[发明专利]一种与猪肌纤维类型相关的lncRNA标志物及其应用

权利要求书

1.一种与猪肉肌纤维类型相关的lncRNA标志物的检测引物，其特征在于，所述的lncRNA标志物为LincRNA-ROMT，其序列如SEQ ID NO：1所示；

所述检测引物为：

LincRNA-ROMT的上游引物序列为：5′-TTGGACACCTGGGCTTGGATAAT-3′；

LincRNA-ROMT的下游引物序列为：5′-TCTGGCAGAGTGGGTTGGATGAG-3′。

2.权利要求1所述的检测引物在遗传标记辅助氧化型肌纤维类型猪和/或酵解型肌纤维类型猪育种中的应用，其特征在于：

权利要求1中所述的LincRNA-ROMT在氧化型肌纤维类型猪肌肉组织中低表达，在酵解型肌纤维类型猪肌肉组织中高表达。

3.权利要求1所述的检测引物在制备遗传标记辅助氧化型肌纤维类型猪和/或酵解型肌纤维类型猪育种的试剂盒中的应用，其特征在于：

权利要求1中所述的LincRNA-ROMT在氧化型肌纤维类型猪肌肉组织中低表达，在酵解型肌纤维类型猪肌肉组织中高表达。

4.一种检测与猪肉肌纤维类型相关的lncRNA标志物的试剂盒，其特征在于含有权利要求1所述的lncRNA标志物的检测引物；

所述的lncRNA标志物为LincRNA-ROMT，其序列如SEQ ID NO：1所示。

5.根据权利要求4所述的试剂盒，其特征在于：

所述的试剂盒还含有针对所述LincRNA-ROMT的反转录试剂、特异性引物、内参引物、荧光定量PCR反应液。

6.根据权利要求5所述的试剂盒，其特征在于：

所述的内参引物包括GAPDH内参基因的上游引物和下游引物，上游引物序列为SEQ IDNO：4，下游引物序列为 SEQ ID NO：5。

7.权利要求4～6任一项所述的试剂盒在猪肌肉组织中LincRNA-ROMT的定量检测中的应用，其特征在于：

所述的LincRNA-ROMT的序列如SEQ ID NO：1所示。

8.一种检测与猪肉肌纤维类型相关的lncRNA标志物的方法，其特征在于，所述的lncRNA标志物为LincRNA-ROMT，其序列如SEQ ID NO：1所示；

所述方法包括如下步骤：

1）提取猪肌肉组织总RNA；

2）通过反转录随机引物在反转录酶的作用下将LincRNA-ROMT反转录成cDNA；

3）采用权利要求1所述的检测引物在荧光实时定量PCR仪上将步骤2）获得的cDNA进行扩增检测；

4）通过溶解曲线分析，2^-ΔΔCt法进行相对定量。