[发明专利]一组早期食管鳞状细胞癌筛查标志物及其在探针试剂盒中的应用

说明书

本发明属于生物工程及生物医药技术领域，具体涉及肿瘤学领域，更具体涉及一组早期食管鳞状细胞癌筛查标志物及其在引物探针试剂盒中的应用。本发明提供了检测SLAMF1、CRIM、CCSER1、MGARP、POMK基因的引物组合物和探针组合物，并利用该引物组合物和探针组合物制备检测早期食管鳞状细胞癌的试剂盒。利用本发明试剂盒对早期食管鳞状细胞癌的检测敏感度达82.11%，特异度达86.99%，适用于对食管鳞状细胞癌高发区无症状人群进行早期食管鳞状细胞癌的大规模筛查。

技术领域

本发明属于生物工程及生物医药技术领域，具体涉及肿瘤学领域，更具体涉及一组早期食管鳞状细胞癌筛查标志物及其在引物探针试剂盒中的应用。

背景技术

食管鳞状细胞癌是全球最常见的恶性肿瘤之一，死亡率位居第六位，全球每年新发约50万例食管鳞状细胞癌患者中一半以上发生在中国，比西方国家发病率高100倍。与西方人群显著不同，中国人食管鳞状细胞癌突出的流行病学特征是显著的地域性分布差异和明显的家族聚集性。河南、河北和山西三省交界的太行山区，河南林州是国内也是世界上食管鳞状细胞癌发病率和死亡率最高的地区。中西方食管鳞状细胞癌的组织学类型和流行性特征明显不同导致中西方学者关注的科学问题和研究思路明显不同，研究成果相互借鉴和共享困难。食管鳞状细胞癌预后极差，中晚期食管鳞状细胞癌患者5年生存率仅15%左右，而早期食管鳞状细胞癌患者的5年生存率为90%左右。尽管早期食管鳞状细胞癌5年生存率明显高于中晚期，但临床上首次确诊的患者中，早期癌仅占5%左右。因此提高早期食管鳞状细胞癌的诊断率极其重要。由于食管鳞状细胞癌患者在早期阶段缺乏明显的特异症状，并且缺乏适宜大范围高危人群筛查的经济、高效和敏感的生物标志物，导致目前临床上就诊的食管鳞状细胞癌患者在确诊时多已为中晚期阶段。目前，色素内镜和粘膜活检病理检查是食管鳞状细胞癌早期发现的重要筛查方法。但是，因内镜筛查有创伤，且成本高，效率低，限制了内镜筛查在无症状人群食管鳞状细胞癌早发现中的推广。食管鳞状细胞癌早期发现，是提高食管鳞状细胞癌患者生存率的有效手段，因此筛选高效、特异的食管鳞状细胞癌分子标志物对于食管鳞状细胞癌患者的早期发现、早期筛查尤为重要，也是亟待解决的问题。

发明人所在研究机构35年来搜集了30余万例食管鳞状细胞癌患者相关信息，利用分子机制筛选食管鳞状细胞癌特异标志物，建立高危人群和食管鳞状细胞癌早期发现的分子标志物筛查体系，并在此基础上进行分子标志物筛选，通过发明人所在研究机构近期开展的全外显子组测序（wholeexomesequencing,WES）有关研究，将700余例食管鳞状细胞癌患者以及健康志愿者进行全基因组外显子区域DNA捕获富集后进行高通量测序，发现数种与食管鳞状细胞癌的发生相关的基因，并将这些基因在食管鳞状细胞癌高发区8000余例无症状人群中进行验证，最终筛选出了可用于高危人群早期食管鳞状细胞癌筛查的五个基因标志物，这五种基因标志物为SLAMF1、CRIM、CCSER1、MGARP和POMK基因，这五种针对食管鳞状细胞癌早期病变有关的基因作为早期诊断指标，对于提高早期食管鳞状细胞癌的发现率，降低食管鳞状细胞癌的死亡率具有重要意义。此外，本发明将筛选出的早期食管鳞状细胞癌分子标志物制成试剂盒，应用于高危人群早期食管鳞状细胞癌的筛查，可以提高早期食管鳞状细胞癌的发现率。因此，开发一种便于对高危人群进行患食管鳞状细胞癌风险检测的试剂盒具有重要意义。

发明内容

本发明的目的在于提供一组早期食管鳞状细胞癌筛查标志物及其在探针试剂盒中的应用。

基于上述目的，本发明采用如下技术方案：

本发明提供了一组可以有效区分早期食管鳞状细胞癌的分子标志物，该分子标志物包括SLAMF1、CRIM、CCSER1、MGARP、POMK基因。

本发明还提供了一种上述分子标志物的检测试剂在制备早期食管鳞状细胞癌筛查试剂盒中的应用。

根据上述应用，优选地，检测试剂包括检测SLAMF1、CRIM、CCSER1、MGARP、POMK基因的引物组合物和探针组合物。