G的核苷酸序列;
标记PB.70158.1-413含有油茶如SEQ ID NO:82所示序列第413bp处的多态性为T/A的核苷酸序列;
标记PB.70158.1-473含有油茶如SEQ ID NO:82所示序列第473bp处的多态性为C/G的核苷酸序列;
标记PB.70158.1-649含有油茶如SEQ ID NO:82所示序列第649bp处的多态性为A/G的核苷酸序列;
标记PB.70158.1-704含有油茶如SEQ ID NO:82所示序列第704bp处的多态性为G/A的核苷酸序列;
标记PB.70158.1-707含有油茶如SEQ ID NO:82所示序列第707bp处的多态性为A/C的核苷酸序列;
标记PB.70158.1-778含有油茶如SEQ ID NO:82所示序列第778bp处的多态性为C/T的核苷酸序列;
标记PB.70158.1-854含有油茶如SEQ ID NO:82所示序列第854bp处的多态性为A/C的核苷酸序列;
标记PB.70158.1-930含有油茶如SEQ ID NO:82所示序列第930bp处的多态性为C/G的核苷酸序列;
标记PB.70158.1-935含有油茶如SEQ ID NO:82所示序列第935bp处的多态性为T/G的核苷酸序列;
标记PB.73485.1-510含有油茶如SEQ ID NO:83所示序列第510bp处的多态性为C/G的核苷酸序列;
标记PB.76712.1-959含有油茶如SEQ ID NO:84所示序列第959bp处的多态性为T/C的核苷酸序列;
标记PB.78861.1-470含有油茶如SEQ ID NO:85所示序列第470bp处的多态性为T/C的核苷酸序列;
标记PB.80962.1-1163含有油茶如SEQ ID NO:86所示序列第1163bp处的多态性为T/C的核苷酸序列;
标记PB.8223.1-569含有油茶如SEQ ID NO:87所示序列第569bp处的多态性为T/A的核苷酸序列;
标记PB.8694.1-1090含有油茶如SEQ ID NO:88所示序列第1090bp处的多态性为T/C的核苷酸序列;
标记PB.96124.1-1263含有油茶如SEQ ID NO:89所示序列第1263bp处的多态性为T/C的核苷酸序列;
标记PB.9959.4-583含有油茶如SEQ ID NO:90所示序列第583bp处的多态性为T/C的核苷酸序列。
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