[发明专利]一种基于复合微单倍型焦磷酸测序图谱解析的法医学混合DNA的分析方法有效

专利信息
申请号: 202010493118.8 申请日: 2020-06-03
公开(公告)号: CN111667883B 公开(公告)日: 2021-01-22
发明(设计)人: 张霁;代号;王玉芳;曹悦岩;宋凤;罗海玻;陈晓刚 申请(专利权)人: 四川大学
主分类号: G16B25/20 分类号: G16B25/20;G16B30/00;C12Q1/6869
代理公司: 北京高沃律师事务所 11569 代理人: 瞿晓晶
地址: 610041 四*** 国省代码: 四川;51
权利要求书: 查看更多 说明书: 查看更多
摘要:
搜索关键词: 一种 基于 复合 微单倍型焦 磷酸 图谱 解析 法医学 混合 dna 分析 方法
【权利要求书】:

1.一种基于复合微单倍型焦磷酸测序图谱解析的法医学混合DNA的分析方法,其特征在于,包括以下步骤:

1)提取样本的DNA,得到样本DNA;

2)对所述步骤1)得到的样本DNA进行荧光定量,得到定量样本DNA,将所述定量样本DNA进行PCR,得到PCR产物;

3)对所述步骤2)得到的PCR产物进行焦磷酸测序,分别得到每个微单倍型的基因分型结果;

4)使用AdvISER-M-PYRO算法对步骤3)得到的每个微单倍型的基因分型结果进行解析,得到微单倍型的基因分型结果、贡献者构成、贡献系数和相关系数;

5)使用支持向量机算法对步骤3)得到的微单倍型的基因分型结果进行分类,得到每个微单倍型的基因分型构成,得到每个混合DNA的贡献者构成;

所述步骤2)PCR使用的引物包括SEQ ID No.1~8所示的核苷酸序列;所述SEQ ID No.1~2扩增微单倍型mh03ZJ-001;所述SEQ ID No.3~4扩增微单倍型mh06ZJ-001;所述SEQ IDNo.5~6扩增微单倍型mh07ZJ-001;所述SEQ ID No.7~8扩增微单倍型mh19ZJ-001;

所述步骤3)焦磷酸测序使用的引物包括SEQ ID No.9~12所示的核苷酸序列;所述SEQID No.9测序微单倍型mh03ZJ-001;所述SEQ ID No.10测序微单倍型mh06ZJ-001;所述SEQID No.11测序微单倍型mh07ZJ-001;所述SEQ ID No.12测序微单倍型mh19ZJ-001。

2.根据权利要求1所述的分析方法,其特征在于,所述步骤3)焦磷酸测序,当所述PCR产物中仅含有微单倍型mh03ZJ-001时,所述焦磷酸测序的体系每50μl包括:2×GoTaqColorless Master Mix 25μl、浓度为10μM的SEQ ID No.91.2μl、无核酸酶水21.8μl和浓度为5ng/μL的PCR产物2μl。

3.根据权利要求1所述的分析方法,其特征在于,所述步骤3)焦磷酸测序,当所述PCR产物中仅含有微单倍型mh06ZJ-001时,所述焦磷酸测序的体系每50μl包括:2×GoTaqColorless Master Mix 25μl、浓度为10μM的SEQ ID No.101μl、无核酸酶水22μl和浓度为5ng/μL的PCR产物2μl。

4.根据权利要求1所述的分析方法,其特征在于,所述步骤3)焦磷酸测序,当所述PCR产物中仅含有微单倍型mh07ZJ-001时,所述焦磷酸测序的体系每50μl包括:2×GoTaqColorless Master Mix 25μl、浓度为10μM的SEQ ID No.111.4μl、无核酸酶水21.6μl和浓度为5ng/μL的PCR产物2μl。

5.根据权利要求1所述的分析方法,其特征在于,所述步骤3)焦磷酸测序,当所述PCR产物中仅含有微单倍型mh19ZJ-001时,所述焦磷酸测序的体系每50μl包括:2×GoTaqColorless Master Mix 25μl、浓度为10μM的SEQ ID No.120.8μl、无核酸酶水22.2μl和浓度为5ng/μL的PCR产物2μl。

6.根据权利要求2~5任一项所述的分析方法,其特征在于,制备焦磷酸测序使用的模板的程序为:预变性95℃2min;Touchdown阶段95℃30s,71℃45s,72℃30s,20个循环,每一个循环71℃下降0.5℃;循环扩增阶段95℃30s,61℃45s,72℃30s,25个循环;终延伸72℃5min。

下载完整专利技术内容需要扣除积分,VIP会员可以免费下载。

该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于四川大学,未经四川大学许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服

本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/202010493118.8/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。

同类专利
专利分类
×

专利文献下载

说明:

1、专利原文基于中国国家知识产权局专利说明书;

2、支持发明专利 、实用新型专利、外观设计专利(升级中);

3、专利数据每周两次同步更新,支持Adobe PDF格式;

4、内容包括专利技术的结构示意图流程工艺图技术构造图

5、已全新升级为极速版,下载速度显著提升!欢迎使用!

请您登陆后,进行下载,点击【登陆】 【注册】

关于我们 寻求报道 投稿须知 广告合作 版权声明 网站地图 友情链接 企业标识 联系我们

钻瓜专利网在线咨询

周一至周五 9:00-18:00

咨询在线客服咨询在线客服
tel code back_top