[发明专利]冠心病患者死亡风险相关的DNA甲基化组合物及其筛选方法和用途有效
申请号: | 202010510421.4 | 申请日: | 2020-06-05 |
公开(公告)号: | CN111850108B | 公开(公告)日: | 2023-09-05 |
发明(设计)人: | 钟诗龙;陈慧;秦敏 | 申请(专利权)人: | 广东省人民医院 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12N15/11;G06F17/18;G16B5/00;G16B20/30;G16B20/40 |
代理公司: | 广州三环专利商标代理有限公司 44202 | 代理人: | 颜希文 |
地址: | 510080 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 冠心病 患者 死亡 风险 相关 dna 甲基化 组合 及其 筛选 方法 用途 | ||
1.甲基化标志物在制备冠心病生存预后风险的模型中的应用,其特征在于:
所述甲基化标志物由以下基因所对应的甲基化位点组成:chr3:101901234、SEMA3B、CORO2B、SLC39A8、chr7:27235733、chr10:3086002、chr2:164594200、RNASEH1、chr10:134897731、ABCA3、ZNF444、UBE2E2、DAZAP1、NAT10、DDAH1和FKBP5;
所述chr3:101901234所对应的甲基化位点为cg12992827;所述基因SEMA3B所对应的甲基化位点为cg12999941;所述基因CORO2B所对应的甲基化位点为cg03714754;所述基因SLC39A8所对应的甲基化位点为cg24524837;所述chr7:27235733所对应的甲基化位点为cg10643049;所述chr10:3086002所对应的甲基化位点为cg04833391;所述chr2:164594200所对应的甲基化位点为cg08280341;所述基因RNASEH1所对应的甲基化位点为cg12263535;所述chr10:134897731所对应的甲基化位点为cg06355908;所述基因ABCA3所对应的甲基化位点为cg21484914;所述基因ZNF444所对应的甲基化位点为cg09782621;所述基因UBE2E2所对应的甲基化位点为cg20015729;所述基因DAZAP1所对应的甲基化位点为cg00013733;所述基因NAT10所对应的甲基化位点为cg19045191;所述基因DDAH1所对应的甲基化位点为cg22211198;所述基因FKBP5所对应的甲基化位点为cg03546163;
所述模型为以下计算公式:
MRS=(公式3)
其中MRS为甲基化风险评分,根据所述模型获得甲基化风险评分的中位数,根据所述中位数评估冠心病患者生存预后风险;公式3中所述甲基化水平为以下基因所在位点的甲基化水平:chr3:101901234、SEMA3B、CORO2B、SLC39A8、chr7:27235733、chr10:3086002、chr2:164594200、RNASEH1、chr10:134897731、ABCA3、ZNF444、UBE2E2、DAZAP1、NAT10、DDAH1和FKBP5;
所述模型的数学表达式具体如下:MRS=cg00013733×(-0.217)+cg03714754×(-0.513)+cg04833391×(-0.520)+cg06355908×1.155+cg08280341×(-0.031)+cg09782621×(-0.382)+cg10643049×(-0.075)+cg12263535×0.328+cg12992827×(-0.168)+cg12999941×(-0.259)+cg20015729×0.313+cg21484914×0.326+cg24524837×0.538+cg19045191×0.224+cg22211198×0.277+cg03546163×(-0.269);根据所述模型获得的中位数为5.598,当MRS5.598时冠心病患者为高风险,生存显著差;当MRS≤5.598时冠心病患者为低风险,生存较好。
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