[发明专利]无核酸扩增的ALDH2基因G1510A位点分型方法及所用探针和反应体系有效
申请号: | 202010489191.8 | 申请日: | 2020-06-02 |
公开(公告)号: | CN111549120B | 公开(公告)日: | 2023-05-09 |
发明(设计)人: | 陈志君;金芬芬 | 申请(专利权)人: | 杭州盾恩医学检验实验室有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12Q1/6827;C12N15/11 |
代理公司: | 杭州中成专利事务所有限公司 33212 | 代理人: | 金祺 |
地址: | 311231 浙江省杭州市萧山区经济技术开发区科技城区*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 核酸 扩增 aldh2 基因 g1510a 位点分型 方法 所用 探针 反应 体系 | ||
1.无核酸扩增的ALDH2基因G1510A位点分型方法所用的反应探针,其特征是:由野生型探针和突变型探针组成;
野生型探针为WT1、uni,突变型探针为MT1、uni,
WT1:5’GGTCCCACACTCACAGTTTTCACTT
uni:5’AGTGTATGCCTGCAGCCCGTACTCGC 3’,在探针5’端磷酸化修饰,在探针3’端标记淬灭基团;
MT1:5’GGTCCCACACTCACAGTTTTCACTT
2.根据权利要求1所述的反应探针,其特征是:
所述荧光基团为以下任一:FAM、TET、J0E、HEX、Cy3、TAMRA、R0X;
所述淬灭基团为以下任一:Dabcyl、BHQ-1、BHQ-2。
3.包含如权利要求1或2所述反应探针的检测体系,其特征是:包括作为模板的待测DNA、10X反应缓冲液、WT1探针、MT1探针、Uni探针、耐高温的DNA连接酶。
4.根据权利要求3所述的检测体系,其特征是:耐高温的DNA连接酶为耐热DNA连接酶。
5.利用如权利要求3或4所述体系进行的无核酸扩增的ALDH2基因G1510A位点分型的非疾病诊断或治疗的方法,其特征是:
每个待测DNA作为模板分别设定使用野生型探针的野生型检测体系、以及使用突变型探针的突变型检测体系;
野生型检测体系/突变型检测体系分别于荧光定量PCR仪上,进行如下程序:
于起始时收集荧光值,且于所需个数的循环结束时收集荧光值;
依次进行以下步骤:
步骤1、首先判定反应结果,任选以下一种方法:
方法一、
当10个循环后的荧光相对值<95%,反应结果属于阳性;
当10个循环后的荧光相对值≥95%,不做判断,需要等到40个循环后按照方法二再进行判断;
方法二、
当40个循环后的荧光相对值<80%,反应结果属于阳性;
当40个循环后的荧光相对值>90%,反应结果属于阴性;
80%≤当40个循环后的荧光相对值≤90%,反应结果属于临界区间;
方法一、方法二中,荧光相对值=循环后对应的荧光值/起始荧光值;
步骤2、最终结果判读:
当野生型检测体系的反应结果为阳性、且突变型检测体系的反应结果为阴性时,判定该该待测DNA属于纯合野生型;
当野生型检测体系的反应结果为阳性、且突变型检测体系的反应结果为阳性时,判定该该待测DNA属于杂合型;
当野生型检测体系的反应结果为阴性、且突变型检测体系的反应结果为阳性时,判定该该待测DNA属于纯合突变型;
当野生型检测体系、突变型检测体系中只要有一个的反应结果属于临界区间时,或者当野生型检测体系和突变型检测体系的反应结果均为阴性时,判定需要对该待测DNA重新进行检测。
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