[发明专利]一种直扩型热启动DNA聚合酶及其制备方法与应用有效
申请号: | 202010503288.X | 申请日: | 2020-06-05 |
公开(公告)号: | CN111826366B | 公开(公告)日: | 2022-08-02 |
发明(设计)人: | 胡松青;黄丽芳;苑歆;刘光毅;何贤蓉;侯轶;樊壬水 | 申请(专利权)人: | 广州英赞生物科技有限公司 |
主分类号: | C12N9/12 | 分类号: | C12N9/12;C12N15/54;C12N15/70;C12N1/21;C12Q1/686;C12Q1/6851;C12R1/19 |
代理公司: | 广州市华学知识产权代理有限公司 44245 | 代理人: | 苏运贞 |
地址: | 510555 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 直扩型热 启动 dna 聚合 及其 制备 方法 应用 | ||
本发明公开了一种直扩型热启动DNA聚合酶及其制备方法与应用。本发明公开的直扩型热启动DNA聚合酶是野生型Taq DNA聚合酶经缺失、定点突变、融合非特异性双链DNA结合蛋白结构域生物突变,并用化学修饰改造而成。本发明直扩型热启动DNA聚合酶可大幅提高DNA聚合酶稳定性,可耐受高浓度的荧光染料和各种抑制剂,可应用于各种来源、组成复杂样本的直接PCR或qPCR检测,使得PCR相关反应和检测更加便利。本发明还公开了一种qPCR反应试剂盒,检测特异性高、荧光信号强,适用于低含量粗提取核酸的快速定量检测,可应用于食品掺杂、微生物检测、转基因植物筛查。
技术领域
本发明属于生物技术领域,具体涉及一种直扩型热启动DNA聚合酶及其制备方法与应用。
背景技术
实时荧光定量PCR(Quantitative Real-time PCR,qPCR)技术是在聚合酶链式反应(PCR)的基础上发展起来的,弥补了普通PCR不可以实时监测及定量的缺陷,成为了当今基因研究的重要工具。SYBR GreenΙ染料法qPCR技术以其成本低、重复性好、适用性强等优点广泛应用于医学研究、病原微生物检测和食品安全检测等诸多领域。
灵敏、精准一直是检测领域发展的需求及目标,SYBR GreenΙ染料法qPCR技术在应用于核酸检测的过程中,Taq DNA聚合酶的活性会受到样品或者样品提取过程中残留的qPCR抑制剂的干扰。如植物核酸样本中的多糖、血液核酸样本中的免疫球蛋白、土壤核酸样本中的腐殖酸等都会抑制Taq DNA聚合酶活性,从而影响qPCR检测的特异性、荧光信号及灵敏度,造成结果的不可靠和不准确。
Taq DNA聚合酶作为qPCR反应的核心组分,具有超强的耐热性和聚合酶活性,其性能直接决定了qPCR检测的速度、特异性及结果的可靠性。热启动DNA聚合酶可在PCR反应前封闭DNA聚合酶的活性,使得PCR反应开始时才释放其活性,可大幅度减少非特异性扩增及引物二聚的形成,是目前qPCR试剂的主要成分。近年来,涌现了多种耐抑制剂的、可以直接对粗样样品进行PCR扩增的Taq DNA聚合酶。但当前的直扩Taq DNA聚合酶可耐受的粗样样品量少,当样本中检测目标含量低时,容易导致假阴性结果(如病毒或细菌感染初期时的样本检测),且仅适用于普通PCR。用于粗样直接qPCR检测的Taq DNA聚合酶需要更强的耐抑制剂能力,以便在高浓度抑制剂和高浓度染料存在下,保证qPCR检测的特异性及结果的可靠性。因此,亟需研究开发一种用于qPCR的高性能热启动DNA聚合酶。
发明内容
本发明的首要目的在于克服现有技术的缺点与不足,提供一种直扩型热启动DNA聚合酶。
本发明的另一目的在于提供上述直扩型热启动DNA聚合酶的制备方法。
本发明的再一目的在于提供上述直扩型热启动DNA聚合酶的应用。
本发明的目的通过如下技术方案实现:
一种直扩型热启动DNA聚合酶,其氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示。
所述的直扩型热启动DNA聚合酶与NCBI登录号为P19821.1的野生型TaqDNA聚合酶的氨基酸序列相比,具有以下特点:1~289位氨基酸缺失,626位谷氨酸突变为精氨酸,707位异亮氨酸突变为亮氨酸,708位谷氨酸突变为精氨酸,且N末端融合了双链DNA结合蛋白。
所述的双链结合蛋白优选为氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示的Sso7d。双链结合蛋白可以显著提高DNA聚合酶对模板DNA的亲和力。
编码上述直扩型热启动DNA聚合酶的DNA分子。
所述的DNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示。该序列是根据大肠杆菌表达系统特点进行密码子优化而得,能显著提高异源基因在宿主菌中的表达效率。
一种重组表达载体,是将编码上述直扩型热启动DNA聚合酶的DNA分子克隆入表达载体得到。
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