[发明专利]一种与胃腺癌发生发展相关的生物标志物有效
申请号: | 202010499024.1 | 申请日: | 2020-06-04 |
公开(公告)号: | CN111424096B | 公开(公告)日: | 2020-11-17 |
发明(设计)人: | 董东;郑骏年;宁倩倩;李曼 | 申请(专利权)人: | 徐州医科大学 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886 |
代理公司: | 北京预立生科知识产权代理有限公司 11736 | 代理人: | 孟祥斌 |
地址: | 221004 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 胃腺 发生 发展 相关 生物 标志 | ||
本发明公开了一种与胃腺癌发生发展相关的生物标志物,本发明通过高通量测序技术结合生物信息学分析首次发现了RP11‑320G24.1在胃癌患者中表达上调,并通过QPCR进一步验证了RP11‑320G24.1为差异表达基因,提示RP11‑320G24.1可作为生物标志物应用于胃癌的诊断和治疗。
技术领域
本发明属于生物医药领域,涉及一种与胃腺癌发生发展相关的生物标志物。
背景技术
胃癌(gastric cancer,GC)是消化系统中常见的一种恶性肿瘤,有着很高的发病率和病死率,全球每年新发胃癌病例约100万例,严重威胁人体健康和生命质量。虽然现在我们在胃癌的临床治疗及基础研究方面取得了一些进步,但是多种因素参与胃癌的发生发展,其发病机制十分复杂,有许多问题仍有待阐明。找到有效调控胃癌发生发展的重要分子可以指导研发临床胃癌分子诊断及分子靶向药物,还需要深入研究探讨。
人类基因组测序结果分析表明,全基因组中70%-90%基因进行转录,但只有不到2%基因最终翻译为蛋白,剩下的绝大部分转录本被命名为非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)(TayY,Rinn J,Pandolfi PP.The multilayered complexity of ceRNA crosstalkand competition.Nature.2014;505(7483):344-52.)。其中含有小于200个核苷酸的微小RNA(microRNA,miRNA)和大于200个核苷酸的长链非编码RNA(long non-coding RNA,1ncRNA)。目前,关于miRNA功能研究已有大量结果,1ncRNA也成为现今的研究热点。
1ncRNA,多数由RNA聚合酶II(RNA polymerase II,RNAPII)转录生成,不能编码蛋白,但是生物学功能非常复杂,可以调节转录、翻译、表观遗传修饰等多个层面。目前发现1ncRNA参与多种疾病的发生发展,其对肿瘤的调控作用是当今研究的热点。研究发现1ncRNA可调控包括肺癌、胃癌、肝癌、乳腺癌、前列腺癌在内的多种肿瘤。虽然近年来涌现出许多关于1ncRNA的研究以及相关数据库,但是大部分的1ncRNA的功能机制仍然不被人类所了解。1ncRNA是一个非常有前景的研究方向。研究胃癌与lncRNA的关系,对于实现胃癌的精准化诊断以及个性化治疗具有重要的意义。
发明内容
为了弥补现有技术的不足,本发明的目的之一,提供一种检测长链非编码RNARP11-320G24.1的产品,为实现胃癌的早期诊断提供基础。
本发明的目的之二,提供一种胃癌的诊断方法,通过检测lncRNA RP11-320G24.1的表达水平来诊断患者是否患有胃癌。
为了实现上述目的,本发明采用如下技术方案:
本发明提供了检测长链非编码RNA RP11-320G24.1的试剂在制备诊断胃癌的产品中的应用。
其中,RP11-320G24.1包括RP11-320G24.1基因及其同源物,突变,和同等型。该术语涵盖全长,未加工的RP11-320G24.1,以及源自细胞中加工的任何形式的RP11-320G24.1。该术语涵盖RP11-320G24.1的天然发生变体(例如剪接变体或等位变体)。该术语涵盖例如RP11-320G24.1基因,RP11-320G24.1的基因序列以及来自任何其它脊椎动物来源。目前公开的RP11-320G24.1存在两个转录本:ENST00000452690.1和ENST00000447570.1。在本发明的具体实施方式中,一种代表性的RP11-320G24.1序列如ENST00000452690.1所示。
熟悉本领域的技术人员可以了解,对测序结果进行生物信息学分析时,通常会将测序结果和已知的基因组进行比对,只要测序片段可以比对到相关的基因上,就可以看做是该基因的表达,因此,RP11-320G24.1的不同的转录产物同样包含在本发明中。
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