[发明专利]与油茶种子油脂中棕榈油酸含量相关的SNP分子标记及其应用

权利要求书

1.与油茶种子油脂中棕榈油酸含量相关的SNP分子标记，其特征在于，所述SNP分子标记为PB.10070.2-202或PB.7527.1-77；

其中，SNP分子标记PB.10070.2-202的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，其中第202位的多态性为G/A；SNP分子标记PB.7527.1-77的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示，其中第77位的多态性为G/A。

2.根据权利要求1所述的SNP分子标记，其特征在于，所述SNP分子标记PB.10070.2-202中，具有所述多态性的位点的基因型为AA，对应于高棕榈油酸含量，基因型为GG，对应于低棕榈油酸含量；

所述SNP分子标记PB.7527.1-77中，具有所述多态性的位点的基因型为AA，对应于高棕榈油酸含量，基因型为GG或GA，对应于低棕榈油酸含量。

3.与油茶种子油脂中棕榈油酸含量相关的SNP分子标记组合，其特征在于，所述SNP分子标记组合为PB.10070.2-202和PB.7527.1-77；

其中，标记PB.10070.2-202和PB.7527.1-77同权利要求1或2中所述。

4.用于扩增权利要求1或2所述的SNP分子标记或权利要求3所述的SNP分子标记组合的引物。

5.根据权利要求4所述的引物，其特征在于，包括如SEQ ID NO.3-4和/或SEQ ID NO.5-6所示的引物。

6.含有权利要求4或5所述的引物的试剂或试剂盒。

7.权利要求1或2所述的SNP分子标记或权利要求3所述的SNP分子标记组合或权利要求4或5所述的引物或权利要求6所述的试剂或试剂盒的以下任一应用：

（1）在鉴定油茶种子油脂中棕榈油酸含量表型中的应用；

（2）在油茶种质资源鉴定、改良或分子标记辅助育种中的应用，所述种质资源鉴定、改良或分子标记辅助育种的性状为种子油脂中的棕榈油酸含量；

（3）在油茶种子油脂中棕榈油酸含量早期预测中的应用；

（4）在筛选高棕榈油酸含量油茶中的应用。

8.鉴定油茶种子油脂中棕榈油酸含量表型的方法，其特征在于，包括：

（1）提取待鉴定油茶的总RNA，反转录合成cDNA；

（2）以cDNA为模板，利用SEQ ID NO.3-4和/或SEQ ID NO.5-6所示引物进行PCR扩增；

（3）分析PCR扩增产物中权利要求1或2所述的SNP分子标记或权利要求3所述的SNP分子标记组合的基因型，根据所述基因型判断待鉴定油茶种子油脂中棕榈油酸含量表型。

9.根据权利要求8所述的方法，其特征在于，所述PCR扩增的反应程序为：94~95℃，3~5min；94~95℃，15~30s，65~69℃，40~60s，38~45个循环；67~70℃，3~6min。

10.根据权利要求8或9所述的方法，其特征在于，步骤（3）中所述判断待鉴定油茶种子油脂中棕榈油酸含量表型的方法如下：

若SNP分子标记PB.10070.2-202具有所述多态性的位点的基因型为AA，则待鉴定油茶为高棕榈油酸含量，若基因型为GG，则待鉴定油茶为低棕榈油酸含量；和/或，

若SNP分子标记PB.7527.1-77具有所述多态性的位点的基因型为AA，则待鉴定油茶为高棕榈油酸含量，若基因型为GG或GA，则待鉴定油茶为低棕榈油酸含量。