[发明专利]一种肿瘤免疫治疗疗效预测的列线图模型的建立方法有效

专利信息
申请号: 202010488186.5 申请日: 2020-06-01
公开(公告)号: CN111863159B 公开(公告)日: 2022-02-25
发明(设计)人: 姚和瑞;余运芳;胡海;李志花;李岸霖;区绮云;陈勇健 申请(专利权)人: 中山大学孙逸仙纪念医院
主分类号: G16H10/20 分类号: G16H10/20;G16H50/20;G16H50/30;G16B30/00;G16B20/50;G16B40/00
代理公司: 广州三环专利商标代理有限公司 44202 代理人: 颜希文
地址: 510030 广东省广州市*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 一种 肿瘤 免疫 治疗 疗效 预测 线图 模型 建立 方法
【权利要求书】:

1.一种肿瘤免疫治疗疗效预测的列线图模型的建立方法,其特征在于,所述建立方法包括如下步骤:

S1、收集非小细胞肺癌患者基因突变和临床特征数据;

S2、将其中频繁突变的基因与患者的总生存期通过COX回归模型进行生存相关性分析,得到与非小细胞肺癌免疫治疗疗效相关的基因;

S3、将临床特征数据与患者的总生存期通过COX回归模型进行生存相关性分析,得到与非小细胞肺癌免疫治疗疗效相关的临床特征;

S4、将步骤S2筛选得到的基因与步骤S3筛选得到临床特征共同构建非小细胞肺癌免疫治疗疗效预测的列线图模型;

所述步骤S2中筛选得到的非小细胞肺癌免疫治疗疗效相关的基因为TP53、KEAP1和ATM;所述步骤S3中筛选得到的非小细胞肺癌免疫治疗疗效相关的临床特征包括性别、种族、ECOG-PS评分、病理、肿瘤转移数目、肿瘤最长直径、PD-L1表达情况和最佳反应疗效;

所述方法还包括通过用R软件中的survminer包运算得到截值点的步骤和对所述模型进行验证的步骤;

所述模型包括列线图,所述列线图包括列线图A、列线图B和列线图C;所述列线图A、列线图B和列线图C的建立方法包括以下步骤:

(1)由种族、性别、病理学诊断、ECOG-PS评分、SLD和肿瘤转移情况这6个临床特征与TP53、KEAP1和ATM这3个血肿瘤突变基因,通过COX回归模型方法对OAK队列数据进行分析,共同构建得到列线图A;

(2)在列线图A模型的基础上添加PD-L1表达量为预测因素,所述PD-L1表达量以50%为界,通过COX回归模型方法对OAK队列数据进行分析,进行构建得到列线图 B;

(3)在列线图 B模型的基础上考虑患者最佳疗效反应因素下,通过COX回归模型方法OAK队列数据进行分析,进行构建得到列线图C模型;

所述列线图A中,第一行为分值标尺,分值范围为0~100;第二行为种族,若为亚裔9分,非亚裔50分;第三行为性别,女性38分,男性43分;第四行为病理,若为非肺腺癌30分,否则为75分;第五行为ECOG-PS,0对应标尺7分, 1对应标尺60分;第六行为肿瘤最长径,100标尺对应30分,100~150标尺对应65分,150标尺对应100分;第七行为转移数目,1对应标尺20分,2~3对应标尺39分,3对应标尺56分;第八行为TP53,野生型对应标尺32分,突变对应标尺50分;第九行为KEAP1,野生型对应标尺33分,突变对应标尺90分;第十行为ATM,突变对应标尺0分,野生型对应标尺46分;第十一行为总分值,范围为200~550,第十二行为总生存期大于1年的生存几率,范围为0.1~0.94,第十三行为总生存期大于2年的生存几率,范围为0.3~0.997;

所述列线图B中,第一行为分值标尺,分值范围为0~100;第二行为种族,若为亚裔5分,非亚裔50分;第三行为性别,女性39.5分,男性41分;第四行为病理,若为非肺腺癌27分,否则为77分;第五行为ECOG-PS,0对应标尺3分, 1对应标尺60分;第六行为肿瘤最长径,100标尺对应29分,100~150标尺对应64分,150标尺对应100分;第七行为转移数目,1对应标尺20分,2~3对应标尺38分,3对应标尺55分;第八行为PD-L1,TC3或IC3为20分,TC0/1/2和IC0/1/2为44分;第九行为TP53,野生型对应标尺30.5分,突变对应标尺50分;第十行为KEAP1,野生型对应标尺32分,突变对应标尺91分;第十一行为ATM,突变对应标尺0分,野生型对应标尺43分;第十二行为总分值,范围为200~550,第十三行为总生存期大于1年的生存几率,范围为0.1~0.94,第十四行为总生存期大于2年的生存几率,范围为0.3~0.997;

所述列线图C中,第一行为分值标尺,分值范围为0~100;第二行为列线图B总分,范围为200~550,200对应标尺19分,500对应标尺100分,期间分数平均分布;第三行为最佳疗效反应,CR为0分,PR为27分,SD为52分,PD为78分;第四行为总分值,范围为0~200,第五行为总生存期大于1年的生存几率,范围为0.015~0.99,第六行为总生存期大于2年的生存几率,范围为0.05~1。

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